More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2277 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2277  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
272 aa  555  1e-157  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4886  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  74.33 
 
 
269 aa  402  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4071  enoyl-CoA hydratase  66.79 
 
 
283 aa  388  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0279  enoyl-CoA hydratase  67.16 
 
 
283 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7165  enoyl-CoA hydratase  66.42 
 
 
283 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85548  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2114  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  69.14 
 
 
269 aa  376  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2692  enoyl-CoA hydratase  70.08 
 
 
270 aa  369  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2200  enoyl-CoA hydratase  69.55 
 
 
283 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0179241  normal  0.0692381 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0825  enoyl-CoA hydratase  68.38 
 
 
272 aa  360  2e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112976  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3947  enoyl-CoA hydratase  68.27 
 
 
286 aa  358  4e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0950827 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3834  enoyl-CoA hydratase  68.27 
 
 
286 aa  358  4e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.532762 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5040  enoyl-CoA hydratase  68.56 
 
 
284 aa  357  8e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02010  enoyl-CoA hydratase  67.53 
 
 
283 aa  355  2.9999999999999997e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0591  enoyl-CoA hydratase  70.68 
 
 
284 aa  353  2e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4016  enoyl-CoA hydratase  63.53 
 
 
283 aa  353  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155086  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3619  enoyl-CoA hydratase  68.91 
 
 
284 aa  351  8.999999999999999e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.397236 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5090  enoyl-CoA hydratase  69.78 
 
 
270 aa  349  3e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194463  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2182  enoyl-CoA hydratase  68.42 
 
 
302 aa  348  8e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1326  enoyl-CoA hydratase  66.92 
 
 
268 aa  339  2.9999999999999998e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.63963  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4470  enoyl-CoA hydratase  64.31 
 
 
285 aa  333  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0114118  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0495  enoyl-CoA hydratase  67.17 
 
 
284 aa  332  4e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.227335  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2682  enoyl-CoA hydratase  61.85 
 
 
278 aa  331  9e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.189349  normal  0.255718 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3177  enoyl-CoA hydratase  68.27 
 
 
284 aa  329  3e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0869314  normal  0.884877 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2240  enoyl-CoA hydratase  67.69 
 
 
267 aa  312  2.9999999999999996e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.121941  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1204  enoyl-CoA hydratase  63.36 
 
 
277 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2158  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.31 
 
 
277 aa  262  4e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83195  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5520  enoyl-CoA hydratase  46.54 
 
 
275 aa  239  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.181326 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0995  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.61 
 
 
263 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 
265 aa  159  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.29 
 
 
264 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  33.97 
 
 
265 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  35.38 
 
 
262 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  33.97 
 
 
263 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.44 
 
 
260 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2129  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.74 
 
 
255 aa  149  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.135513  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 
263 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0298  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.98 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.22 
 
 
273 aa  146  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  33.08 
 
 
263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.08 
 
 
264 aa  145  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.6 
 
 
269 aa  145  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0895373 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.14 
 
 
266 aa  145  8.000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1741  enoyl-CoA hydratase  33.85 
 
 
265 aa  145  9e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0980296  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  37.74 
 
 
261 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  33.84 
 
 
264 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
265 aa  143  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  35.38 
 
 
263 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  35.38 
 
 
263 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  35.38 
 
 
263 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  35.38 
 
 
263 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  35.38 
 
 
263 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  34.9 
 
 
261 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  32.06 
 
 
263 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  34.6 
 
 
264 aa  143  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  35.38 
 
 
263 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  35.38 
 
 
263 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  35.06 
 
 
263 aa  142  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  32.44 
 
 
263 aa  141  9e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  36.15 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.15 
 
 
287 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4537  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.08 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.049531  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  36.14 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.08 
 
 
257 aa  140  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  33.83 
 
 
268 aa  138  7.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3551  short chain enoyl-CoA hydratase  34.77 
 
 
259 aa  138  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.97 
 
 
270 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3098  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
272 aa  137  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2540  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.32 
 
 
263 aa  137  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.893236  normal  0.33655 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2482  enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 
277 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
260 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2878  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.98 
 
 
260 aa  137  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  30.95 
 
 
261 aa  137  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.22 
 
 
267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2372  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.95 
 
 
290 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00516706  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0344  enoyl-CoA hydratase  33.98 
 
 
256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.458261  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.42 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2741  enoyl-CoA hydratase  35.66 
 
 
276 aa  136  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.411296 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  34.12 
 
 
262 aa  135  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  35.88 
 
 
258 aa  135  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  32.69 
 
 
264 aa  135  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.86 
 
 
273 aa  135  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1836  enoyl-CoA hydratase  34.12 
 
 
270 aa  135  9e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.395714  normal  0.321075 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0654  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.65 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1063  enoyl-CoA hydratase  33.08 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5501  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.11 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  35.83 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1012  enoyl-CoA hydratase  36.47 
 
 
264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0558214 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  33.07 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2445  enoyl-CoA hydratase  35.27 
 
 
277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2490  enoyl-CoA hydratase  35.27 
 
 
277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.154881  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  32.94 
 
 
260 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.95 
 
 
266 aa  133  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.868532  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.41 
 
 
263 aa  133  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.69 
 
 
273 aa  132  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.34 
 
 
267 aa  132  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 
269 aa  132  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1610  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.11 
 
 
266 aa  132  6.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.52 
 
 
260 aa  132  9e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>