More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1560 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1560  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
295 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1434  enoyl-CoA hydratase  85.2 
 
 
308 aa  499  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193072  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2156  enoyl-CoA hydratase  73.11 
 
 
318 aa  429  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4614  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  71.17 
 
 
283 aa  404  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3837  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  65.58 
 
 
300 aa  383  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2616  enoyl-CoA hydratase  67.55 
 
 
281 aa  379  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.807591  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2349  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  67.67 
 
 
285 aa  375  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0950973  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2815  enoyl-CoA hydratase  66.17 
 
 
281 aa  369  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  hitchhiker  0.00311628 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3753  enoyl-CoA hydratase  62.42 
 
 
299 aa  368  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0929  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.34 
 
 
312 aa  357  1.9999999999999998e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1431  enoyl-CoA hydratase  52.03 
 
 
282 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1240  enoyl-CoA hydratase  53.06 
 
 
282 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220656  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4005  enoyl-CoA hydratase  51.84 
 
 
282 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0939626  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4297  enoyl-CoA hydratase  49.42 
 
 
263 aa  246  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1612  enoyl-CoA hydratase  46.99 
 
 
298 aa  238  8e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3765  enoyl-CoA hydratase  49.41 
 
 
260 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3826  enoyl-CoA hydratase  50.2 
 
 
260 aa  235  6e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.969771  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3753  enoyl-CoA hydratase  50.2 
 
 
260 aa  235  6e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.252883  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4219  enoyl-CoA hydratase  49.41 
 
 
260 aa  235  7e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.851396 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2709  enoyl-CoA hydratase  50.58 
 
 
264 aa  229  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2433  enoyl-CoA hydratase  47.84 
 
 
260 aa  229  5e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707416  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2067  enoyl-CoA hydratase  50.79 
 
 
278 aa  228  6e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1621  enoyl-CoA hydratase  48.13 
 
 
302 aa  226  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.91 
 
 
297 aa  215  5.9999999999999996e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2924  enoyl-CoA hydratase  48.79 
 
 
269 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5190  enoyl-CoA hydratase  43.73 
 
 
301 aa  206  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543929  normal  0.0605962 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4695  enoyl-CoA hydratase  42.8 
 
 
298 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.325872  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4607  enoyl-CoA hydratase  42.8 
 
 
298 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.995784  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4990  enoyl-CoA hydratase  42.8 
 
 
298 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.493737 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1568  enoyl-CoA hydratase  42.97 
 
 
301 aa  200  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562799  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1977  enoyl-CoA hydratase  41.67 
 
 
267 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.793656  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11964  enoyl-CoA hydratase  41.73 
 
 
318 aa  199  5e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111135  normal  0.793618 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4005  enoyl-CoA hydratase  40.15 
 
 
302 aa  195  8.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0841  enoyl-CoA hydratase  41.39 
 
 
272 aa  183  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0806  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.16 
 
 
273 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0669988  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0700  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 
290 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0515033  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3350  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.06 
 
 
273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.219345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4085  enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 
276 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.285482  normal  0.481509 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33170  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  36.05 
 
 
251 aa  125  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.119109  normal  0.701419 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.97 
 
 
659 aa  124  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.22 
 
 
255 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  35.56 
 
 
264 aa  123  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1028  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.06 
 
 
280 aa  121  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.11 
 
 
263 aa  119  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.53 
 
 
252 aa  119  7e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  34.5 
 
 
261 aa  119  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  34.5 
 
 
270 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.21 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.3 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0474  enoyl-CoA hydratase  36.14 
 
 
292 aa  117  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.27 
 
 
273 aa  117  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1938  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.91 
 
 
271 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3633  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.6 
 
 
269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.23444  normal  0.3158 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.84 
 
 
262 aa  115  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1409  naphthoate synthase  33.61 
 
 
279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4044  enoyl-CoA hydratase  31.93 
 
 
267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.77 
 
 
269 aa  115  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0895373 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2567  naphthoate synthase  33.19 
 
 
279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.522143  normal  0.0403307 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.5 
 
 
265 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 
254 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  30.21 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  34.84 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.66 
 
 
273 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.94 
 
 
270 aa  113  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  31.12 
 
 
263 aa  112  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.7 
 
 
258 aa  112  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4596  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.4 
 
 
255 aa  112  9e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.9625 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.9 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.19 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  32.91 
 
 
266 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.48 
 
 
256 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11500  enoyl-CoA hydratase  34.09 
 
 
285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.708034  normal  0.0989201 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.62 
 
 
260 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.77 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.18 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2075  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.53 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165609 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.78 
 
 
662 aa  110  3e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2706  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.34 
 
 
296 aa  109  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0149839 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.19 
 
 
265 aa  109  5e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4992  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.22 
 
 
272 aa  109  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31 
 
 
263 aa  108  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.18 
 
 
265 aa  108  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  34.82 
 
 
270 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1707  naphthoate synthase  32.77 
 
 
276 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  30.84 
 
 
277 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  32.14 
 
 
259 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0995  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.73 
 
 
263 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.32 
 
 
259 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.05 
 
 
662 aa  108  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.84 
 
 
259 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4763  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
265 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254643  normal  0.582812 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  33.94 
 
 
266 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.02 
 
 
260 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.4 
 
 
259 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0341  enoyl-CoA hydratase  30.96 
 
 
302 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0636518  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  34.48 
 
 
661 aa  107  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.65 
 
 
257 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>