More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4100 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4100  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 252 aa  511  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5948  enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.29 
 
 		 253 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.495615  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4083  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.04 
 
 		 251 aa  296  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1256  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.26 
 
 		 253 aa  288  4e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2768  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.91 
 
 		 249 aa  282  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.995557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4780  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.22 
 
 		 256 aa  260  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1912  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.33 
 
 		 260 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3602  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.58 
 
 		 260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0475224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.2 
 
 		 271 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1691  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.55 
 
 		 260 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7111  putative enoyl-CoA hydratase  48 
 
 		 265 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.131077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17620  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  46.77 
 
 		 252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3275  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.13 
 
 		 269 aa  192  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5249  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.44 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0368  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.74 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.04 
 
 		 251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.87 
 
 		 263 aa  112  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1378  methylmalonyl-CoA decarboxylase  31.23 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  31.37 
 
 		 659 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.35 
 
 		 260 aa  108  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3860  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.06 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.897739 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2907  enoyl-CoA hydratase  32.03 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0248  enoyl-CoA hydratase  32.41 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  30.16 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3363  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.56 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05574  enoyl-CoA hydratase  32.81 
 
 		 266 aa  106  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.116145 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  32.42 
 
 		 260 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  30.35 
 
 		 661 aa  104  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5130  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.757985  normal  0.786684 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4763  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.61 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254643  normal  0.582812 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  31.08 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3831  enoyl-CoA hydratase  31.6 
 
 		 258 aa  103  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3571  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.41 
 
 		 262 aa  102  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.751263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5646  enoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 		 272 aa  102  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.906008 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0149  short chain enoyl-CoA hydratase  33.61 
 
 		 266 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.227059  normal  0.14158 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5352  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 		 265 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5509  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 		 265 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1088  enoyl-CoA hydratase  32.81 
 
 		 268 aa  102  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.571609  normal  0.014432 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  31.08 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1675  enoyl-CoA hydratase  32.67 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0299  enoyl-CoA hydratase  30.65 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1318  enoyl-CoA hydratase  30.27 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0902  enoyl-CoA hydratase  31.42 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2750  enoyl-CoA hydratase  30.12 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  31.47 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  30.08 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3660  enoyl-CoA hydratase  32.41 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3534  methylmalonyl-CoA decarboxylase  27.24 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.53 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3572  enoyl-CoA hydratase  34.39 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4064  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0816295  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0684  methylmalonyl-CoA decarboxylase  27.17 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0753206  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0718  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 		 263 aa  99.4  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471174  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.14 
 
 		 261 aa  99.4  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  29.08 
 
 		 257 aa  99.4  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2787  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.57 
 
 		 258 aa  99  6e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  30.4 
 
 		 259 aa  97.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2066  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.45 
 
 		 273 aa  98.2  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.4 
 
 		 258 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  31.15 
 
 		 264 aa  97.4  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2620  enoyl-CoA hydratase  29.6 
 
 		 266 aa  97.8  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124427  normal  0.0671536 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4688  enoyl-CoA hydratase  28.24 
 
 		 261 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.484689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0310  enoyl-CoA hydratase  29.96 
 
 		 268 aa  97.1  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0473  enoyl-CoA hydratase  30.31 
 
 		 260 aa  96.7  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0696  methylmalonyl-CoA decarboxylase  25.9 
 
 		 259 aa  96.7  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000012263 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0962  enoyl-CoA hydratase  28.9 
 
 		 261 aa  96.3  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.663833 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4090  enoyl-CoA hydratase  31.23 
 
 		 265 aa  96.3  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.157339  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3977  enoyl-CoA hydratase  31.23 
 
 		 265 aa  96.3  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0804  enoyl-CoA hydratase  29.84 
 
 		 261 aa  95.9  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0469  enoyl-CoA hydratase  29.84 
 
 		 261 aa  95.9  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0652  enoyl-CoA hydratase  29.84 
 
 		 261 aa  95.9  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.572722  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0540  enoyl-CoA hydratase  29.84 
 
 		 261 aa  95.9  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2054  enoyl-CoA hydratase  29.84 
 
 		 261 aa  95.9  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577425  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1957  enoyl-CoA hydratase  29.84 
 
 		 261 aa  95.9  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1606  enoyl-CoA hydratase  29.84 
 
 		 261 aa  95.9  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1346  enoyl-CoA hydratase  30.98 
 
 		 288 aa  95.9  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577541  normal  0.0344191 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.8 
 
 		 254 aa  95.5  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5886  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.65 
 
 		 271 aa  95.5  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0569786  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5327  enoyl-CoA hydratase  32.41 
 
 		 263 aa  95.1  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0280176  normal  0.0376656 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3408  enoyl-CoA hydratase  32.41 
 
 		 263 aa  95.1  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4959  enoyl-CoA hydratase  32.41 
 
 		 263 aa  95.1  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.12 
 
 		 258 aa  95.1  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  28.68 
 
 		 662 aa  95.1  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2182  enoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  31.2 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0949  enoyl-CoA hydratase  28.91 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362092  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0830  enoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.831593  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0341  enoyl-CoA hydratase  30.2 
 
 		 268 aa  94.4  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0922  enoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3560  enoyl-CoA hydratase  30 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal  0.681353 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1670  enoyl-CoA hydratase  31.87 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141752 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3761  enoyl-CoA hydratase  29.18 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  0.940889 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.21 
 
 		 274 aa  94.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3042  enoyl-CoA hydratase  29.37 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.421055  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  28.63 
 
 		 662 aa  94.4  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  30.24 
 
 		 263 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  30.24 
 
 		 263 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  30.24 
 
 		 263 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>