More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1977 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1977  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 267 aa  552  1e-156  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.793656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0841  enoyl-CoA hydratase  56.2 
 
 		 272 aa  315  7e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1621  enoyl-CoA hydratase  48.29 
 
 		 302 aa  240  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4297  enoyl-CoA hydratase  50.42 
 
 		 263 aa  228  6e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3753  enoyl-CoA hydratase  50.42 
 
 		 260 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.252883  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3826  enoyl-CoA hydratase  50.42 
 
 		 260 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.969771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3765  enoyl-CoA hydratase  50.42 
 
 		 260 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4219  enoyl-CoA hydratase  49.15 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851396 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2433  enoyl-CoA hydratase  48.31 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707416  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4614  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.84 
 
 		 283 aa  210  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2709  enoyl-CoA hydratase  48.95 
 
 		 264 aa  210  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3837  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.22 
 
 		 300 aa  206  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0929  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46 
 
 		 312 aa  203  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1560  enoyl-CoA hydratase  41.67 
 
 		 295 aa  199  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2924  enoyl-CoA hydratase  46.77 
 
 		 269 aa  199  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4005  enoyl-CoA hydratase  43.27 
 
 		 282 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0939626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1431  enoyl-CoA hydratase  42.75 
 
 		 282 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2067  enoyl-CoA hydratase  47.58 
 
 		 278 aa  199  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1434  enoyl-CoA hydratase  42.8 
 
 		 308 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2616  enoyl-CoA hydratase  44.53 
 
 		 281 aa  198  7.999999999999999e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.807591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5190  enoyl-CoA hydratase  45.91 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543929  normal  0.0605962 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1240  enoyl-CoA hydratase  42.8 
 
 		 282 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2349  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.62 
 
 		 285 aa  195  6e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0950973  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2815  enoyl-CoA hydratase  43.98 
 
 		 281 aa  192  5e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  hitchhiker  0.00311628 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1568  enoyl-CoA hydratase  44.36 
 
 		 301 aa  191  8e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562799  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4695  enoyl-CoA hydratase  44.36 
 
 		 298 aa  188  7e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.325872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4607  enoyl-CoA hydratase  44.36 
 
 		 298 aa  188  7e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.995784  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4990  enoyl-CoA hydratase  44.36 
 
 		 298 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.493737 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11964  enoyl-CoA hydratase  43.82 
 
 		 318 aa  188  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111135  normal  0.793618 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4005  enoyl-CoA hydratase  44.31 
 
 		 302 aa  180  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2156  enoyl-CoA hydratase  37.74 
 
 		 318 aa  177  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3753  enoyl-CoA hydratase  38.66 
 
 		 299 aa  176  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.71 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1612  enoyl-CoA hydratase  42.74 
 
 		 298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0806  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.92 
 
 		 273 aa  169  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0669988  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1028  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.75 
 
 		 280 aa  158  7e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3350  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.34 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.219345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4085  enoyl-CoA hydratase  33.61 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.285482  normal  0.481509 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 		 264 aa  132  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3179  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.88 
 
 		 255 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0700  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.49 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0515033  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  37.56 
 
 		 261 aa  125  9e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4992  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 		 272 aa  123  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  35.11 
 
 		 259 aa  123  4e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1938  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.18 
 
 		 271 aa  122  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.45 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  39.29 
 
 		 266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  32.3 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2696  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.86 
 
 		 312 aa  117  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1548  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.88 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.58 
 
 		 256 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.86 
 
 		 264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  34.65 
 
 		 659 aa  115  7.999999999999999e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6879  enoyl-CoA hydratase  31.37 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36 
 
 		 256 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.69 
 
 		 267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.75 
 
 		 265 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.53 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33170  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  35.38 
 
 		 251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.119109  normal  0.701419 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1325  enoyl-CoA hydratase  30.3 
 
 		 277 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.21 
 
 		 257 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.17 
 
 		 260 aa  112  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2797  naphthoate synthase  34.9 
 
 		 272 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  36.87 
 
 		 270 aa  112  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4870  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  32.13 
 
 		 277 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00246591  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.31 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2009  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.68 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.62 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.868532  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.32 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0341  enoyl-CoA hydratase  29.29 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0636518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  34.08 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.62 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1238  enoyl-CoA hydratase  34.68 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.4006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  34.56 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.74 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.44 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.14 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.07 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.17 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.07 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.71 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.07 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2077  naphthoate synthase  34.06 
 
 		 273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.310676 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.06 
 
 		 259 aa  109  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0225  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  30.59 
 
 		 277 aa  109  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000072879  normal  0.0457415 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 259 aa  109  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0644  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.94 
 
 		 260 aa  109  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2485  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.45 
 
 		 260 aa  109  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.380203 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0570  naphthoate synthase  32.31 
 
 		 272 aa  108  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.53 
 
 		 258 aa  108  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 		 258 aa  108  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.04 
 
 		 257 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 		 266 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.04 
 
 		 257 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1854  short chain enoyl-CoA hydratase  36.11 
 
 		 258 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1216  naphthoate synthase  34.07 
 
 		 274 aa  108  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0182076  hitchhiker  0.000174974 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2091  naphthoate synthase  34.93 
 
 		 273 aa  108  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.04 
 
 		 257 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  34.74 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>