More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3420 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009468  Acry_3420  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
261 aa  525  1e-148  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3329  enoyl-CoA hydratase  63.39 
 
 
257 aa  317  1e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1475  enoyl-CoA hydratase  63.77 
 
 
265 aa  295  6e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5727  enoyl-CoA hydratase  60.38 
 
 
265 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0364977  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0245  enoyl-CoA hydratase  51.75 
 
 
260 aa  251  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2913  enoyl-CoA hydratase  56.44 
 
 
270 aa  248  5e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.944224  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1773  enoyl-CoA hydratase  61.09 
 
 
263 aa  247  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1160  enoyl-CoA hydratase  59.7 
 
 
264 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293072  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2770  enoyl-CoA hydratase  59.16 
 
 
263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5112  enoyl-CoA hydratase  57.2 
 
 
274 aa  229  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.102718  normal  0.649242 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5190  enoyl-CoA hydratase  57.72 
 
 
274 aa  229  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00117238  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4649  enoyl-CoA hydratase  57.2 
 
 
274 aa  229  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.586545  normal  0.29144 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3188  enoyl-CoA hydratase  45.02 
 
 
262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485173  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2907  enoyl-CoA hydratase  45.85 
 
 
271 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2750  enoyl-CoA hydratase  46.18 
 
 
259 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2157  enoyl-CoA hydratase  43.62 
 
 
257 aa  209  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1330  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.96 
 
 
275 aa  205  6e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.71221 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.67 
 
 
262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1318  enoyl-CoA hydratase  41.34 
 
 
259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0628  enoyl-CoA hydratase  40.24 
 
 
259 aa  186  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.566194  normal  0.670194 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1048  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.7 
 
 
265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.08 
 
 
252 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6416  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.17 
 
 
254 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.38 
 
 
267 aa  155  7e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5626  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.06 
 
 
265 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0759622  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4448  enoyl-CoA hydratase  38.35 
 
 
274 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.519653  normal  0.153189 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  38.7 
 
 
260 aa  152  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4012  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.13 
 
 
258 aa  151  8.999999999999999e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2620  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 
266 aa  151  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124427  normal  0.0671536 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.36 
 
 
260 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.74 
 
 
260 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.74 
 
 
260 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.15 
 
 
254 aa  149  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.351238 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.33 
 
 
273 aa  148  9e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.54 
 
 
261 aa  148  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.32 
 
 
261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2805  enoyl-CoA hydratase  37.89 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  38.52 
 
 
278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3491  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.61 
 
 
260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.26 
 
 
259 aa  145  5e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  39.36 
 
 
258 aa  144  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.85 
 
 
260 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.38 
 
 
268 aa  143  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.85 
 
 
258 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.44 
 
 
258 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  40.45 
 
 
257 aa  142  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0224  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.94 
 
 
258 aa  143  4e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00100177  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.76 
 
 
259 aa  142  7e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.23 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3023  enoyl-CoA hydratase  37.6 
 
 
269 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346174  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  37.3 
 
 
260 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  36.9 
 
 
258 aa  140  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.47 
 
 
265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.22 
 
 
257 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.26 
 
 
258 aa  139  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6255  short chain enoyl-CoA hydratase  37.25 
 
 
259 aa  139  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.84 
 
 
257 aa  138  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2195  short chain enoyl-CoA hydratase  35.98 
 
 
257 aa  137  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000647858  hitchhiker  0.00875803 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.57 
 
 
260 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35 
 
 
260 aa  138  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.26 
 
 
260 aa  138  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.9 
 
 
264 aa  138  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
260 aa  137  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  36.12 
 
 
258 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 
257 aa  136  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 
257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.72 
 
 
259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  34.92 
 
 
257 aa  135  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2187  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.28 
 
 
266 aa  135  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000608326  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.38 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  37.79 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  38.4 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.73 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  34.35 
 
 
259 aa  133  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.14 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2872  enoyl-CoA hydratase  36.88 
 
 
258 aa  133  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000338858  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  38.55 
 
 
257 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  35.2 
 
 
251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
251 aa  132  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  33.72 
 
 
260 aa  132  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  36.78 
 
 
258 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 
263 aa  132  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.95 
 
 
662 aa  131  9e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  37.11 
 
 
659 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  36.09 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  36.8 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1645  short chain enoyl-CoA hydratase  38.61 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.53 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.31 
 
 
254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  36.26 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.36 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.25 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.5 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.86 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  36.92 
 
 
257 aa  130  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.08 
 
 
263 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.76 
 
 
265 aa  129  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.91 
 
 
260 aa  129  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  34.35 
 
 
258 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>