More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4282 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4282  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
328 aa  664    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.963562  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10687  enoyl-CoA hydratase  72.51 
 
 
312 aa  419  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0976  enoyl-CoA hydratase  70.07 
 
 
312 aa  417  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0994  enoyl-CoA hydratase  70.07 
 
 
312 aa  417  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1004  enoyl-CoA hydratase  69.73 
 
 
312 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.226874 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1270  enoyl-CoA hydratase  72.16 
 
 
302 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00698519  normal  0.828818 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2696  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.7 
 
 
312 aa  330  2e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0474  enoyl-CoA hydratase  49.32 
 
 
292 aa  276  4e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4005  enoyl-CoA hydratase  48.2 
 
 
300 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.248977  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5872  enoyl-CoA hydratase  46.9 
 
 
309 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0780  enoyl-CoA hydratase  36.58 
 
 
300 aa  186  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0927737  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10462  enoyl-CoA hydratase  36.51 
 
 
304 aa  185  9e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2706  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.76 
 
 
296 aa  179  5.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0149839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0606  enoyl-CoA hydratase  34.55 
 
 
300 aa  172  9e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0557731  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0615  enoyl-CoA hydratase  34.55 
 
 
300 aa  172  9e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0628  enoyl-CoA hydratase  34.55 
 
 
300 aa  172  9e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.756527  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5505  enoyl-CoA hydratase  37.04 
 
 
293 aa  169  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6879  enoyl-CoA hydratase  36.91 
 
 
297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0341  enoyl-CoA hydratase  33.89 
 
 
302 aa  155  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0636518  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1028  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.55 
 
 
280 aa  129  7.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1464  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.45 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.710715  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0321  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.49 
 
 
287 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.317267  normal  0.269459 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0929  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.45 
 
 
312 aa  112  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1666  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.65 
 
 
259 aa  112  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.458425  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  26.44 
 
 
259 aa  103  4e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1014  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.03 
 
 
269 aa  103  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.108431 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  29.1 
 
 
659 aa  102  7e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3837  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.7 
 
 
300 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3179  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.77 
 
 
275 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608848  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.34 
 
 
260 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0700  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.18 
 
 
290 aa  99.8  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0515033  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.61 
 
 
264 aa  99  9e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.36 
 
 
237 aa  97.8  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0071566  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4990  enoyl-CoA hydratase  29.41 
 
 
298 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.493737 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4607  enoyl-CoA hydratase  29.41 
 
 
298 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.995784  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4614  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.44 
 
 
283 aa  98.2  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4695  enoyl-CoA hydratase  29.41 
 
 
298 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.325872  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  28.06 
 
 
258 aa  97.4  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5190  enoyl-CoA hydratase  29.57 
 
 
301 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543929  normal  0.0605962 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1743  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  28.28 
 
 
663 aa  97.1  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.987316  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.12 
 
 
265 aa  96.7  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2156  enoyl-CoA hydratase  30.23 
 
 
318 aa  96.7  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1568  enoyl-CoA hydratase  30.16 
 
 
301 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562799  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4005  enoyl-CoA hydratase  34.31 
 
 
282 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0939626  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.47 
 
 
264 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1431  enoyl-CoA hydratase  34.31 
 
 
282 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.06 
 
 
266 aa  94  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1240  enoyl-CoA hydratase  34.73 
 
 
282 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220656  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4219  enoyl-CoA hydratase  31.13 
 
 
260 aa  94  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.851396 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4005  enoyl-CoA hydratase  28.89 
 
 
302 aa  94  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  27.46 
 
 
257 aa  94  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1977  enoyl-CoA hydratase  30.38 
 
 
267 aa  93.6  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.793656  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.18 
 
 
267 aa  93.6  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4163  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.03 
 
 
248 aa  93.2  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.941221  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11964  enoyl-CoA hydratase  29.7 
 
 
318 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111135  normal  0.793618 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0806  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.43 
 
 
273 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0669988  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.48 
 
 
258 aa  92.4  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.74 
 
 
263 aa  92.8  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17860  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  27.18 
 
 
262 aa  92  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.213095  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1560  enoyl-CoA hydratase  30.12 
 
 
295 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.93 
 
 
260 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1700  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 
268 aa  92  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.672867  hitchhiker  0.0000387176 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  27.46 
 
 
264 aa  91.3  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3765  enoyl-CoA hydratase  30.74 
 
 
260 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3753  enoyl-CoA hydratase  30.74 
 
 
260 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.252883  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3826  enoyl-CoA hydratase  30.74 
 
 
260 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.969771  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.25 
 
 
257 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2546  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 
259 aa  90.5  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0566  enoyl-CoA hydratase  28.5 
 
 
263 aa  90.5  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2433  enoyl-CoA hydratase  31.13 
 
 
260 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707416  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4085  enoyl-CoA hydratase  28.01 
 
 
276 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.285482  normal  0.481509 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.98 
 
 
261 aa  90.1  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33170  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  29.46 
 
 
251 aa  90.1  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.119109  normal  0.701419 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0481  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.47 
 
 
270 aa  90.1  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.01 
 
 
263 aa  90.1  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  28.03 
 
 
662 aa  89.4  8e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  27.35 
 
 
264 aa  89.4  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0278  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  27.59 
 
 
276 aa  89.4  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179195  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.7 
 
 
262 aa  89  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1612  enoyl-CoA hydratase  31.87 
 
 
298 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.52 
 
 
258 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  29.41 
 
 
259 aa  89  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3633  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.98 
 
 
269 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.23444  normal  0.3158 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0918  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  26.36 
 
 
657 aa  87.8  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.96 
 
 
259 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1256  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.61 
 
 
253 aa  88.2  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291293  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1434  enoyl-CoA hydratase  30.4 
 
 
308 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193072  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1621  enoyl-CoA hydratase  31.13 
 
 
302 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.09 
 
 
258 aa  88.2  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.64 
 
 
255 aa  88.2  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4596  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.3 
 
 
255 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.57 
 
 
260 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.57 
 
 
260 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3210  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  27.63 
 
 
275 aa  87.4  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.324324  normal  0.0213187 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.9 
 
 
269 aa  87.4  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  28.46 
 
 
257 aa  87  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.64 
 
 
259 aa  87  4e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4579  enoyl-CoA hydratase  28.63 
 
 
278 aa  87  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781565  normal  0.154982 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3350  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.62 
 
 
273 aa  86.7  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.219345 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  32.11 
 
 
260 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>