More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1924 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_1924  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
272 aa  551  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0995  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  68.48 
 
 
267 aa  338  5.9999999999999996e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase  68.9 
 
 
275 aa  336  1.9999999999999998e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0804836  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  65.53 
 
 
260 aa  335  3.9999999999999995e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2093  enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.03 
 
 
289 aa  317  1e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0227881  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1514  enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.55 
 
 
264 aa  301  6.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.47137  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1292  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.37 
 
 
263 aa  224  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000700088 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0647  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.55 
 
 
260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3491  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.35 
 
 
260 aa  178  9e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2795  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.06 
 
 
260 aa  175  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.425448  normal  0.531036 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1100  hypothetical protein  43.13 
 
 
262 aa  168  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4012  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.96 
 
 
258 aa  161  8.000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5626  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.02 
 
 
265 aa  142  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0759622  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6255  short chain enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.94 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 
251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1318  enoyl-CoA hydratase  29.53 
 
 
259 aa  125  9e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4733  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.58 
 
 
259 aa  122  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.32 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.48 
 
 
266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  30.57 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3420  enoyl-CoA hydratase  32.6 
 
 
261 aa  113  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  30.15 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  28.25 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10764  enoyl-CoA hydratase (AFU_orthologue; AFUA_2G10650)  28.91 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.46 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.01 
 
 
257 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.181739  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.45 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  29.59 
 
 
259 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.35 
 
 
264 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3329  enoyl-CoA hydratase  31.68 
 
 
257 aa  109  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1462  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.63 
 
 
253 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.15 
 
 
255 aa  108  9.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.11 
 
 
257 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  29.39 
 
 
257 aa  107  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  28.73 
 
 
269 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2750  enoyl-CoA hydratase  32.33 
 
 
259 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  31.2 
 
 
263 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  31.56 
 
 
263 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2544  enoyl-CoA hydratase  28.52 
 
 
267 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.715875  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0628  enoyl-CoA hydratase  28.91 
 
 
259 aa  106  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.566194  normal  0.670194 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6416  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.38 
 
 
254 aa  106  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  28.79 
 
 
267 aa  105  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  29.89 
 
 
266 aa  104  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4606  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.46 
 
 
257 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 
265 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.6 
 
 
262 aa  104  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1741  enoyl-CoA hydratase  32.33 
 
 
265 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0980296  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1330  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.5 
 
 
275 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.71221 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  31.52 
 
 
259 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.67 
 
 
260 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  25.1 
 
 
259 aa  103  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  28.41 
 
 
262 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  30.42 
 
 
258 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.08 
 
 
257 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2485  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.36 
 
 
260 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.380203 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.31 
 
 
252 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1048  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.1 
 
 
265 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0153  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 
257 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651497  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.52 
 
 
266 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.868532  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.42 
 
 
258 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.03 
 
 
273 aa  103  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  29.32 
 
 
260 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  29.32 
 
 
257 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.93 
 
 
258 aa  103  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2620  enoyl-CoA hydratase  27.69 
 
 
266 aa  103  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124427  normal  0.0671536 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  29.7 
 
 
259 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.09 
 
 
267 aa  103  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.63 
 
 
259 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  31.66 
 
 
275 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  29.53 
 
 
257 aa  102  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  31.49 
 
 
264 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6848  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.39 
 
 
271 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  31.54 
 
 
264 aa  102  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.97 
 
 
257 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.42 
 
 
258 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6323  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.3 
 
 
261 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0881362  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3569  naphthoate synthase  31.15 
 
 
273 aa  102  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.82 
 
 
254 aa  102  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.97 
 
 
257 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4537  enoyl-CoA hydratase  30.2 
 
 
261 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  27.52 
 
 
659 aa  101  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.41 
 
 
258 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4448  enoyl-CoA hydratase  29.66 
 
 
274 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.519653  normal  0.153189 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0544  enoyl-CoA hydratase  30 
 
 
258 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181699  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2561  enoyl-CoA hydratase  30 
 
 
258 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000238691  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3977  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.68 
 
 
236 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.39 
 
 
262 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0810  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.3 
 
 
269 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748292  normal  0.305394 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  29.26 
 
 
258 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1155  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.9 
 
 
279 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  30.74 
 
 
259 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.67 
 
 
265 aa  100  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.05 
 
 
287 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  28.63 
 
 
258 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.46 
 
 
258 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.96 
 
 
264 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.3 
 
 
258 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  28.52 
 
 
257 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>