More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2202 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_2202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
271 aa  544  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52559  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3602  enoyl-CoA hydratase/isomerase  76.45 
 
 
260 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0475224  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1912  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  76.74 
 
 
260 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1691  enoyl-CoA hydratase/isomerase  75.29 
 
 
260 aa  374  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7111  putative enoyl-CoA hydratase  71.54 
 
 
265 aa  360  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.131077  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4100  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.98 
 
 
252 aa  235  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050755  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3275  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.35 
 
 
269 aa  233  3e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5948  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.82 
 
 
253 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.495615  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4083  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.22 
 
 
251 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1256  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.82 
 
 
253 aa  218  7.999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291293  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5249  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.88 
 
 
273 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2768  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.86 
 
 
249 aa  203  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.995557  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17620  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  44.92 
 
 
252 aa  193  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4780  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.62 
 
 
256 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0368  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.33 
 
 
253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  38.87 
 
 
661 aa  146  3e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.63 
 
 
263 aa  138  7.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.85 
 
 
662 aa  134  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  35.63 
 
 
662 aa  133  3e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  35.23 
 
 
662 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2620  enoyl-CoA hydratase  34.68 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124427  normal  0.0671536 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  34.39 
 
 
659 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 
254 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6299  short chain enoyl-CoA hydratase  36.99 
 
 
266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  36.9 
 
 
267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  33.86 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.72 
 
 
271 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0016  enoyl-CoA hydratase  36.84 
 
 
264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0013  enoyl-CoA hydratase  36.84 
 
 
264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.76945  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.14 
 
 
271 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.346332 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.29 
 
 
258 aa  116  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.4 
 
 
260 aa  115  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4064  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.65 
 
 
259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0816295  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 
256 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.77 
 
 
257 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0649  enoyl-CoA hydratase  34.4 
 
 
261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.37 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.38 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  32.53 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.34 
 
 
258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.48 
 
 
263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.8 
 
 
251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.94 
 
 
259 aa  112  5e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3023  enoyl-CoA hydratase  31.2 
 
 
269 aa  112  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346174  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3834  enoyl-CoA hydratase  35.38 
 
 
262 aa  112  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3860  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.74 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.897739 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.58 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  31.06 
 
 
651 aa  111  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  29.32 
 
 
663 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0240  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.56 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.480745 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.16 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  32.97 
 
 
280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.63 
 
 
264 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4733  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.67 
 
 
259 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  33.74 
 
 
262 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  35.39 
 
 
260 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.88 
 
 
260 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2927  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.77 
 
 
273 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.92 
 
 
274 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.69 
 
 
266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0684  methylmalonyl-CoA decarboxylase  30.49 
 
 
259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0753206  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.93 
 
 
271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  31.5 
 
 
259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  32.65 
 
 
260 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.16 
 
 
260 aa  109  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4448  enoyl-CoA hydratase  33.98 
 
 
274 aa  109  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.519653  normal  0.153189 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0041  enoyl-CoA hydratase  36.03 
 
 
264 aa  109  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568565  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  34.26 
 
 
260 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3750  short chain enoyl-CoA hydratase  30.74 
 
 
257 aa  108  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0962  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 
261 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.663833 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
268 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3883  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.32 
 
 
262 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0303551  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0149  short chain enoyl-CoA hydratase  34.52 
 
 
266 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.227059  normal  0.14158 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  32.4 
 
 
260 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1645  short chain enoyl-CoA hydratase  36.54 
 
 
257 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5267  enoyl-CoA hydratase  33.83 
 
 
265 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3642  enoyl-CoA hydratase  34.13 
 
 
260 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 
259 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2805  enoyl-CoA hydratase  32.92 
 
 
273 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3831  enoyl-CoA hydratase  31.2 
 
 
258 aa  106  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0696  methylmalonyl-CoA decarboxylase  29.27 
 
 
259 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000012263 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.26 
 
 
260 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4688  enoyl-CoA hydratase  32.03 
 
 
261 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.484689  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2374  enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
262 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.69 
 
 
273 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2551  enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
262 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.56 
 
 
261 aa  106  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.92 
 
 
269 aa  106  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  33.98 
 
 
270 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  32.31 
 
 
260 aa  106  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 
263 aa  105  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  30.61 
 
 
259 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0113  enoyl-CoA hydratase  35.27 
 
 
262 aa  105  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.831408  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  33.86 
 
 
263 aa  105  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.26 
 
 
260 aa  105  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2552  enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
262 aa  105  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>