More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5505 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5505  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 293 aa  599  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6879  enoyl-CoA hydratase  58.36 
 
 		 297 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0341  enoyl-CoA hydratase  50.17 
 
 		 302 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0636518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0474  enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 		 292 aa  178  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1004  enoyl-CoA hydratase  38.33 
 
 		 312 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.226874 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1270  enoyl-CoA hydratase  39.25 
 
 		 302 aa  175  8e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00698519  normal  0.828818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0976  enoyl-CoA hydratase  38.33 
 
 		 312 aa  175  9e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0994  enoyl-CoA hydratase  38.33 
 
 		 312 aa  175  9e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4282  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.04 
 
 		 328 aa  169  5e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.963562  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10687  enoyl-CoA hydratase  36.18 
 
 		 312 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2696  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.24 
 
 		 312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4005  enoyl-CoA hydratase  38.66 
 
 		 300 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.248977  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5872  enoyl-CoA hydratase  38.27 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1028  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.29 
 
 		 280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2706  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 		 296 aa  149  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0149839 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0780  enoyl-CoA hydratase  33.69 
 
 		 300 aa  136  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0927737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3179  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.65 
 
 		 275 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0606  enoyl-CoA hydratase  34.69 
 
 		 300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0557731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0615  enoyl-CoA hydratase  34.69 
 
 		 300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0628  enoyl-CoA hydratase  34.69 
 
 		 300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.756527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10462  enoyl-CoA hydratase  31.07 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0321  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.83 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.317267  normal  0.269459 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2433  enoyl-CoA hydratase  34.63 
 
 		 260 aa  123  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707416  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4219  enoyl-CoA hydratase  34.63 
 
 		 260 aa  123  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851396 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.15 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33170  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  31 
 
 		 251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.119109  normal  0.701419 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  32.48 
 
 		 259 aa  118  9e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3837  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.17 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3350  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.14 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.219345 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0806  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 		 273 aa  116  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0669988  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1938  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.34 
 
 		 271 aa  116  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4614  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.57 
 
 		 283 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0962  enoyl-CoA hydratase  30.47 
 
 		 261 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.663833 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0929  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.59 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  30.88 
 
 		 264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1621  enoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 		 302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2709  enoyl-CoA hydratase  36.21 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3765  enoyl-CoA hydratase  34.2 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3753  enoyl-CoA hydratase  34.2 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.252883  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3826  enoyl-CoA hydratase  34.2 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.969771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  32.34 
 
 		 264 aa  112  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  31.58 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.19 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4688  enoyl-CoA hydratase  31.23 
 
 		 261 aa  109  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.484689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3633  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.06 
 
 		 269 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.23444  normal  0.3158 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3560  enoyl-CoA hydratase  29.43 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal  0.681353 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  29.85 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0310  enoyl-CoA hydratase  30.98 
 
 		 268 aa  107  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2924  enoyl-CoA hydratase  33.74 
 
 		 269 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0700  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.95 
 
 		 290 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0515033  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2067  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 278 aa  106  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.63 
 
 		 269 aa  106  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2815  enoyl-CoA hydratase  34.17 
 
 		 281 aa  105  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  hitchhiker  0.00311628 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0341  enoyl-CoA hydratase  30.04 
 
 		 268 aa  105  9e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4005  enoyl-CoA hydratase  31.02 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0939626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2616  enoyl-CoA hydratase  34.06 
 
 		 281 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.807591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 		 259 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0804  enoyl-CoA hydratase  30.08 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4297  enoyl-CoA hydratase  32.62 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0469  enoyl-CoA hydratase  30.08 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0652  enoyl-CoA hydratase  30.08 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.572722  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1240  enoyl-CoA hydratase  31.02 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1957  enoyl-CoA hydratase  30.08 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2054  enoyl-CoA hydratase  30.08 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577425  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1606  enoyl-CoA hydratase  30.08 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0540  enoyl-CoA hydratase  30.08 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1014  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.54 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.108431 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1434  enoyl-CoA hydratase  32.2 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0949  enoyl-CoA hydratase  30.87 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362092  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  31.67 
 
 		 659 aa  103  4e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  32.08 
 
 		 661 aa  102  7e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1464  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29 
 
 		 279 aa  102  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.710715  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  32.44 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.19 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1431  enoyl-CoA hydratase  30.66 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0473  enoyl-CoA hydratase  30.13 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0841  enoyl-CoA hydratase  30.64 
 
 		 272 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.47 
 
 		 262 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2156  enoyl-CoA hydratase  30.83 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3481  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.98 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.05 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2761  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.32 
 
 		 261 aa  100  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.342506  normal  0.0137889 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17860  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  29.29 
 
 		 262 aa  99.8  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.213095  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3114  enoyl-CoA hydratase  32.51 
 
 		 258 aa  99.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000516225  normal  0.042562 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.06 
 
 		 257 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.06 
 
 		 257 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3528  enoyl-CoA hydratase  32.84 
 
 		 261 aa  99.4  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.06 
 
 		 257 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  33.62 
 
 		 259 aa  99  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2349  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 285 aa  99  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0950973  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2144  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.03 
 
 		 253 aa  99  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.03 
 
 		 258 aa  99  9e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.73 
 
 		 257 aa  99  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.45 
 
 		 260 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 		 264 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.44 
 
 		 269 aa  98.6  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.39 
 
 		 269 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.63 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0113  enoyl-CoA hydratase  32.81 
 
 		 262 aa  98.2  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.831408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  32.56 
 
 		 260 aa  98.6  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>