More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1612 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1612  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 298 aa  621  1e-177  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.83 
 
 		 297 aa  351  7e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4005  enoyl-CoA hydratase  53.87 
 
 		 282 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0939626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1240  enoyl-CoA hydratase  55.51 
 
 		 282 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1431  enoyl-CoA hydratase  53.41 
 
 		 282 aa  288  9e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2616  enoyl-CoA hydratase  53.41 
 
 		 281 aa  252  6e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.807591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4614  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.58 
 
 		 283 aa  252  6e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2815  enoyl-CoA hydratase  51.41 
 
 		 281 aa  246  4e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  hitchhiker  0.00311628 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2156  enoyl-CoA hydratase  48.06 
 
 		 318 aa  245  8e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3837  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.5 
 
 		 300 aa  239  5e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1560  enoyl-CoA hydratase  46.99 
 
 		 295 aa  238  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1434  enoyl-CoA hydratase  45.85 
 
 		 308 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2349  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.41 
 
 		 285 aa  237  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0950973  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0929  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.89 
 
 		 312 aa  231  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5190  enoyl-CoA hydratase  48.66 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543929  normal  0.0605962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1621  enoyl-CoA hydratase  45.19 
 
 		 302 aa  215  8e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1568  enoyl-CoA hydratase  47.47 
 
 		 301 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562799  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4607  enoyl-CoA hydratase  46.69 
 
 		 298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.995784  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4695  enoyl-CoA hydratase  46.69 
 
 		 298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.325872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4990  enoyl-CoA hydratase  46.3 
 
 		 298 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.493737 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4297  enoyl-CoA hydratase  43.77 
 
 		 263 aa  210  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3753  enoyl-CoA hydratase  45.39 
 
 		 299 aa  208  7e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2433  enoyl-CoA hydratase  44.53 
 
 		 260 aa  206  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707416  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3765  enoyl-CoA hydratase  45.28 
 
 		 260 aa  205  8e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3753  enoyl-CoA hydratase  44.91 
 
 		 260 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.252883  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3826  enoyl-CoA hydratase  44.91 
 
 		 260 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.969771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4219  enoyl-CoA hydratase  43.4 
 
 		 260 aa  202  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851396 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2067  enoyl-CoA hydratase  47.74 
 
 		 278 aa  201  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2709  enoyl-CoA hydratase  44.36 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2924  enoyl-CoA hydratase  42.41 
 
 		 269 aa  189  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11964  enoyl-CoA hydratase  42.21 
 
 		 318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111135  normal  0.793618 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4005  enoyl-CoA hydratase  41.35 
 
 		 302 aa  179  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1977  enoyl-CoA hydratase  42.74 
 
 		 267 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.793656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0841  enoyl-CoA hydratase  42.13 
 
 		 272 aa  172  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0700  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.89 
 
 		 290 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0515033  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.48 
 
 		 256 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  34.56 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.57 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4085  enoyl-CoA hydratase  34.41 
 
 		 276 aa  118  9e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.285482  normal  0.481509 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0806  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.62 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0669988  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.33 
 
 		 258 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1854  short chain enoyl-CoA hydratase  36.89 
 
 		 258 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0810  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.17 
 
 		 269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748292  normal  0.305394 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5872  enoyl-CoA hydratase  35.27 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2009  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36 
 
 		 258 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2741  enoyl-CoA hydratase  32.81 
 
 		 276 aa  112  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411296 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1028  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.08 
 
 		 280 aa  112  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  35.27 
 
 		 259 aa  112  7.000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4005  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.248977  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  34.33 
 
 		 266 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.74 
 
 		 253 aa  109  5e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  33.19 
 
 		 260 aa  109  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  35.65 
 
 		 270 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4034  enoyl-CoA hydratase  31.56 
 
 		 270 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0896344 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0474  enoyl-CoA hydratase  35.04 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33170  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  32.92 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.119109  normal  0.701419 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.94 
 
 		 262 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11500  enoyl-CoA hydratase  29.17 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.708034  normal  0.0989201 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.02 
 
 		 266 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1753  naphthoate synthase  33.47 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 		 260 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6879  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 		 297 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0341  enoyl-CoA hydratase  31.76 
 
 		 302 aa  106  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0636518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 		 260 aa  106  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1879  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.03 
 
 		 259 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112004 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2320  enoyl-CoA hydratase  32.7 
 
 		 270 aa  106  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0702253  normal  0.0764248 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.95 
 
 		 255 aa  106  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1238  enoyl-CoA hydratase  33.76 
 
 		 274 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.4006  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.49 
 
 		 270 aa  105  7e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3569  naphthoate synthase  32.71 
 
 		 273 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.73 
 
 		 259 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.920346  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1945  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.73 
 
 		 259 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.8 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.02 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2482  enoyl-CoA hydratase  29.11 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1409  naphthoate synthase  33.85 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2445  enoyl-CoA hydratase  29.37 
 
 		 277 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2490  enoyl-CoA hydratase  29.37 
 
 		 277 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.154881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  30.56 
 
 		 273 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.26 
 
 		 265 aa  102  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  31.76 
 
 		 260 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  30.41 
 
 		 275 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.7 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0279  naphthoate synthase  33.33 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2535  naphthoate synthase  33.2 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2492  naphthoate synthase  33.2 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0682871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2651  naphthoate synthase  33.2 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0194594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2443  naphthoate synthase  33.2 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00319008  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.19 
 
 		 269 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2547  naphthoate synthase  33.2 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0659643  normal  0.90285 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  32.74 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  33.8 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0278  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  31.16 
 
 		 276 aa  100  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179195  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1221  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.03 
 
 		 273 aa  100  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212556  normal  0.0915283 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1591  naphthoate synthase  32.42 
 
 		 285 aa  99.4  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1484  naphthoate synthase  32.42 
 
 		 285 aa  99.4  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1783  naphthoate synthase  32.42 
 
 		 285 aa  99.4  6e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.485587 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0887  naphthoate synthase  32.92 
 
 		 273 aa  99.4  7e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2567  naphthoate synthase  32.28 
 
 		 279 aa  99.4  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.522143  normal  0.0403307 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>