More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2996 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2996  methylmalonyl-CoA decarboxylase  100 
 
 		 266 aa  536  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4040  methylmalonyl-CoA decarboxylase  68.8 
 
 		 269 aa  352  5e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.642217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0459  methylmalonyl-CoA decarboxylase  67.8 
 
 		 269 aa  345  4e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0938  methylmalonyl-CoA decarboxylase  67.8 
 
 		 269 aa  345  4e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0900  methylmalonyl-CoA decarboxylase  67.05 
 
 		 269 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1611  methylmalonyl-CoA decarboxylase  49.81 
 
 		 271 aa  264  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3534  methylmalonyl-CoA decarboxylase  43.75 
 
 		 259 aa  223  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0684  methylmalonyl-CoA decarboxylase  43.03 
 
 		 259 aa  216  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0753206  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0696  methylmalonyl-CoA decarboxylase  41.83 
 
 		 259 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000012263 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1378  methylmalonyl-CoA decarboxylase  41.27 
 
 		 260 aa  202  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2461  methylmalonyl-CoA decarboxylase  38.58 
 
 		 259 aa  191  9e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000140768 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02750  methylmalonyl-CoA decarboxylase, biotin-independent  38.96 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.96 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02713  hypothetical protein  38.96 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4215  methylmalonyl-CoA decarboxylase  38.96 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3077  methylmalonyl-CoA decarboxylase  38.96 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3341  methylmalonyl-CoA decarboxylase  38.96 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3055  methylmalonyl-CoA decarboxylase  38.96 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3246  methylmalonyl-CoA decarboxylase  38.96 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0791  methylmalonyl-CoA decarboxylase  38.96 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.4 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1048  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38 
 
 		 265 aa  136  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3742  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.21 
 
 		 262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.262023  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3860  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.15 
 
 		 261 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.897739 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3799  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.62 
 
 		 262 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0645207  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3883  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.15 
 
 		 262 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0303551  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2805  enoyl-CoA hydratase  32.94 
 
 		 273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 		 257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.82 
 
 		 260 aa  118  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  30.16 
 
 		 257 aa  112  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  35.46 
 
 		 261 aa  112  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3023  enoyl-CoA hydratase  28.15 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  35.16 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  32.31 
 
 		 260 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.01 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.38 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  31.87 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.71 
 
 		 270 aa  107  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.57 
 
 		 265 aa  106  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.84 
 
 		 258 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  32.94 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31 
 
 		 266 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2620  enoyl-CoA hydratase  29.3 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124427  normal  0.0671536 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.87 
 
 		 273 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4733  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.47 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2195  short chain enoyl-CoA hydratase  31.37 
 
 		 257 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000647858  hitchhiker  0.00875803 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  28.11 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.89 
 
 		 261 aa  102  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4012  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.3 
 
 		 258 aa  102  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.03 
 
 		 260 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2485  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.56 
 
 		 260 aa  102  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.380203 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3834  enoyl-CoA hydratase  32.48 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  30.57 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0149  short chain enoyl-CoA hydratase  34.65 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.227059  normal  0.14158 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.63 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  32.06 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 		 251 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  28.74 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  32.53 
 
 		 259 aa  99.8  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  31.94 
 
 		 257 aa  99.4  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  30.08 
 
 		 275 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  30.83 
 
 		 260 aa  99.4  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  32.21 
 
 		 261 aa  99  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.37 
 
 		 260 aa  99.4  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  34.62 
 
 		 261 aa  99  8e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4763  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.26 
 
 		 265 aa  98.6  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254643  normal  0.582812 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  26.62 
 
 		 262 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.8 
 
 		 255 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2136  enoyl-CoA hydratase  32.81 
 
 		 260 aa  98.6  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.259318  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.71 
 
 		 275 aa  98.2  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.2 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  30.8 
 
 		 255 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  31.71 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  30.8 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 257 aa  97.8  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  26.42 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00780  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.64 
 
 		 260 aa  96.7  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0697189  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5876  enoyl-CoA hydratase  31.75 
 
 		 268 aa  97.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  30.8 
 
 		 255 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2990  enoyl-CoA hydratase  34.27 
 
 		 269 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241873 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.89 
 
 		 260 aa  96.7  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.77 
 
 		 258 aa  95.9  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5352  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 		 265 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0268  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.72 
 
 		 261 aa  95.9  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.21713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5509  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 		 265 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4560  short chain enoyl-CoA hydratase  30.38 
 
 		 256 aa  95.9  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127005  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  31.4 
 
 		 260 aa  95.5  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.09 
 
 		 267 aa  95.5  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1912  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.64 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0993  enoyl-CoA hydratase  34.68 
 
 		 269 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  31.37 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  31.37 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  31.37 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  31.37 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2283  enoyl-CoA hydratase  31.58 
 
 		 261 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.03 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 258 aa  94  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  31.37 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.04 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>