More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2129 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2129  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
255 aa  524  1e-148  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.135513  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1741  enoyl-CoA hydratase  42.08 
 
 
265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0980296  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.13 
 
 
269 aa  194  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0895373 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0995  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.17 
 
 
263 aa  191  8e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0298  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.36 
 
 
262 aa  191  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1879  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.08 
 
 
259 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.112004 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1012  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 
264 aa  169  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0558214 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2372  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
290 aa  167  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00516706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1945  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.66 
 
 
259 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.66 
 
 
259 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.920346  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.13 
 
 
268 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7120  enoyl-CoA hydratase  39.91 
 
 
268 aa  161  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.524105 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1852  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.07 
 
 
292 aa  160  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.178137  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2114  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.45 
 
 
269 aa  159  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1906  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.39 
 
 
268 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.177848  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2158  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.79 
 
 
277 aa  159  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83195  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4071  enoyl-CoA hydratase  37.29 
 
 
283 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3608  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.69 
 
 
268 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610166  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2692  enoyl-CoA hydratase  39.45 
 
 
270 aa  156  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2277  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
272 aa  154  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5040  enoyl-CoA hydratase  38.35 
 
 
284 aa  152  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4886  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.29 
 
 
269 aa  152  7e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2200  enoyl-CoA hydratase  39.44 
 
 
283 aa  152  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0179241  normal  0.0692381 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7165  enoyl-CoA hydratase  35.5 
 
 
283 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85548  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1625  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.52 
 
 
259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0454555 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0279  enoyl-CoA hydratase  35.93 
 
 
283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2445  enoyl-CoA hydratase  36.07 
 
 
277 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2490  enoyl-CoA hydratase  36.07 
 
 
277 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.154881  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3671  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.19 
 
 
270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.222847  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1281  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 
259 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0436813  normal  0.258373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0290  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
267 aa  143  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.926213  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2482  enoyl-CoA hydratase  35.66 
 
 
277 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3947  enoyl-CoA hydratase  38.94 
 
 
286 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0950827 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3834  enoyl-CoA hydratase  38.94 
 
 
286 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.532762 
 
 
-
 
NC_003296  RS02010  enoyl-CoA hydratase  41.4 
 
 
283 aa  142  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  35.86 
 
 
265 aa  142  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1271  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 
259 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1254  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 
259 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.497005  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4817  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.09 
 
 
259 aa  142  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0238476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2741  enoyl-CoA hydratase  34.63 
 
 
276 aa  141  8e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.411296 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5520  enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 
275 aa  141  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.181326 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4470  enoyl-CoA hydratase  38.5 
 
 
285 aa  141  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0114118  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4016  enoyl-CoA hydratase  34.51 
 
 
283 aa  141  9e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155086  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0825  enoyl-CoA hydratase  41.67 
 
 
272 aa  140  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112976  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.45 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2682  enoyl-CoA hydratase  38.73 
 
 
278 aa  139  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.189349  normal  0.255718 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  37.33 
 
 
260 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2182  enoyl-CoA hydratase  39.05 
 
 
302 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3619  enoyl-CoA hydratase  37.91 
 
 
284 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.397236 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11500  enoyl-CoA hydratase  35.97 
 
 
285 aa  136  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.708034  normal  0.0989201 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1822  enoyl-CoA hydratase  32.59 
 
 
269 aa  135  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0818763  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1890  enoyl-CoA hydratase  35.47 
 
 
270 aa  135  8e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96141  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0802  enoyl-CoA hydratase  36.97 
 
 
265 aa  135  9e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0591  enoyl-CoA hydratase  36.97 
 
 
284 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.81 
 
 
264 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1326  enoyl-CoA hydratase  35.58 
 
 
268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.63963  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  35.43 
 
 
263 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.62 
 
 
260 aa  129  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  34.39 
 
 
263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.65 
 
 
261 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  34.05 
 
 
261 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3177  enoyl-CoA hydratase  41.08 
 
 
284 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0869314  normal  0.884877 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  34.04 
 
 
258 aa  128  8.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.82 
 
 
265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0495  enoyl-CoA hydratase  34.4 
 
 
284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.227335  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5283  enoyl-CoA hydratase  30.2 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  32.94 
 
 
263 aa  126  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.62 
 
 
258 aa  126  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.55 
 
 
263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.76 
 
 
260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.48 
 
 
264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
262 aa  125  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3669  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 
243 aa  125  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.517909  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.61 
 
 
287 aa  125  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  33.62 
 
 
260 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5090  enoyl-CoA hydratase  37.56 
 
 
270 aa  125  8.000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194463  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.53 
 
 
257 aa  125  9e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  32.64 
 
 
262 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  36.96 
 
 
296 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2497  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.7 
 
 
967 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126013  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
258 aa  125  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.65 
 
 
271 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4537  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.03 
 
 
261 aa  123  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.049531  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0321  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  33.63 
 
 
279 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.303532  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.36 
 
 
260 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6511  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.79 
 
 
262 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.305352  normal  0.309603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.05 
 
 
271 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1621  enoyl-CoA hydratase  30.71 
 
 
302 aa  123  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.84 
 
 
260 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.76 
 
 
260 aa  122  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  32.05 
 
 
263 aa  123  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.51 
 
 
260 aa  122  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
262 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3255  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
262 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574629 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02529  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G14520)  32.91 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.221324  normal  0.697318 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.99 
 
 
259 aa  120  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4299  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  31.7 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.39 
 
 
271 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>