More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1256 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1256  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 253 aa  522  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4083  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  66.4 
 
 		 251 aa  345  5e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2768  enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.92 
 
 		 249 aa  322  5e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.995557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4100  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.26 
 
 		 252 aa  288  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5948  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.23 
 
 		 253 aa  265  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.495615  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17620  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  49.21 
 
 		 252 aa  232  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7111  putative enoyl-CoA hydratase  47.6 
 
 		 265 aa  228  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.131077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4780  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51 
 
 		 256 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3602  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.62 
 
 		 260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0475224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1912  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.22 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.42 
 
 		 271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1691  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.22 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3275  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.98 
 
 		 269 aa  179  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5249  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.56 
 
 		 273 aa  176  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0368  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.86 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  28.29 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0149  short chain enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.227059  normal  0.14158 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  30.31 
 
 		 659 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4763  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.54 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254643  normal  0.582812 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5509  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.14 
 
 		 265 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5352  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.14 
 
 		 265 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.6 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0949  enoyl-CoA hydratase  29.48 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362092  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0248  enoyl-CoA hydratase  31.71 
 
 		 262 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1606  enoyl-CoA hydratase  29.88 
 
 		 261 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0804  enoyl-CoA hydratase  29.88 
 
 		 261 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1957  enoyl-CoA hydratase  29.88 
 
 		 261 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0652  enoyl-CoA hydratase  29.88 
 
 		 261 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.572722  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0469  enoyl-CoA hydratase  29.88 
 
 		 261 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0540  enoyl-CoA hydratase  29.88 
 
 		 261 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4064  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 		 259 aa  112  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0816295  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2054  enoyl-CoA hydratase  29.88 
 
 		 261 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577425  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.96 
 
 		 263 aa  112  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  30.42 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0696  methylmalonyl-CoA decarboxylase  26.38 
 
 		 259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000012263 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1378  methylmalonyl-CoA decarboxylase  27.27 
 
 		 260 aa  108  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  31.1 
 
 		 259 aa  108  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3560  enoyl-CoA hydratase  29.96 
 
 		 261 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal  0.681353 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  29.08 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0684  methylmalonyl-CoA decarboxylase  26.56 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0753206  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.35 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_003296  RS05574  enoyl-CoA hydratase  32.52 
 
 		 266 aa  106  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.116145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  30.68 
 
 		 259 aa  106  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  28.11 
 
 		 260 aa  105  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.52 
 
 		 260 aa  105  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0341  enoyl-CoA hydratase  30.2 
 
 		 268 aa  105  6e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  26.88 
 
 		 262 aa  105  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0995  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.96 
 
 		 263 aa  105  9e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.71 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4159  enoyl-CoA hydratase  26.72 
 
 		 259 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.965459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  28.11 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.98 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2787  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.12 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1088  enoyl-CoA hydratase  31.58 
 
 		 268 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.571609  normal  0.014432 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0643  short chain enoyl-CoA hydratase  30.15 
 
 		 265 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0226779  normal  0.0998873 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5886  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.04 
 
 		 271 aa  102  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0569786  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2620  enoyl-CoA hydratase  28.57 
 
 		 266 aa  102  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124427  normal  0.0671536 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  28.74 
 
 		 661 aa  102  5e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5130  enoyl-CoA hydratase  29.67 
 
 		 268 aa  101  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.757985  normal  0.786684 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  28.35 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3723  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.21 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.736572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0473  enoyl-CoA hydratase  29.23 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0310  enoyl-CoA hydratase  29.8 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6299  short chain enoyl-CoA hydratase  29.44 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6476  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.34 
 
 		 463 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4260  enoyl-CoA hydratase  31.47 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1307  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.38 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.8 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  29.72 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5646  enoyl-CoA hydratase  31.17 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.906008 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0938  methylmalonyl-CoA decarboxylase  26.67 
 
 		 269 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.69 
 
 		 259 aa  99.8  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.25 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  28.9 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3831  enoyl-CoA hydratase  28 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.53 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3571  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.83 
 
 		 262 aa  99.8  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.751263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0459  methylmalonyl-CoA decarboxylase  26.67 
 
 		 269 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0897  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.29 
 
 		 265 aa  99.8  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.06 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0718  enoyl-CoA hydratase  30.08 
 
 		 263 aa  99.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471174  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 		 260 aa  99.8  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0900  methylmalonyl-CoA decarboxylase  26.27 
 
 		 269 aa  99.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2066  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.9 
 
 		 273 aa  99.4  5e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2077  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.22 
 
 		 272 aa  99.4  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158607  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  26.09 
 
 		 663 aa  99  6e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0829  enoyl-CoA hydratase  30.28 
 
 		 257 aa  99  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.69 
 
 		 258 aa  99  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.74 
 
 		 274 aa  99  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3468  enoyl-CoA hydratase  30.4 
 
 		 261 aa  98.6  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.364811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2009  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.68 
 
 		 258 aa  98.6  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0962  enoyl-CoA hydratase  26.05 
 
 		 261 aa  98.6  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.663833 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  27.09 
 
 		 662 aa  98.2  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0922  enoyl-CoA hydratase  32.4 
 
 		 264 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2182  enoyl-CoA hydratase  32.4 
 
 		 264 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  30.89 
 
 		 263 aa  97.8  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1670  enoyl-CoA hydratase  29.8 
 
 		 257 aa  98.2  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141752 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2136  enoyl-CoA hydratase  29.44 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.259318  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4044  enoyl-CoA hydratase  31.62 
 
 		 267 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3860  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.83 
 
 		 261 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.897739 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>