More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0995 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0995  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 263 aa  526  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.92 
 
 		 269 aa  285  5e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0895373 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1741  enoyl-CoA hydratase  49.81 
 
 		 265 aa  268  5e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0980296  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0298  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.54 
 
 		 262 aa  267  1e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1012  enoyl-CoA hydratase  53.1 
 
 		 264 aa  266  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0558214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7120  enoyl-CoA hydratase  56.02 
 
 		 268 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.524105 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1906  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.58 
 
 		 268 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.177848  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.58 
 
 		 268 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3608  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.61 
 
 		 268 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0802  enoyl-CoA hydratase  45.06 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2372  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.02 
 
 		 290 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00516706  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4817  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.44 
 
 		 259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0238476 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2129  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.17 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.135513  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  38.87 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1625  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.73 
 
 		 259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454555 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2277  enoyl-CoA hydratase  38.61 
 
 		 272 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4016  enoyl-CoA hydratase  36.78 
 
 		 283 aa  171  9e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155086  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2114  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.65 
 
 		 269 aa  168  7e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4886  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.15 
 
 		 269 aa  166  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0279  enoyl-CoA hydratase  35.83 
 
 		 283 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4071  enoyl-CoA hydratase  37.3 
 
 		 283 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.87 
 
 		 264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2200  enoyl-CoA hydratase  36.92 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0179241  normal  0.0692381 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7165  enoyl-CoA hydratase  35.46 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0825  enoyl-CoA hydratase  37.85 
 
 		 272 aa  159  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1281  enoyl-CoA hydratase  40.8 
 
 		 259 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0436813  normal  0.258373 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3619  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 		 284 aa  157  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.397236 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2692  enoyl-CoA hydratase  36.51 
 
 		 270 aa  156  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1852  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.51 
 
 		 292 aa  155  4e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.178137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2158  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39 
 
 		 277 aa  155  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83195  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1271  enoyl-CoA hydratase  40.8 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1254  enoyl-CoA hydratase  40.8 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.497005  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0290  enoyl-CoA hydratase  40.45 
 
 		 267 aa  153  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.926213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1879  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.95 
 
 		 259 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112004 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2741  enoyl-CoA hydratase  37.25 
 
 		 276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411296 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.64 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4470  enoyl-CoA hydratase  34.48 
 
 		 285 aa  152  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0114118  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2682  enoyl-CoA hydratase  34.92 
 
 		 278 aa  152  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.189349  normal  0.255718 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  37.4 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2482  enoyl-CoA hydratase  37.89 
 
 		 277 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1326  enoyl-CoA hydratase  35.18 
 
 		 268 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.63963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5040  enoyl-CoA hydratase  34.52 
 
 		 284 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2182  enoyl-CoA hydratase  35.38 
 
 		 302 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1204  enoyl-CoA hydratase  38.89 
 
 		 277 aa  149  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11500  enoyl-CoA hydratase  38.19 
 
 		 285 aa  149  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.708034  normal  0.0989201 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0591  enoyl-CoA hydratase  37.7 
 
 		 284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.12 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  33.93 
 
 		 270 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  34.81 
 
 		 275 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2490  enoyl-CoA hydratase  37.11 
 
 		 277 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.154881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2445  enoyl-CoA hydratase  37.11 
 
 		 277 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 		 269 aa  145  8.000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.88 
 
 		 260 aa  145  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1945  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.95 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.95 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.920346  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02010  enoyl-CoA hydratase  37.01 
 
 		 283 aa  143  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  35.79 
 
 		 265 aa  142  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.26 
 
 		 260 aa  142  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2517  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.98 
 
 		 259 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3551  short chain enoyl-CoA hydratase  36.9 
 
 		 259 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 		 267 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3834  enoyl-CoA hydratase  35.43 
 
 		 286 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.532762 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3947  enoyl-CoA hydratase  35.43 
 
 		 286 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0950827 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  32.69 
 
 		 259 aa  138  7e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.66 
 
 		 273 aa  138  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  34.39 
 
 		 263 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.83 
 
 		 264 aa  138  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  37.2 
 
 		 263 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  34.6 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  36.84 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  34.78 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  34.81 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  35.91 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.77 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.47 
 
 		 659 aa  137  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4110  short chain enoyl-CoA hydratase  32.95 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.741375  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.71 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.77 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0054  enoyl-CoA hydratase  34.21 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  33.08 
 
 		 262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.92 
 
 		 264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.76 
 
 		 263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.92 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.52 
 
 		 273 aa  136  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.11 
 
 		 271 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3177  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 		 284 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0869314  normal  0.884877 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.34 
 
 		 261 aa  135  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 		 271 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 		 263 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  35 
 
 		 260 aa  135  8e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.98 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.25 
 
 		 264 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  34.39 
 
 		 262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  34.44 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 269 aa  133  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  32.18 
 
 		 270 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.1 
 
 		 254 aa  133  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00721666  normal  0.45586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>