More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1912 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_1912  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
260 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3602  enoyl-CoA hydratase/isomerase  82.69 
 
 
260 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0475224  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1691  enoyl-CoA hydratase/isomerase  86.15 
 
 
260 aa  434  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  76.74 
 
 
271 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52559  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7111  putative enoyl-CoA hydratase  70.43 
 
 
265 aa  357  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.131077  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3275  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.62 
 
 
269 aa  249  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4100  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.33 
 
 
252 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050755  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5249  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.43 
 
 
273 aa  228  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5948  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.41 
 
 
253 aa  228  9e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.495615  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4083  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.03 
 
 
251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1256  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.22 
 
 
253 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291293  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2768  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.22 
 
 
249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.995557  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17620  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  45.24 
 
 
252 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4780  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.32 
 
 
256 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0368  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.01 
 
 
253 aa  177  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  38.43 
 
 
661 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  37.6 
 
 
662 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.65 
 
 
263 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  37.1 
 
 
662 aa  142  4e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  37.6 
 
 
662 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.36 
 
 
659 aa  140  3e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2620  enoyl-CoA hydratase  35.23 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124427  normal  0.0671536 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.55 
 
 
262 aa  133  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.346332 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  37.7 
 
 
267 aa  133  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0310  enoyl-CoA hydratase  36.58 
 
 
268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  34.14 
 
 
257 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3831  enoyl-CoA hydratase  36.47 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.8 
 
 
254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 
264 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3560  enoyl-CoA hydratase  35.98 
 
 
261 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal  0.681353 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2927  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
273 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1464  enoyl-CoA hydratase  39.37 
 
 
262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  35.25 
 
 
257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  34.92 
 
 
257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  34.92 
 
 
257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  34.92 
 
 
257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.8 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  31.75 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  36.8 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 
265 aa  126  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 
259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  36.8 
 
 
264 aa  125  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0962  enoyl-CoA hydratase  35.55 
 
 
261 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.663833 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0113  enoyl-CoA hydratase  37.89 
 
 
262 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.831408  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
265 aa  124  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4260  enoyl-CoA hydratase  36.72 
 
 
256 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
260 aa  123  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2066  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.22 
 
 
273 aa  123  4e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.07 
 
 
253 aa  122  4e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.12 
 
 
257 aa  122  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5267  enoyl-CoA hydratase  37.05 
 
 
265 aa  122  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  35.25 
 
 
260 aa  122  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.26 
 
 
258 aa  122  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 
261 aa  122  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  36.11 
 
 
260 aa  122  8e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.59 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.88 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.12 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0540  enoyl-CoA hydratase  34.51 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0804  enoyl-CoA hydratase  34.51 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0469  enoyl-CoA hydratase  34.51 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1957  enoyl-CoA hydratase  34.51 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0473  enoyl-CoA hydratase  35.14 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1606  enoyl-CoA hydratase  34.51 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0652  enoyl-CoA hydratase  34.51 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.572722  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35 
 
 
274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2054  enoyl-CoA hydratase  34.51 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577425  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.41 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
260 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0716  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.16 
 
 
254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.439165  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.11 
 
 
651 aa  119  4.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.48 
 
 
268 aa  119  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3642  enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 
260 aa  119  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4688  enoyl-CoA hydratase  34.4 
 
 
261 aa  119  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.484689  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  30.43 
 
 
663 aa  119  7e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  35.12 
 
 
257 aa  118  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 
271 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0740  enoyl-CoA hydratase  39.29 
 
 
261 aa  117  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.81 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.22 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_004310  BR0016  enoyl-CoA hydratase  36.44 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4127  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.7 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128801  normal  0.190874 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  36.22 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0013  enoyl-CoA hydratase  36.44 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.76945  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.2 
 
 
263 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  33.74 
 
 
259 aa  117  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0718  enoyl-CoA hydratase  38.34 
 
 
263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471174  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  34.66 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.01 
 
 
251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4733  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.78 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0949  enoyl-CoA hydratase  34.12 
 
 
261 aa  115  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362092  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4110  short chain enoyl-CoA hydratase  35.69 
 
 
265 aa  116  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.741375  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.2 
 
 
263 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.97 
 
 
257 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.88 
 
 
258 aa  115  7.999999999999999e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0341  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
268 aa  115  7.999999999999999e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5972  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.72 
 
 
261 aa  115  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  32.41 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>