More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1378 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1378  methylmalonyl-CoA decarboxylase  100 
 
 		 260 aa  541  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0684  methylmalonyl-CoA decarboxylase  61.54 
 
 		 259 aa  345  4e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0753206  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0696  methylmalonyl-CoA decarboxylase  60.77 
 
 		 259 aa  343  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000012263 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3534  methylmalonyl-CoA decarboxylase  59.23 
 
 		 259 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2461  methylmalonyl-CoA decarboxylase  50.59 
 
 		 259 aa  278  7e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000140768 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3341  methylmalonyl-CoA decarboxylase  48.82 
 
 		 261 aa  267  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02750  methylmalonyl-CoA decarboxylase, biotin-independent  49.2 
 
 		 261 aa  266  4e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.2 
 
 		 261 aa  266  4e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4215  methylmalonyl-CoA decarboxylase  49.2 
 
 		 261 aa  266  4e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3246  methylmalonyl-CoA decarboxylase  49.2 
 
 		 261 aa  266  4e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02713  hypothetical protein  49.2 
 
 		 261 aa  266  4e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0791  methylmalonyl-CoA decarboxylase  49.2 
 
 		 261 aa  266  4e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3077  methylmalonyl-CoA decarboxylase  49.2 
 
 		 261 aa  266  4e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3055  methylmalonyl-CoA decarboxylase  49.2 
 
 		 261 aa  266  4e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1611  methylmalonyl-CoA decarboxylase  50.19 
 
 		 271 aa  264  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2996  methylmalonyl-CoA decarboxylase  41.27 
 
 		 266 aa  202  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0459  methylmalonyl-CoA decarboxylase  37.3 
 
 		 269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0938  methylmalonyl-CoA decarboxylase  37.3 
 
 		 269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4040  methylmalonyl-CoA decarboxylase  37.3 
 
 		 269 aa  186  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.642217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0900  methylmalonyl-CoA decarboxylase  35.91 
 
 		 269 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2620  enoyl-CoA hydratase  31.44 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124427  normal  0.0671536 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.76 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.83 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2805  enoyl-CoA hydratase  31.56 
 
 		 273 aa  135  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  34.23 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3742  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.08 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.262023  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3023  enoyl-CoA hydratase  32.4 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.95 
 
 		 268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.8 
 
 		 263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4012  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.1 
 
 		 258 aa  129  7.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  31.91 
 
 		 260 aa  128  9.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2485  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.65 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.380203 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.21 
 
 		 263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5249  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4448  enoyl-CoA hydratase  32.81 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.519653  normal  0.153189 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.74 
 
 		 265 aa  125  8.000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.13 
 
 		 267 aa  123  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  29.37 
 
 		 265 aa  123  3e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 		 263 aa  123  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0268  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.02 
 
 		 261 aa  122  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.21713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3883  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.31 
 
 		 262 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0303551  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.13 
 
 		 260 aa  122  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  29.89 
 
 		 260 aa  122  8e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.97 
 
 		 260 aa  122  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1753  naphthoate synthase  31.84 
 
 		 274 aa  121  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3799  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.31 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0645207  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.44 
 
 		 273 aa  121  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3860  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.04 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.897739 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.03 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0649  enoyl-CoA hydratase  32.05 
 
 		 261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 		 253 aa  119  6e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1048  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.99 
 
 		 265 aa  118  7e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.86 
 
 		 260 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4984  naphthoate synthase  31.46 
 
 		 272 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.269846  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2768  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.85 
 
 		 249 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.995557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.95 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  29.17 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  31.13 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0570  naphthoate synthase  30 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  29.7 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  31.7 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  26.32 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0254  naphthoate synthase  31.34 
 
 		 272 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000397858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.2 
 
 		 259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  25.94 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0310  enoyl-CoA hydratase  29.96 
 
 		 268 aa  116  5e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  29.02 
 
 		 257 aa  115  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0341  enoyl-CoA hydratase  30.23 
 
 		 268 aa  115  5e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4748  naphthoate synthase  30.97 
 
 		 272 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4586  naphthoate synthase  30.97 
 
 		 272 aa  115  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  32.69 
 
 		 265 aa  115  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4966  naphthoate synthase  30.97 
 
 		 272 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5109  naphthoate synthase  30.97 
 
 		 272 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4695  naphthoate synthase  30.97 
 
 		 272 aa  115  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.62 
 
 		 260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5013  naphthoate synthase  30.6 
 
 		 272 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.15 
 
 		 262 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4995  naphthoate synthase  30.6 
 
 		 272 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.51 
 
 		 255 aa  115  8.999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4608  naphthoate synthase  30.71 
 
 		 272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4733  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.48 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  28.57 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0245  enoyl-CoA hydratase  29.5 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  32.17 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1162  naphthoate synthase  30.86 
 
 		 275 aa  113  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000676396 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3491  naphthoate synthase  29.48 
 
 		 272 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0328  naphthoate synthase  30.89 
 
 		 273 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0113118 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  28.34 
 
 		 259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2797  naphthoate synthase  29.26 
 
 		 272 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.86 
 
 		 260 aa  112  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  27.24 
 
 		 258 aa  112  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3457  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.68 
 
 		 249 aa  112  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.735617  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3664  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  30.95 
 
 		 271 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00705793  hitchhiker  0.000000000357336 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  29.53 
 
 		 262 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.25 
 
 		 261 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2077  naphthoate synthase  31.33 
 
 		 273 aa  112  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.310676 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  29.07 
 
 		 260 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.53 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  27.34 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>