More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7120 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7120  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
268 aa  539  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.524105 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1906  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  83.58 
 
 
268 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.177848  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  82.84 
 
 
268 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3608  enoyl-CoA hydratase/isomerase  82.84 
 
 
268 aa  411  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610166  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  63.02 
 
 
269 aa  340  1e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0895373 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1741  enoyl-CoA hydratase  55.13 
 
 
265 aa  296  2e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0980296  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0995  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.02 
 
 
263 aa  290  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1012  enoyl-CoA hydratase  58.17 
 
 
264 aa  289  3e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0558214 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0298  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.3 
 
 
262 aa  281  1e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2372  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.35 
 
 
290 aa  195  6e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00516706  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4817  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.5 
 
 
259 aa  189  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0238476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  40.3 
 
 
265 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1625  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.37 
 
 
259 aa  186  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0454555 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0802  enoyl-CoA hydratase  45.04 
 
 
265 aa  181  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2129  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.91 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.135513  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1281  enoyl-CoA hydratase  42.91 
 
 
259 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0436813  normal  0.258373 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1271  enoyl-CoA hydratase  43.72 
 
 
259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1254  enoyl-CoA hydratase  43.72 
 
 
259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.497005  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0290  enoyl-CoA hydratase  44.27 
 
 
267 aa  166  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.926213  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1852  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.83 
 
 
292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.178137  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11500  enoyl-CoA hydratase  38.2 
 
 
285 aa  161  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.708034  normal  0.0989201 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1879  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.15 
 
 
259 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.112004 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3671  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.42 
 
 
270 aa  158  9e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.222847  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  35.07 
 
 
261 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  35.82 
 
 
261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  34.85 
 
 
264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  34.7 
 
 
262 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2482  enoyl-CoA hydratase  38.43 
 
 
277 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1945  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.15 
 
 
259 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.15 
 
 
259 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.920346  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2741  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 
276 aa  152  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.411296 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.61 
 
 
287 aa  151  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.11 
 
 
259 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  36.94 
 
 
263 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2692  enoyl-CoA hydratase  34.98 
 
 
270 aa  148  9e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2490  enoyl-CoA hydratase  37.65 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.154881  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.59 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4886  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.38 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2445  enoyl-CoA hydratase  37.65 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  35.34 
 
 
263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5520  enoyl-CoA hydratase  35.11 
 
 
275 aa  145  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.181326 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.93 
 
 
260 aa  145  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5040  enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 
284 aa  145  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2114  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.09 
 
 
269 aa  145  8.000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2158  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.61 
 
 
277 aa  145  8.000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83195  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  36.26 
 
 
266 aa  144  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.16 
 
 
256 aa  143  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4071  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
283 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.22 
 
 
263 aa  143  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.59 
 
 
265 aa  143  4e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  34.98 
 
 
263 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  36.58 
 
 
260 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  34.59 
 
 
263 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  38.97 
 
 
266 aa  142  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  34.59 
 
 
263 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  35.41 
 
 
263 aa  142  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.33 
 
 
264 aa  141  9e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4110  short chain enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 
265 aa  141  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.741375  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  32.59 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4016  enoyl-CoA hydratase  34.24 
 
 
283 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155086  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.16 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.2 
 
 
264 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.06 
 
 
264 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4241  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.06 
 
 
261 aa  139  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
264 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  37.01 
 
 
262 aa  139  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  37.21 
 
 
260 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.23 
 
 
273 aa  139  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.85 
 
 
274 aa  138  7.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3669  enoyl-CoA hydratase  38.66 
 
 
243 aa  137  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.517909  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 
261 aa  137  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.61 
 
 
260 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1007  enoyl-CoA hydratase  36.05 
 
 
268 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0394132  normal  0.416102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.34 
 
 
259 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.09 
 
 
266 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.64 
 
 
263 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  34.42 
 
 
275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0555  enoyl-CoA hydratase  33.96 
 
 
262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.323488  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.34 
 
 
273 aa  136  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0279  enoyl-CoA hydratase  32.41 
 
 
283 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.08 
 
 
260 aa  136  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 
267 aa  136  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3619  enoyl-CoA hydratase  35.94 
 
 
284 aa  135  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.397236 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2682  enoyl-CoA hydratase  34.69 
 
 
278 aa  135  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.189349  normal  0.255718 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.58 
 
 
264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7165  enoyl-CoA hydratase  32.41 
 
 
283 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85548  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0644  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 
260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.19 
 
 
263 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2200  enoyl-CoA hydratase  32.43 
 
 
283 aa  135  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0179241  normal  0.0692381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.71 
 
 
264 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  35.19 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2224  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  36.88 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549039  hitchhiker  0.0000374036 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
268 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1349  enoyl-CoA hydratase  34.53 
 
 
294 aa  134  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1394  enoyl-CoA hydratase  33.94 
 
 
288 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168827  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.96 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  34.34 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  35.61 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.45 
 
 
262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>