More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0279 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0279  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
283 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7165  enoyl-CoA hydratase  97.53 
 
 
283 aa  570  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85548  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4071  enoyl-CoA hydratase  89.75 
 
 
283 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4886  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  72.12 
 
 
269 aa  419  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2114  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  75.84 
 
 
269 aa  414  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3834  enoyl-CoA hydratase  76.81 
 
 
286 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.532762 
 
 
-
 
NC_003296  RS02010  enoyl-CoA hydratase  74.91 
 
 
283 aa  410  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3947  enoyl-CoA hydratase  76.81 
 
 
286 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0950827 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2200  enoyl-CoA hydratase  70.7 
 
 
283 aa  391  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0179241  normal  0.0692381 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4016  enoyl-CoA hydratase  65.58 
 
 
283 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155086  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0591  enoyl-CoA hydratase  72.66 
 
 
284 aa  378  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5040  enoyl-CoA hydratase  70.68 
 
 
284 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4470  enoyl-CoA hydratase  70.7 
 
 
285 aa  375  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0114118  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3619  enoyl-CoA hydratase  72.66 
 
 
284 aa  376  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.397236 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2182  enoyl-CoA hydratase  70.33 
 
 
302 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3177  enoyl-CoA hydratase  72.89 
 
 
284 aa  368  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0869314  normal  0.884877 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2277  enoyl-CoA hydratase  67.16 
 
 
272 aa  367  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2692  enoyl-CoA hydratase  70.08 
 
 
270 aa  367  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0825  enoyl-CoA hydratase  71.97 
 
 
272 aa  363  2e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112976  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5090  enoyl-CoA hydratase  70.41 
 
 
270 aa  357  9.999999999999999e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194463  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1326  enoyl-CoA hydratase  68.06 
 
 
268 aa  350  1e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.63963  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2682  enoyl-CoA hydratase  63.2 
 
 
278 aa  345  5e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.189349  normal  0.255718 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0495  enoyl-CoA hydratase  66.92 
 
 
284 aa  339  2.9999999999999998e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.227335  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1204  enoyl-CoA hydratase  63.67 
 
 
277 aa  328  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2240  enoyl-CoA hydratase  68.82 
 
 
267 aa  323  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.121941  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2158  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.46 
 
 
277 aa  236  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83195  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5520  enoyl-CoA hydratase  44.4 
 
 
275 aa  225  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.181326 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0995  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.83 
 
 
263 aa  163  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.22 
 
 
264 aa  154  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  36.11 
 
 
265 aa  149  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  32.06 
 
 
263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  31.8 
 
 
263 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  32.57 
 
 
263 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  32.06 
 
 
263 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  34.27 
 
 
262 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3098  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.08 
 
 
272 aa  139  4.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  35.83 
 
 
266 aa  139  6e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.8 
 
 
260 aa  139  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.68 
 
 
260 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  32.59 
 
 
265 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  33.33 
 
 
262 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.11 
 
 
273 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0298  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.26 
 
 
262 aa  137  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  32.55 
 
 
261 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.82 
 
 
267 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2129  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.93 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.135513  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2540  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.52 
 
 
263 aa  136  4e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.893236  normal  0.33655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.04 
 
 
267 aa  136  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.11 
 
 
270 aa  135  8e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.77 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0654  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.85 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.33 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.33 
 
 
269 aa  133  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0895373 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  34.26 
 
 
261 aa  132  6e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  29.02 
 
 
261 aa  132  6e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2482  enoyl-CoA hydratase  34.23 
 
 
277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1741  enoyl-CoA hydratase  31.3 
 
 
265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0980296  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.06 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 
262 aa  130  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  34.09 
 
 
264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 
261 aa  129  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1012  enoyl-CoA hydratase  35.25 
 
 
264 aa  129  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0558214 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  32.57 
 
 
265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 
257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0344  enoyl-CoA hydratase  32.02 
 
 
256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.458261  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.52 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2490  enoyl-CoA hydratase  33.85 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.154881  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  33.86 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2372  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.68 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00516706  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2445  enoyl-CoA hydratase  33.85 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  32.54 
 
 
260 aa  126  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6846  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.95 
 
 
266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763233  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.18 
 
 
264 aa  125  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 
259 aa  126  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.68 
 
 
263 aa  126  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11500  enoyl-CoA hydratase  31.95 
 
 
285 aa  125  6e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.708034  normal  0.0989201 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3608  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.16 
 
 
268 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610166  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  29.77 
 
 
263 aa  125  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2697  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 
261 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000960685  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  32.54 
 
 
264 aa  125  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  33.98 
 
 
262 aa  125  9e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  33.98 
 
 
262 aa  125  9e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1836  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 
270 aa  125  9e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.395714  normal  0.321075 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.73 
 
 
266 aa  124  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1743  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  31.32 
 
 
663 aa  124  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.987316  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1063  enoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 
266 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  33.98 
 
 
262 aa  125  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.42 
 
 
260 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
263 aa  124  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  32.43 
 
 
263 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.8 
 
 
268 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  34.38 
 
 
262 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.15 
 
 
263 aa  123  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  31.82 
 
 
263 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  31.82 
 
 
263 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
263 aa  123  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  31.82 
 
 
263 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  31.82 
 
 
263 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  31.82 
 
 
263 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  31.82 
 
 
263 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>