More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1691 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1691  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 260 aa  520  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3602  enoyl-CoA hydratase/isomerase  87.31 
 
 		 260 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0475224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1912  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  86.15 
 
 		 260 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  75.29 
 
 		 271 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7111  putative enoyl-CoA hydratase  68.75 
 
 		 265 aa  350  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.131077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3275  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.43 
 
 		 269 aa  245  4.9999999999999997e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4100  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.55 
 
 		 252 aa  237  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5249  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.04 
 
 		 273 aa  229  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5948  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.21 
 
 		 253 aa  218  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.495615  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4083  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.84 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1256  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.22 
 
 		 253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2768  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.87 
 
 		 249 aa  209  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.995557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17620  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  43.75 
 
 		 252 aa  195  7e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4780  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.94 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0368  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.19 
 
 		 253 aa  183  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.04 
 
 		 263 aa  137  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  37.45 
 
 		 661 aa  137  2e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  36 
 
 		 662 aa  135  7.000000000000001e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  36.4 
 
 		 662 aa  134  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3560  enoyl-CoA hydratase  35.6 
 
 		 261 aa  129  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal  0.681353 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3831  enoyl-CoA hydratase  36.25 
 
 		 258 aa  129  6e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0962  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 		 261 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.663833 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.54 
 
 		 262 aa  128  8.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.346332 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.27 
 
 		 662 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4688  enoyl-CoA hydratase  35.86 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.484689  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2066  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 		 273 aa  123  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0473  enoyl-CoA hydratase  35.16 
 
 		 260 aa  122  7e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  35.06 
 
 		 264 aa  122  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1464  enoyl-CoA hydratase  38.22 
 
 		 262 aa  121  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1346  enoyl-CoA hydratase  37.65 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577541  normal  0.0344191 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5267  enoyl-CoA hydratase  37.04 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2620  enoyl-CoA hydratase  34.02 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124427  normal  0.0671536 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  34.96 
 
 		 264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  34.68 
 
 		 257 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  34.68 
 
 		 257 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2787  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.14 
 
 		 258 aa  119  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  34.68 
 
 		 257 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 		 267 aa  119  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0310  enoyl-CoA hydratase  34.94 
 
 		 268 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34 
 
 		 254 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.17 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  32.81 
 
 		 659 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0804  enoyl-CoA hydratase  35.6 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1957  enoyl-CoA hydratase  35.6 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0469  enoyl-CoA hydratase  35.6 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1606  enoyl-CoA hydratase  35.6 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0540  enoyl-CoA hydratase  35.6 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0113  enoyl-CoA hydratase  36.8 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.831408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0652  enoyl-CoA hydratase  35.6 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.572722  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2054  enoyl-CoA hydratase  35.6 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577425  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5972  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 		 261 aa  116  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2927  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.48 
 
 		 273 aa  116  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3761  enoyl-CoA hydratase  34.92 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  0.940889 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.02 
 
 		 253 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4260  enoyl-CoA hydratase  35.55 
 
 		 256 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.53 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  30.89 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4159  enoyl-CoA hydratase  34.4 
 
 		 259 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.965459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3042  enoyl-CoA hydratase  34.66 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.421055  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  30.16 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  35.52 
 
 		 270 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.75 
 
 		 260 aa  112  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  33.73 
 
 		 263 aa  112  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0949  enoyl-CoA hydratase  35.2 
 
 		 261 aa  112  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362092  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.95 
 
 		 274 aa  112  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0341  enoyl-CoA hydratase  32.81 
 
 		 268 aa  111  9e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.84 
 
 		 265 aa  111  9e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.14 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.63 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5085  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.82 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0740  enoyl-CoA hydratase  37.14 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.54 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4064  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.78 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0816295  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.3 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  34.8 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.63 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3642  enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.84 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  31.43 
 
 		 265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_004310  BR0016  enoyl-CoA hydratase  35.6 
 
 		 264 aa  109  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 		 260 aa  109  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0013  enoyl-CoA hydratase  35.6 
 
 		 264 aa  109  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.76945  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1889  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.82 
 
 		 261 aa  108  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3291  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 		 263 aa  108  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3571  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.76 
 
 		 262 aa  108  9.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.751263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  34.77 
 
 		 275 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000379  methylglutaconyl-CoA hydratase  32.8 
 
 		 260 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3834  enoyl-CoA hydratase  33.08 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.75 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4110  short chain enoyl-CoA hydratase  34.51 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.741375  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0425  enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5229  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.73 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  31.97 
 
 		 257 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4721  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 		 262 aa  106  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0716  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.51 
 
 		 254 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.439165  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02414  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.15 
 
 		 266 aa  106  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.5 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>