More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3534 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3534  methylmalonyl-CoA decarboxylase  100 
 
 		 259 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0696  methylmalonyl-CoA decarboxylase  66.41 
 
 		 259 aa  374  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000012263 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0684  methylmalonyl-CoA decarboxylase  67.18 
 
 		 259 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0753206  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1378  methylmalonyl-CoA decarboxylase  59.23 
 
 		 260 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2461  methylmalonyl-CoA decarboxylase  52.12 
 
 		 259 aa  296  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000140768 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1611  methylmalonyl-CoA decarboxylase  52.33 
 
 		 271 aa  288  5.0000000000000004e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3341  methylmalonyl-CoA decarboxylase  47.45 
 
 		 261 aa  268  5e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02750  methylmalonyl-CoA decarboxylase, biotin-independent  47.45 
 
 		 261 aa  268  8e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.45 
 
 		 261 aa  268  8e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3246  methylmalonyl-CoA decarboxylase  47.45 
 
 		 261 aa  268  8e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0791  methylmalonyl-CoA decarboxylase  47.45 
 
 		 261 aa  268  8e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02713  hypothetical protein  47.45 
 
 		 261 aa  268  8e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3055  methylmalonyl-CoA decarboxylase  47.45 
 
 		 261 aa  268  8e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3077  methylmalonyl-CoA decarboxylase  47.45 
 
 		 261 aa  268  8e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4215  methylmalonyl-CoA decarboxylase  47.45 
 
 		 261 aa  268  8e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2996  methylmalonyl-CoA decarboxylase  43.75 
 
 		 266 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4040  methylmalonyl-CoA decarboxylase  42 
 
 		 269 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.642217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0938  methylmalonyl-CoA decarboxylase  42.4 
 
 		 269 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0459  methylmalonyl-CoA decarboxylase  42.4 
 
 		 269 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0900  methylmalonyl-CoA decarboxylase  41.6 
 
 		 269 aa  208  9e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2620  enoyl-CoA hydratase  31.62 
 
 		 266 aa  133  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124427  normal  0.0671536 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.85 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2485  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.27 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.380203 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3742  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.2 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.262023  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  32.18 
 
 		 263 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  32.18 
 
 		 263 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  32.18 
 
 		 263 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  32.18 
 
 		 263 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  32.18 
 
 		 263 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  32.18 
 
 		 263 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  32.18 
 
 		 263 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1048  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.87 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3883  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.4 
 
 		 262 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0303551  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  30.38 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3799  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.4 
 
 		 262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0645207  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3860  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.6 
 
 		 261 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.897739 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  28.41 
 
 		 257 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  30.43 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  29.72 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.52 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3023  enoyl-CoA hydratase  30.28 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346174  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.62 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02414  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.5 
 
 		 266 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3360  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.3 
 
 		 269 aa  112  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439812  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.2 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4632  enoyl-CoA hydratase  27.59 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0403181  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0603  enoyl-CoA hydratase  27.59 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  31.64 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  31.64 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4448  enoyl-CoA hydratase  31.01 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.519653  normal  0.153189 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0341  enoyl-CoA hydratase  29.01 
 
 		 268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.46 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4352  enoyl-CoA hydratase  27.59 
 
 		 258 aa  109  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2066  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.73 
 
 		 273 aa  108  6e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  28.29 
 
 		 257 aa  108  8.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  27.73 
 
 		 260 aa  108  8.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.52 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  27.73 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3761  enoyl-CoA hydratase  29.92 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  0.940889 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4596  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.08 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4651  enoyl-CoA hydratase  26.82 
 
 		 258 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4420  enoyl-CoA hydratase  26.82 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4259  enoyl-CoA hydratase  26.82 
 
 		 258 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4271  enoyl-CoA hydratase  26.82 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.23 
 
 		 261 aa  106  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4761  enoyl-CoA hydratase  26.82 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.642301  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.96 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4636  enoyl-CoA hydratase  26.82 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  30.98 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4652  enoyl-CoA hydratase  26.82 
 
 		 258 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  29.8 
 
 		 659 aa  106  4e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3042  enoyl-CoA hydratase  29.92 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.421055  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  28.9 
 
 		 260 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.48 
 
 		 260 aa  105  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.2 
 
 		 258 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.69 
 
 		 260 aa  105  9e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.64 
 
 		 255 aa  105  9e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4763  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.58 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254643  normal  0.582812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2805  enoyl-CoA hydratase  25.94 
 
 		 273 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4159  enoyl-CoA hydratase  28.14 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.965459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.06 
 
 		 268 aa  104  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  29.76 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4012  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.44 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  29.39 
 
 		 651 aa  103  3e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0429  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.64 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.297367 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  30.95 
 
 		 266 aa  103  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  29.13 
 
 		 264 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  27.45 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  30.45 
 
 		 261 aa  102  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5509  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.2 
 
 		 265 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.18 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.85 
 
 		 262 aa  102  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5352  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.2 
 
 		 265 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  27.2 
 
 		 278 aa  102  6e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2359  enoyl-CoA hydratase  28.12 
 
 		 262 aa  102  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  28.35 
 
 		 261 aa  102  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0310  enoyl-CoA hydratase  27.09 
 
 		 268 aa  101  9e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  27.92 
 
 		 662 aa  102  9e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  30.54 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2207  enoyl-CoA hydratase  31.13 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130556  hitchhiker  0.0060069 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>