More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1318 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1318  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
259 aa  536  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0628  enoyl-CoA hydratase  81.08 
 
 
259 aa  431  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.566194  normal  0.670194 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2750  enoyl-CoA hydratase  48.41 
 
 
259 aa  259  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2907  enoyl-CoA hydratase  46.54 
 
 
271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1330  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.45 
 
 
275 aa  239  2.9999999999999997e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.71221 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0245  enoyl-CoA hydratase  45.08 
 
 
260 aa  228  6e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.1 
 
 
262 aa  227  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.22 
 
 
252 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3188  enoyl-CoA hydratase  41.25 
 
 
262 aa  206  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485173  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6416  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.08 
 
 
254 aa  204  9e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3420  enoyl-CoA hydratase  41.34 
 
 
261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3329  enoyl-CoA hydratase  38.02 
 
 
257 aa  192  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2913  enoyl-CoA hydratase  41.85 
 
 
270 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.944224  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1475  enoyl-CoA hydratase  42.23 
 
 
265 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2157  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2770  enoyl-CoA hydratase  41.04 
 
 
263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5112  enoyl-CoA hydratase  41.11 
 
 
274 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.102718  normal  0.649242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1160  enoyl-CoA hydratase  41.13 
 
 
264 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293072  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4649  enoyl-CoA hydratase  41.11 
 
 
274 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.586545  normal  0.29144 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5727  enoyl-CoA hydratase  42.11 
 
 
265 aa  171  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0364977  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.34 
 
 
254 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.351238 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5190  enoyl-CoA hydratase  43.08 
 
 
274 aa  161  9e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00117238  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1773  enoyl-CoA hydratase  42.52 
 
 
263 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3023  enoyl-CoA hydratase  33.87 
 
 
269 aa  142  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346174  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4012  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.42 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6255  short chain enoyl-CoA hydratase  32.13 
 
 
259 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.14 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3491  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.91 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2805  enoyl-CoA hydratase  33.86 
 
 
273 aa  133  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.11 
 
 
267 aa  133  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.2 
 
 
260 aa  132  5e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.23 
 
 
261 aa  132  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.81 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2485  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.64 
 
 
260 aa  128  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.380203 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.02 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5626  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.32 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0759622  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.17 
 
 
261 aa  126  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2795  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.81 
 
 
260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.425448  normal  0.531036 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1924  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.53 
 
 
272 aa  125  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1048  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.4 
 
 
265 aa  124  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1292  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
263 aa  124  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000700088 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2093  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.3 
 
 
289 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0227881  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.42 
 
 
254 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  30.53 
 
 
261 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.71 
 
 
260 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.2 
 
 
260 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2620  enoyl-CoA hydratase  30.59 
 
 
266 aa  123  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124427  normal  0.0671536 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.23 
 
 
260 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.59 
 
 
260 aa  123  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.75 
 
 
251 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  32.95 
 
 
659 aa  121  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  30.43 
 
 
267 aa  120  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.13 
 
 
254 aa  119  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  28.24 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1514  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.32 
 
 
264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.47137  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.3 
 
 
260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30 
 
 
265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.5 
 
 
257 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.181739  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0995  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.74 
 
 
267 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.74 
 
 
265 aa  117  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4448  enoyl-CoA hydratase  30.68 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.519653  normal  0.153189 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.84 
 
 
268 aa  116  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.46 
 
 
260 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.91 
 
 
260 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3750  short chain enoyl-CoA hydratase  28.91 
 
 
257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0647  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.86 
 
 
260 aa  115  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  29.25 
 
 
260 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.08 
 
 
258 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0429  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 
262 aa  115  7.999999999999999e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.297367 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.19 
 
 
258 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  27.95 
 
 
257 aa  115  8.999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.69 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  29.72 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.91 
 
 
275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0804836  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  28.29 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13409  enoyl-CoA hydratase echA18  37.5 
 
 
213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0873  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.43 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.06 
 
 
260 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  27.42 
 
 
262 aa  113  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0902  enoyl-CoA hydratase  32.44 
 
 
260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
259 aa  112  4.0000000000000004e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4733  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.86 
 
 
259 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  29 
 
 
275 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  30.31 
 
 
259 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0224  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.16 
 
 
254 aa  112  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287006  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.3 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.58 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0224  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.02 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00100177  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.46 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4260  enoyl-CoA hydratase  31.13 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.76 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.1 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2195  short chain enoyl-CoA hydratase  30.33 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000647858  hitchhiker  0.00875803 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  30.71 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  28.74 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0268  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.82 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.21713  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.92 
 
 
260 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3803  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.05 
 
 
270 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.92 
 
 
267 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>