More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5872 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5872  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 309 aa  643    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4005  enoyl-CoA hydratase  79.12 
 
 		 300 aa  494  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.248977  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0474  enoyl-CoA hydratase  57.35 
 
 		 292 aa  323  3e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2696  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.42 
 
 		 312 aa  254  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4282  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.9 
 
 		 328 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.963562  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1270  enoyl-CoA hydratase  45.39 
 
 		 302 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00698519  normal  0.828818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0976  enoyl-CoA hydratase  44.59 
 
 		 312 aa  252  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0994  enoyl-CoA hydratase  44.59 
 
 		 312 aa  252  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1004  enoyl-CoA hydratase  44.59 
 
 		 312 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.226874 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10687  enoyl-CoA hydratase  43.37 
 
 		 312 aa  247  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10462  enoyl-CoA hydratase  40.14 
 
 		 304 aa  202  4e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0780  enoyl-CoA hydratase  40.14 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0927737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2706  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.24 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0149839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0606  enoyl-CoA hydratase  39.66 
 
 		 300 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0557731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0615  enoyl-CoA hydratase  39.66 
 
 		 300 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0628  enoyl-CoA hydratase  39.66 
 
 		 300 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.756527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6879  enoyl-CoA hydratase  36.49 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5505  enoyl-CoA hydratase  38.27 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0341  enoyl-CoA hydratase  34.08 
 
 		 302 aa  150  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0636518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0321  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 		 287 aa  149  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.317267  normal  0.269459 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1028  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 280 aa  142  7e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3179  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.39 
 
 		 275 aa  125  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0806  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.22 
 
 		 273 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0669988  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.59 
 
 		 269 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0700  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.43 
 
 		 290 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0515033  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3350  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.58 
 
 		 273 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.219345 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0841  enoyl-CoA hydratase  33.71 
 
 		 272 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2616  enoyl-CoA hydratase  37 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.807591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3837  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.48 
 
 		 300 aa  118  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4614  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.09 
 
 		 283 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.52 
 
 		 256 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1612  enoyl-CoA hydratase  35.27 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.97 
 
 		 269 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1240  enoyl-CoA hydratase  34.58 
 
 		 282 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  32.71 
 
 		 259 aa  112  5e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2349  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.09 
 
 		 285 aa  112  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0950973  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4005  enoyl-CoA hydratase  34.75 
 
 		 282 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0939626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  34.21 
 
 		 659 aa  112  7.000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2554  enoyl-CoA hydratase  35.78 
 
 		 267 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1431  enoyl-CoA hydratase  33.61 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3633  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.11 
 
 		 269 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.23444  normal  0.3158 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2815  enoyl-CoA hydratase  35.68 
 
 		 281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  hitchhiker  0.00311628 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.98 
 
 		 268 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1938  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.27 
 
 		 271 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11964  enoyl-CoA hydratase  31.75 
 
 		 318 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111135  normal  0.793618 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4005  enoyl-CoA hydratase  32.4 
 
 		 302 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.06 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.04 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  30.31 
 
 		 260 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0929  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.03 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5190  enoyl-CoA hydratase  31.2 
 
 		 301 aa  106  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543929  normal  0.0605962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.32 
 
 		 257 aa  106  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.47 
 
 		 263 aa  106  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1977  enoyl-CoA hydratase  30.97 
 
 		 267 aa  105  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.793656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 		 251 aa  105  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1464  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.08 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.710715  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.37 
 
 		 260 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.92 
 
 		 258 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.05 
 
 		 252 aa  104  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.23 
 
 		 258 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.59 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.82 
 
 		 253 aa  104  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  33.48 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  30 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33170  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  29.8 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.119109  normal  0.701419 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.5 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4607  enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.995784  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4695  enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.325872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2812  enoyl-CoA hydratase  33.49 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.213847 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  33.97 
 
 		 270 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.49 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0518  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.43 
 
 		 280 aa  103  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2165  enoyl-CoA hydratase  34.42 
 
 		 280 aa  102  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4990  enoyl-CoA hydratase  30.34 
 
 		 298 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.493737 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1568  enoyl-CoA hydratase  31.2 
 
 		 301 aa  102  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562799  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2433  enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707416  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0481  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.08 
 
 		 270 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.19 
 
 		 271 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.4 
 
 		 259 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  34.06 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  29.72 
 
 		 264 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.7 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1666  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.47 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.458425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1621  enoyl-CoA hydratase  31.97 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5085  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.28 
 
 		 249 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.8 
 
 		 266 aa  100  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.34 
 
 		 271 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0878  response regulator receiver protein  29.72 
 
 		 259 aa  99.8  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.03 
 
 		 260 aa  99.8  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.4 
 
 		 259 aa  99.4  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.8 
 
 		 256 aa  99.4  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4219  enoyl-CoA hydratase  33.05 
 
 		 260 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851396 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2787  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.49 
 
 		 258 aa  99  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0757  enoyl-CoA hydratase  31.6 
 
 		 269 aa  99  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.01 
 
 		 261 aa  99  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  30.83 
 
 		 262 aa  98.6  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4297  enoyl-CoA hydratase  32.92 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4093  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.68 
 
 		 261 aa  98.6  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.11 
 
 		 275 aa  98.2  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>