More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1621 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1621  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
302 aa  624  1e-178  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2924  enoyl-CoA hydratase  78.6 
 
 
269 aa  411  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3765  enoyl-CoA hydratase  62.93 
 
 
260 aa  309  5e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4219  enoyl-CoA hydratase  61.78 
 
 
260 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.851396 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3753  enoyl-CoA hydratase  62.55 
 
 
260 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.252883  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3826  enoyl-CoA hydratase  62.55 
 
 
260 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.969771  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2433  enoyl-CoA hydratase  61 
 
 
260 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707416  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4297  enoyl-CoA hydratase  60.38 
 
 
263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2709  enoyl-CoA hydratase  59.47 
 
 
264 aa  299  5e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2067  enoyl-CoA hydratase  57.88 
 
 
278 aa  280  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1977  enoyl-CoA hydratase  48.29 
 
 
267 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.793656  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4614  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.58 
 
 
283 aa  233  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3837  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.35 
 
 
300 aa  228  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1560  enoyl-CoA hydratase  48.13 
 
 
295 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0929  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.6 
 
 
312 aa  226  4e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2616  enoyl-CoA hydratase  48.88 
 
 
281 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.807591  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4005  enoyl-CoA hydratase  48.62 
 
 
282 aa  225  6e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0939626  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2815  enoyl-CoA hydratase  48.13 
 
 
281 aa  224  9e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  hitchhiker  0.00311628 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2349  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.56 
 
 
285 aa  224  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0950973  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1431  enoyl-CoA hydratase  48.22 
 
 
282 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1240  enoyl-CoA hydratase  49.41 
 
 
282 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220656  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2156  enoyl-CoA hydratase  46.4 
 
 
318 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5190  enoyl-CoA hydratase  47.41 
 
 
301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543929  normal  0.0605962 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1434  enoyl-CoA hydratase  46.01 
 
 
308 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193072  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1612  enoyl-CoA hydratase  45.19 
 
 
298 aa  215  8e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11964  enoyl-CoA hydratase  44.83 
 
 
318 aa  208  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111135  normal  0.793618 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1568  enoyl-CoA hydratase  45.79 
 
 
301 aa  207  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562799  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4607  enoyl-CoA hydratase  44.78 
 
 
298 aa  205  8e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.995784  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4695  enoyl-CoA hydratase  44.78 
 
 
298 aa  205  8e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.325872  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4990  enoyl-CoA hydratase  44.78 
 
 
298 aa  205  9e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.493737 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0841  enoyl-CoA hydratase  46.26 
 
 
272 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3753  enoyl-CoA hydratase  45.52 
 
 
299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.95 
 
 
297 aa  198  9e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4005  enoyl-CoA hydratase  42.25 
 
 
302 aa  191  9e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0806  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.27 
 
 
273 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0669988  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  34.78 
 
 
259 aa  136  4e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.9 
 
 
256 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.67 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  35.8 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1028  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.76 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  36.44 
 
 
257 aa  125  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  37.39 
 
 
262 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.57 
 
 
256 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3350  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.89 
 
 
273 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.219345 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.25 
 
 
258 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  37 
 
 
258 aa  124  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.94 
 
 
255 aa  124  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0700  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.92 
 
 
290 aa  122  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0515033  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.6 
 
 
258 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3179  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.12 
 
 
275 aa  122  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608848  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.44 
 
 
255 aa  122  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.63 
 
 
259 aa  122  9e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.37 
 
 
659 aa  121  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  34.82 
 
 
264 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  35.81 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4992  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.16 
 
 
272 aa  121  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  34.63 
 
 
277 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.87 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4596  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.27 
 
 
255 aa  120  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 
257 aa  120  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6879  enoyl-CoA hydratase  36.02 
 
 
297 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.79 
 
 
260 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 
257 aa  120  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.49 
 
 
259 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.81 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  37.66 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.91 
 
 
260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  38.33 
 
 
275 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 
259 aa  119  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.15 
 
 
258 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.45 
 
 
260 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.02 
 
 
267 aa  119  9e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  35.25 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.17 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  34.16 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.42 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.63 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  32.35 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  35.54 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.35 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  36.87 
 
 
260 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1854  short chain enoyl-CoA hydratase  35.48 
 
 
258 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.16 
 
 
260 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2009  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.74 
 
 
258 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  32.11 
 
 
262 aa  117  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0649  enoyl-CoA hydratase  34.22 
 
 
261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.64 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2129  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30 
 
 
255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.135513  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 
270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33170  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  34.82 
 
 
251 aa  116  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.119109  normal  0.701419 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.64 
 
 
260 aa  116  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.25 
 
 
662 aa  116  6e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.79 
 
 
259 aa  115  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  34.05 
 
 
260 aa  115  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.94 
 
 
260 aa  116  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  31.58 
 
 
263 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  31.58 
 
 
263 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  35.53 
 
 
260 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  35.84 
 
 
259 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5505  enoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 
293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>