More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5283 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007950  Bpro_5283  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
267 aa  549  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1822  enoyl-CoA hydratase  71.54 
 
 
269 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0818763  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4233  enoyl-CoA hydratase  53.73 
 
 
295 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.375859 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7280  enoyl-CoA hydratase  51.53 
 
 
281 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.83721  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0484  enoyl-CoA hydratase  52.06 
 
 
295 aa  278  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.056437 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2911  enoyl-CoA hydratase  54.14 
 
 
275 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210869  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2297  enoyl-CoA hydratase  54.14 
 
 
275 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201677  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6254  enoyl-CoA hydratase  53.76 
 
 
275 aa  277  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.438926 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0393  enoyl-CoA hydratase  54.14 
 
 
295 aa  277  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.350305  normal  0.0100997 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2926  enoyl-CoA hydratase  53.76 
 
 
275 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal  0.995806 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2960  enoyl-CoA hydratase  53.76 
 
 
275 aa  274  9e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2823  enoyl-CoA hydratase  53.76 
 
 
275 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.40925 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0304  enoyl-CoA hydratase  51.3 
 
 
272 aa  270  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2750  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.43 
 
 
268 aa  269  2.9999999999999997e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0198  enoyl-CoA hydratase  52.04 
 
 
286 aa  269  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0420  enoyl-CoA hydratase  51.32 
 
 
275 aa  269  4e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.411652  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0166  enoyl-CoA hydratase  51.67 
 
 
272 aa  268  5e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0159  enoyl-CoA hydratase  51.3 
 
 
272 aa  267  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0076  enoyl-CoA hydratase  50.94 
 
 
275 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.426099  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3213  enoyl-CoA hydratase  50.94 
 
 
275 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1350  enoyl-CoA hydratase  50.94 
 
 
275 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0835186  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0244  enoyl-CoA hydratase  50.94 
 
 
275 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0603  enoyl-CoA hydratase  50.94 
 
 
326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.383469  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0439  enoyl-CoA hydratase  50.94 
 
 
275 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0110  enoyl-CoA hydratase  56.52 
 
 
277 aa  265  7e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2162  enoyl-CoA hydratase  50.19 
 
 
273 aa  263  2e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0080  enoyl-CoA hydratase  56.09 
 
 
275 aa  260  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3993  enoyl-CoA hydratase  52.33 
 
 
260 aa  257  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169816  normal  0.366348 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3006  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.08 
 
 
269 aa  254  1.0000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12694  enoyl-CoA hydratase  48.87 
 
 
276 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311561  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0363  enoyl-CoA hydratase  53.14 
 
 
249 aa  250  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3643  enoyl-CoA hydratase  49.44 
 
 
265 aa  238  6.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0287  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.62 
 
 
270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0921872  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1633  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.23 
 
 
266 aa  225  7e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959548  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1014  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.02 
 
 
269 aa  223  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.108431 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.35 
 
 
264 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.28 
 
 
267 aa  192  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1700  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.37 
 
 
268 aa  186  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.672867  hitchhiker  0.0000387176 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0354  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.09 
 
 
263 aa  178  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000842665 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6511  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.61 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.305352  normal  0.309603 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.61 
 
 
262 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3255  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.61 
 
 
262 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574629 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0321  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  33.08 
 
 
279 aa  168  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.303532  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1991  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.85 
 
 
264 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.19767  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4150  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.31 
 
 
269 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.135617  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4780  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.54 
 
 
258 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4486  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.68 
 
 
258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5704  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4399  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.68 
 
 
258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  33.98 
 
 
260 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1840  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.6 
 
 
264 aa  150  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15718  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0515  enoyl-CoA hydratase  34.66 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658249  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2705  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.67 
 
 
262 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6922  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.45 
 
 
258 aa  142  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6835  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.91 
 
 
264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103255  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  31.54 
 
 
260 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.95 
 
 
273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.81 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4253  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.14 
 
 
254 aa  136  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.12 
 
 
254 aa  135  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.3 
 
 
268 aa  134  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.7 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.2 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  31.5 
 
 
263 aa  133  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3818  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.11 
 
 
255 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3892  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.11 
 
 
255 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594401  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  33.97 
 
 
259 aa  132  6e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3804  enoyl-CoA hydratase  36.11 
 
 
255 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726553  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.04 
 
 
261 aa  130  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.28 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.89 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.99 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  34.13 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4537  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.82 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.049531  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 
270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2195  short chain enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000647858  hitchhiker  0.00875803 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.25 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.99 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.73 
 
 
269 aa  126  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0895373 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.86 
 
 
260 aa  126  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  34.52 
 
 
269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  33.58 
 
 
266 aa  126  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.08 
 
 
258 aa  125  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  31.91 
 
 
262 aa  125  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.39 
 
 
264 aa  125  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.23 
 
 
258 aa  125  8.000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.08 
 
 
266 aa  125  9e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.55 
 
 
260 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.52 
 
 
264 aa  124  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  32.41 
 
 
263 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.68 
 
 
267 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.26 
 
 
662 aa  124  2e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  35.52 
 
 
258 aa  124  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  32.58 
 
 
262 aa  123  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.64 
 
 
253 aa  122  5e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
263 aa  122  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  32.94 
 
 
264 aa  122  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>