More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2682 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2682  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 278 aa  565  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.189349  normal  0.255718 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4016  enoyl-CoA hydratase  67.04 
 
 		 283 aa  375  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155086  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1204  enoyl-CoA hydratase  70.33 
 
 		 277 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7165  enoyl-CoA hydratase  63.57 
 
 		 283 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0279  enoyl-CoA hydratase  63.2 
 
 		 283 aa  362  4e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4071  enoyl-CoA hydratase  63.67 
 
 		 283 aa  360  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2114  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  66.17 
 
 		 269 aa  358  4e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4886  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.44 
 
 		 269 aa  358  5e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3834  enoyl-CoA hydratase  68.28 
 
 		 286 aa  358  6e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.532762 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3947  enoyl-CoA hydratase  68.28 
 
 		 286 aa  358  6e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0950827 
 
 
-
 
NC_003296  RS02010  enoyl-CoA hydratase  68.66 
 
 		 283 aa  357  9.999999999999999e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2200  enoyl-CoA hydratase  65.8 
 
 		 283 aa  352  4e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0179241  normal  0.0692381 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2692  enoyl-CoA hydratase  66.67 
 
 		 270 aa  350  2e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0591  enoyl-CoA hydratase  67.63 
 
 		 284 aa  348  4e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0825  enoyl-CoA hydratase  66.67 
 
 		 272 aa  343  2e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2182  enoyl-CoA hydratase  66.17 
 
 		 302 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1326  enoyl-CoA hydratase  65.77 
 
 		 268 aa  337  1.9999999999999998e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.63963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3619  enoyl-CoA hydratase  65.47 
 
 		 284 aa  334  7.999999999999999e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.397236 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4470  enoyl-CoA hydratase  64.07 
 
 		 285 aa  328  6e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0114118  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5040  enoyl-CoA hydratase  61.65 
 
 		 284 aa  328  6e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2277  enoyl-CoA hydratase  61.85 
 
 		 272 aa  327  9e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3177  enoyl-CoA hydratase  66.42 
 
 		 284 aa  322  5e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0869314  normal  0.884877 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5090  enoyl-CoA hydratase  63.67 
 
 		 270 aa  318  6e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2240  enoyl-CoA hydratase  65.38 
 
 		 267 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.121941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0495  enoyl-CoA hydratase  61.01 
 
 		 284 aa  311  9e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.227335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2158  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.55 
 
 		 277 aa  249  5e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83195  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5520  enoyl-CoA hydratase  44.23 
 
 		 275 aa  221  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.181326 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0995  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.92 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2482  enoyl-CoA hydratase  39.54 
 
 		 277 aa  149  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2697  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.43 
 
 		 261 aa  146  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000960685  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.93 
 
 		 269 aa  146  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0895373 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.11 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  35.08 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2490  enoyl-CoA hydratase  38.78 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.154881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2445  enoyl-CoA hydratase  38.78 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  32.95 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  32.31 
 
 		 263 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.25 
 
 		 270 aa  143  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  35.48 
 
 		 261 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  35.52 
 
 		 262 aa  142  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1741  enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 		 265 aa  142  8e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0980296  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  36.9 
 
 		 264 aa  142  9e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  35.34 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  32.57 
 
 		 263 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0298  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.11 
 
 		 262 aa  140  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  36.58 
 
 		 261 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.15 
 
 		 264 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  31.03 
 
 		 263 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  32.44 
 
 		 261 aa  137  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  36.68 
 
 		 264 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.74 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.39 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.82 
 
 		 259 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11500  enoyl-CoA hydratase  36.78 
 
 		 285 aa  136  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.708034  normal  0.0989201 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.19 
 
 		 266 aa  136  5e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1063  enoyl-CoA hydratase  36.72 
 
 		 266 aa  136  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2741  enoyl-CoA hydratase  37.02 
 
 		 276 aa  135  8e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411296 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0654  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.84 
 
 		 263 aa  135  9e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.33 
 
 		 264 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5626  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.85 
 
 		 265 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0759622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  35.82 
 
 		 264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  34.6 
 
 		 269 aa  133  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2719  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  34.56 
 
 		 270 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345596  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.23 
 
 		 266 aa  132  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1012  enoyl-CoA hydratase  34.57 
 
 		 264 aa  132  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0558214 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2452  enoyl-CoA hydratase  34.19 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00421789  hitchhiker  0.00869543 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2372  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.71 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00516706  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0802  enoyl-CoA hydratase  40.62 
 
 		 265 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.98 
 
 		 264 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.16 
 
 		 266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.868532  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.83 
 
 		 273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 		 268 aa  129  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2129  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.8 
 
 		 255 aa  129  6e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.135513  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  35.27 
 
 		 261 aa  129  7.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.21 
 
 		 266 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3990  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.1 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.592711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3608  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.78 
 
 		 268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 		 260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.83 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.538415 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.09 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1906  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.177848  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.98 
 
 		 273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0344  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 		 256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.458261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 		 259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3475  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 		 270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.82 
 
 		 259 aa  126  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  32.56 
 
 		 265 aa  126  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  31.15 
 
 		 263 aa  125  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2808  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 		 262 aa  125  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000172921  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2224  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  33.71 
 
 		 260 aa  125  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549039  hitchhiker  0.0000374036 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1457  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 		 287 aa  125  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.221294  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4537  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.96 
 
 		 261 aa  125  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.049531  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40980  enoyl-CoA hydratase  33.08 
 
 		 270 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 		 264 aa  125  7e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.48 
 
 		 265 aa  125  7e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.82 
 
 		 268 aa  125  7e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2069  enoyl-CoA hydratase  32.47 
 
 		 270 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0197302  normal  0.0807955 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  32.84 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  32.84 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>