More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0806 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0806  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
273 aa  548  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0669988  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3350  enoyl-CoA hydratase/isomerase  75.09 
 
 
273 aa  401  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.219345 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4992  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.24 
 
 
272 aa  283  3.0000000000000004e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1938  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.54 
 
 
271 aa  224  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3179  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.86 
 
 
275 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608848  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1028  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.01 
 
 
280 aa  169  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1977  enoyl-CoA hydratase  37.92 
 
 
267 aa  169  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.793656  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0841  enoyl-CoA hydratase  39.1 
 
 
272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2616  enoyl-CoA hydratase  37.16 
 
 
281 aa  157  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.807591  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2709  enoyl-CoA hydratase  39.75 
 
 
264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4297  enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 
263 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1431  enoyl-CoA hydratase  36.82 
 
 
282 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2815  enoyl-CoA hydratase  36.07 
 
 
281 aa  149  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  hitchhiker  0.00311628 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3837  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.64 
 
 
259 aa  146  3e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.67 
 
 
260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2349  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.63 
 
 
285 aa  145  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0950973  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.01 
 
 
263 aa  143  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.94 
 
 
260 aa  142  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4614  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
283 aa  142  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1434  enoyl-CoA hydratase  35.54 
 
 
308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193072  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1240  enoyl-CoA hydratase  34.63 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220656  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4005  enoyl-CoA hydratase  34.77 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0939626  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4219  enoyl-CoA hydratase  32.92 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.851396 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2433  enoyl-CoA hydratase  33.05 
 
 
260 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707416  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1621  enoyl-CoA hydratase  35.27 
 
 
302 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3765  enoyl-CoA hydratase  34.17 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3753  enoyl-CoA hydratase  34.17 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.252883  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3826  enoyl-CoA hydratase  34.17 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.969771  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  36.89 
 
 
264 aa  138  8.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1560  enoyl-CoA hydratase  34.16 
 
 
295 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  35.92 
 
 
263 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3633  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.95 
 
 
269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.23444  normal  0.3158 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.34 
 
 
265 aa  136  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.67 
 
 
258 aa  136  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.11 
 
 
256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.85 
 
 
260 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.3 
 
 
257 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.86 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1738  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.13 
 
 
259 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.46 
 
 
257 aa  132  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.07 
 
 
260 aa  132  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.67 
 
 
258 aa  132  9e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  35.51 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.2 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00721666  normal  0.45586 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  36.02 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2195  short chain enoyl-CoA hydratase  33.94 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000647858  hitchhiker  0.00875803 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  37.92 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0341  enoyl-CoA hydratase  32.86 
 
 
302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0636518  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2207  enoyl-CoA hydratase  35.48 
 
 
265 aa  130  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130556  hitchhiker  0.0060069 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5256  enoyl-CoA hydratase  35.66 
 
 
267 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.55 
 
 
260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  37.22 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2067  enoyl-CoA hydratase  35.89 
 
 
278 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0474  enoyl-CoA hydratase  32.98 
 
 
292 aa  129  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 
260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.85 
 
 
257 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.86 
 
 
259 aa  129  6e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.85 
 
 
257 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.85 
 
 
257 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4819  enoyl-CoA hydratase  41.26 
 
 
263 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.79 
 
 
265 aa  128  9.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.52 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  34.5 
 
 
263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.86 
 
 
259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0321  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.15 
 
 
287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.317267  normal  0.269459 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.3 
 
 
260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2924  enoyl-CoA hydratase  36.21 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  37.39 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  36.67 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  38.22 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.08 
 
 
261 aa  126  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.83 
 
 
259 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  38.12 
 
 
662 aa  127  3e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.73 
 
 
260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.27 
 
 
259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.43 
 
 
264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  34.8 
 
 
256 aa  125  5e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.21 
 
 
258 aa  125  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.46 
 
 
268 aa  125  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.27 
 
 
260 aa  125  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0429  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.09 
 
 
262 aa  125  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.297367 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.45 
 
 
259 aa  125  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0566  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.8 
 
 
273 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000469467  normal  0.441502 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4005  enoyl-CoA hydratase  32.34 
 
 
300 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.248977  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.24 
 
 
260 aa  125  9e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  33.69 
 
 
659 aa  125  9e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.46 
 
 
258 aa  125  9e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.7 
 
 
266 aa  125  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1743  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.29 
 
 
663 aa  125  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.987316  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.9 
 
 
262 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.71 
 
 
270 aa  124  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.08 
 
 
258 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1789  enoyl-CoA hydratase  35.19 
 
 
261 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  32.62 
 
 
259 aa  124  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.17 
 
 
257 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 
256 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0649  enoyl-CoA hydratase  37.97 
 
 
261 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.1 
 
 
260 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.96 
 
 
259 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>