More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2620 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2620  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
266 aa  542  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124427  normal  0.0671536 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4448  enoyl-CoA hydratase  49.81 
 
 
274 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.519653  normal  0.153189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3023  enoyl-CoA hydratase  45.11 
 
 
269 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346174  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2805  enoyl-CoA hydratase  46.24 
 
 
273 aa  222  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4012  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.52 
 
 
258 aa  190  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1048  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.6 
 
 
265 aa  183  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  40.55 
 
 
259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0268  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.68 
 
 
261 aa  181  8.000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.21713  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0245  enoyl-CoA hydratase  38.95 
 
 
260 aa  180  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.84 
 
 
251 aa  178  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2485  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.85 
 
 
260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.380203 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  37.94 
 
 
659 aa  171  9e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  35.89 
 
 
257 aa  167  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.31 
 
 
260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  38.19 
 
 
662 aa  165  8e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  36.29 
 
 
662 aa  163  3e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.08 
 
 
263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  36.92 
 
 
662 aa  162  6e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.84 
 
 
260 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  38.31 
 
 
663 aa  160  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.6 
 
 
260 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 
260 aa  159  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4733  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 
259 aa  159  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  35.57 
 
 
262 aa  159  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0149  short chain enoyl-CoA hydratase  39.6 
 
 
266 aa  158  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.227059  normal  0.14158 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3491  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.8 
 
 
260 aa  158  9e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  39.15 
 
 
258 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.11 
 
 
260 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.9 
 
 
262 aa  156  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.68 
 
 
260 aa  156  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.67 
 
 
259 aa  156  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4763  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 
265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254643  normal  0.582812 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  37.2 
 
 
661 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3188  enoyl-CoA hydratase  36.43 
 
 
262 aa  155  7e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485173  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.47 
 
 
258 aa  155  8e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.54 
 
 
260 aa  155  9e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 
260 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.96 
 
 
254 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5352  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.07 
 
 
265 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5509  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.07 
 
 
265 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  34.47 
 
 
263 aa  154  2e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  36.58 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5626  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 
265 aa  152  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0759622  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.74 
 
 
263 aa  152  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
267 aa  152  8e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3420  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 
261 aa  151  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.5 
 
 
264 aa  150  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.6 
 
 
260 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.6 
 
 
261 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3329  enoyl-CoA hydratase  35 
 
 
257 aa  150  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  36.55 
 
 
651 aa  149  6e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  39.22 
 
 
256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.75 
 
 
261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4064  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.04 
 
 
259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0816295  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1378  methylmalonyl-CoA decarboxylase  31.44 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0918  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  34.52 
 
 
657 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.25 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.8 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.91 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35 
 
 
258 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2795  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.18 
 
 
260 aa  146  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.425448  normal  0.531036 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.74 
 
 
265 aa  146  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.43 
 
 
262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2902  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  33.21 
 
 
650 aa  145  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.03 
 
 
259 aa  145  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  37.16 
 
 
258 aa  145  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.02 
 
 
259 aa  145  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3537  enoyl-CoA hydratase  34.1 
 
 
263 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50917e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3322  enoyl-CoA hydratase  34.1 
 
 
263 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3285  enoyl-CoA hydratase  34.1 
 
 
263 aa  145  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000573094  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1330  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
275 aa  145  6e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.71221 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3583  enoyl-CoA hydratase  34.1 
 
 
263 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0855  short chain enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 
263 aa  145  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248089  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 
269 aa  145  8.000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0240  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.11 
 
 
265 aa  145  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.480745 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2750  enoyl-CoA hydratase  36.18 
 
 
259 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.02 
 
 
260 aa  144  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2544  enoyl-CoA hydratase  35.48 
 
 
267 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.715875  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  38.1 
 
 
257 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.87 
 
 
260 aa  143  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36 
 
 
260 aa  144  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  33.72 
 
 
260 aa  143  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0222  enoyl-CoA hydratase  38.11 
 
 
253 aa  142  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.72 
 
 
259 aa  142  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.85 
 
 
265 aa  142  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0017  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
261 aa  142  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.99 
 
 
257 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.99 
 
 
257 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
260 aa  142  7e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.03 
 
 
260 aa  142  8e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  35.23 
 
 
263 aa  141  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  33.33 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1645  short chain enoyl-CoA hydratase  34.78 
 
 
257 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  33.83 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3237  enoyl-CoA hydratase  32.95 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6255  short chain enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6323  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.08 
 
 
261 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0881362  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1316  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.29 
 
 
260 aa  139  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.200035  normal  0.304816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>