More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1906 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1906  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 268 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.177848  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3608  enoyl-CoA hydratase/isomerase  88.43 
 
 		 268 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  85.82 
 
 		 268 aa  434  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7120  enoyl-CoA hydratase  83.58 
 
 		 268 aa  421  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.524105 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  63.53 
 
 		 269 aa  353  2e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0895373 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1741  enoyl-CoA hydratase  60.08 
 
 		 265 aa  315  3e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0980296  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1012  enoyl-CoA hydratase  58.94 
 
 		 264 aa  292  4e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0558214 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0995  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.58 
 
 		 263 aa  277  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0298  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.47 
 
 		 262 aa  270  2e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2372  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.35 
 
 		 290 aa  192  5e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00516706  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0802  enoyl-CoA hydratase  47.55 
 
 		 265 aa  188  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1852  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.16 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.178137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1625  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.74 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454555 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4817  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.45 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0238476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  41.13 
 
 		 265 aa  172  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2129  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.39 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.135513  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1271  enoyl-CoA hydratase  41.51 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1254  enoyl-CoA hydratase  41.51 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.497005  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1281  enoyl-CoA hydratase  41.13 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0436813  normal  0.258373 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11500  enoyl-CoA hydratase  39.16 
 
 		 285 aa  162  6e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.708034  normal  0.0989201 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  37.69 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3671  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.53 
 
 		 270 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.222847  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  36.94 
 
 		 262 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  36.94 
 
 		 264 aa  152  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5520  enoyl-CoA hydratase  37.59 
 
 		 275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.181326 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0290  enoyl-CoA hydratase  43.51 
 
 		 267 aa  151  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.926213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2692  enoyl-CoA hydratase  37.26 
 
 		 270 aa  151  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2741  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411296 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  38.81 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  38.81 
 
 		 261 aa  148  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2158  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.7 
 
 		 277 aa  148  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83195  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.06 
 
 		 260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1879  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.76 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112004 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.34 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.67 
 
 		 287 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.42 
 
 		 256 aa  145  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2482  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 		 277 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.74 
 
 		 259 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0654  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.8 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2445  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2490  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.154881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.93 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.61 
 
 		 264 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.02 
 
 		 264 aa  142  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 		 264 aa  142  7e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  35.34 
 
 		 263 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.72 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2517  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.08 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.25 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0644  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.85 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1945  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.76 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.76 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.920346  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  37.22 
 
 		 263 aa  139  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.71 
 
 		 259 aa  139  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.09 
 
 		 265 aa  140  3e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  34.59 
 
 		 263 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.08 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.35 
 
 		 264 aa  139  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.23 
 
 		 264 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  34.65 
 
 		 259 aa  138  8.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  34.59 
 
 		 263 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2207  enoyl-CoA hydratase  34.44 
 
 		 265 aa  138  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130556  hitchhiker  0.0060069 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2114  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 		 269 aa  138  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4016  enoyl-CoA hydratase  35.07 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155086  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4886  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.4 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0555  enoyl-CoA hydratase  36.57 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.323488  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.9 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  38.97 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  35.85 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2200  enoyl-CoA hydratase  35.2 
 
 		 283 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0179241  normal  0.0692381 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.94 
 
 		 659 aa  136  3.0000000000000003e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.85 
 
 		 264 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4071  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 		 283 aa  136  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  32.72 
 
 		 265 aa  135  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7165  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 283 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2682  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 		 278 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.189349  normal  0.255718 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5040  enoyl-CoA hydratase  34.23 
 
 		 284 aa  135  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  34.47 
 
 		 296 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.36 
 
 		 262 aa  135  9e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  34.44 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4073  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.23 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4110  short chain enoyl-CoA hydratase  34.83 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.741375  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.29 
 
 		 263 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  37.36 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  35.06 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.91 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.47 
 
 		 273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  34.93 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3726  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.61 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452007  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3603  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.65 
 
 		 264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0279  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 		 283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.9 
 
 		 267 aa  133  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.12 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.47 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  35.94 
 
 		 266 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.09 
 
 		 662 aa  132  6e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  35.11 
 
 		 270 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  32.33 
 
 		 264 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>