More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2924 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2924  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
269 aa  560  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1621  enoyl-CoA hydratase  78.28 
 
 
302 aa  441  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4297  enoyl-CoA hydratase  56.98 
 
 
263 aa  295  5e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3765  enoyl-CoA hydratase  55.89 
 
 
260 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2433  enoyl-CoA hydratase  54.83 
 
 
260 aa  292  3e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707416  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4219  enoyl-CoA hydratase  54.44 
 
 
260 aa  292  4e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.851396 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3753  enoyl-CoA hydratase  55.51 
 
 
260 aa  291  7e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.252883  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3826  enoyl-CoA hydratase  55.51 
 
 
260 aa  291  7e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.969771  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2709  enoyl-CoA hydratase  56.27 
 
 
264 aa  290  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2067  enoyl-CoA hydratase  53.14 
 
 
278 aa  265  4e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4614  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.62 
 
 
283 aa  233  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1431  enoyl-CoA hydratase  48.24 
 
 
282 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1560  enoyl-CoA hydratase  48.25 
 
 
295 aa  228  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4005  enoyl-CoA hydratase  47.74 
 
 
282 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0939626  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3837  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.63 
 
 
300 aa  225  6e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2156  enoyl-CoA hydratase  44.98 
 
 
318 aa  224  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2616  enoyl-CoA hydratase  46.57 
 
 
281 aa  223  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.807591  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1977  enoyl-CoA hydratase  45.38 
 
 
267 aa  223  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.793656  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2815  enoyl-CoA hydratase  45.52 
 
 
281 aa  223  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  hitchhiker  0.00311628 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1240  enoyl-CoA hydratase  48.15 
 
 
282 aa  221  8e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220656  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1434  enoyl-CoA hydratase  46.69 
 
 
308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193072  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2349  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.68 
 
 
285 aa  217  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0950973  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0929  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.81 
 
 
312 aa  209  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11964  enoyl-CoA hydratase  42.16 
 
 
318 aa  209  5e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111135  normal  0.793618 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3753  enoyl-CoA hydratase  43.7 
 
 
299 aa  206  5e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5190  enoyl-CoA hydratase  43.77 
 
 
301 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543929  normal  0.0605962 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4990  enoyl-CoA hydratase  43.07 
 
 
298 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.493737 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1612  enoyl-CoA hydratase  41.95 
 
 
298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4607  enoyl-CoA hydratase  42.7 
 
 
298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.995784  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4695  enoyl-CoA hydratase  42.7 
 
 
298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.325872  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1568  enoyl-CoA hydratase  43.07 
 
 
301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562799  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4005  enoyl-CoA hydratase  40.93 
 
 
302 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0841  enoyl-CoA hydratase  40.31 
 
 
272 aa  193  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.41 
 
 
297 aa  188  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0806  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.92 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0669988  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  35.51 
 
 
263 aa  135  7.000000000000001e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
264 aa  130  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.33 
 
 
260 aa  129  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.76 
 
 
260 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.52 
 
 
256 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3350  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.39 
 
 
273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.219345 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.43 
 
 
263 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  34.06 
 
 
257 aa  126  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33170  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  33.92 
 
 
251 aa  125  8.000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.119109  normal  0.701419 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.96 
 
 
259 aa  124  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  32.17 
 
 
259 aa  124  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3179  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.75 
 
 
275 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608848  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4992  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.91 
 
 
272 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.33 
 
 
260 aa  123  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  33.77 
 
 
263 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.33 
 
 
260 aa  122  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  34.05 
 
 
260 aa  122  6e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.48 
 
 
266 aa  122  8e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2930  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.99 
 
 
264 aa  122  8e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1028  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.19 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0700  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.36 
 
 
290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0515033  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.4 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.49 
 
 
265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.43 
 
 
259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.84 
 
 
258 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0321  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.27 
 
 
287 aa  119  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.317267  normal  0.269459 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5505  enoyl-CoA hydratase  32.94 
 
 
293 aa  119  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1938  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.07 
 
 
271 aa  118  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  33.91 
 
 
257 aa  118  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  35.43 
 
 
258 aa  118  9e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6879  enoyl-CoA hydratase  34.73 
 
 
297 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  37.85 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2567  naphthoate synthase  36.84 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.522143  normal  0.0403307 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  29.37 
 
 
263 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1753  naphthoate synthase  35.22 
 
 
274 aa  116  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.04 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1210  naphthoate synthase  35.48 
 
 
271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0474  enoyl-CoA hydratase  34.16 
 
 
292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.65 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.95 
 
 
255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  32.59 
 
 
661 aa  115  5e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1216  naphthoate synthase  35.22 
 
 
274 aa  115  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0182076  hitchhiker  0.000174974 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  29.37 
 
 
263 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.05 
 
 
260 aa  116  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.63 
 
 
258 aa  116  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1409  naphthoate synthase  36.84 
 
 
279 aa  115  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  32.11 
 
 
258 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.53 
 
 
259 aa  115  6e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2009  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.61 
 
 
258 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.11 
 
 
258 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.06 
 
 
260 aa  115  6e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  36.57 
 
 
270 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.42 
 
 
260 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.62 
 
 
261 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4299  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  36.09 
 
 
265 aa  115  8.999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  34.27 
 
 
275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.48 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.74 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.04 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1430  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  33.94 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  32.46 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  33.48 
 
 
257 aa  113  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  34.06 
 
 
259 aa  113  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>