More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2544 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_2544  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
267 aa  530  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.715875  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2485  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.78 
 
 
260 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.380203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2805  enoyl-CoA hydratase  34.92 
 
 
273 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2620  enoyl-CoA hydratase  35.48 
 
 
266 aa  156  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124427  normal  0.0671536 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6255  short chain enoyl-CoA hydratase  39.08 
 
 
259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3023  enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 
269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346174  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4448  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 
274 aa  143  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.519653  normal  0.153189 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3491  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.86 
 
 
260 aa  136  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1048  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.74 
 
 
265 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 
251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4012  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.6 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6476  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.6 
 
 
463 aa  125  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0281  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.99 
 
 
265 aa  122  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11671  normal  0.186449 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  33.46 
 
 
257 aa  122  7e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1514  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.48 
 
 
264 aa  122  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.47137  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3107  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  32.8 
 
 
657 aa  121  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.77 
 
 
254 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1743  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  31.64 
 
 
663 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.987316  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5626  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.1 
 
 
265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0759622  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4733  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.38 
 
 
259 aa  119  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.82 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.65 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.62 
 
 
260 aa  116  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  31.73 
 
 
258 aa  116  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2750  enoyl-CoA hydratase  30.65 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.62 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0918  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  30.12 
 
 
657 aa  116  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  35.34 
 
 
651 aa  116  5e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.62 
 
 
260 aa  116  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.47 
 
 
263 aa  115  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1924  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.52 
 
 
272 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0149  short chain enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 
266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.227059  normal  0.14158 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0995  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.66 
 
 
267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6323  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.69 
 
 
261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0881362  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
263 aa  113  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.31 
 
 
257 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  34.15 
 
 
254 aa  113  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0240  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.69 
 
 
265 aa  113  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.480745 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3329  enoyl-CoA hydratase  31.78 
 
 
257 aa  113  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.66 
 
 
275 aa  112  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0804836  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30 
 
 
260 aa  112  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1611  methylmalonyl-CoA decarboxylase  31.62 
 
 
271 aa  112  6e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.31 
 
 
257 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3571  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.2 
 
 
262 aa  112  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.751263  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2795  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.39 
 
 
260 aa  112  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.425448  normal  0.531036 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4763  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
265 aa  111  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254643  normal  0.582812 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1292  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000700088 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0647  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.52 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3420  enoyl-CoA hydratase  34.5 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1318  enoyl-CoA hydratase  30.52 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0268  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.61 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.21713  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3742  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
262 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.262023  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0649  enoyl-CoA hydratase  31.76 
 
 
261 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3797  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  32 
 
 
649 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.4 
 
 
265 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5352  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.97 
 
 
265 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5509  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.97 
 
 
265 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3475  enoyl-CoA hydratase  30.6 
 
 
270 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3883  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.46 
 
 
262 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0303551  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  30.16 
 
 
260 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2093  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.2 
 
 
289 aa  108  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0227881  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1378  methylmalonyl-CoA decarboxylase  28.73 
 
 
260 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40980  enoyl-CoA hydratase  29.85 
 
 
270 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1645  short chain enoyl-CoA hydratase  33.08 
 
 
257 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3172  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.3 
 
 
259 aa  108  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3799  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
262 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0645207  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.05 
 
 
261 aa  107  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2461  methylmalonyl-CoA decarboxylase  30.43 
 
 
259 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000140768 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0017  enoyl-CoA hydratase  28.8 
 
 
261 aa  108  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3042  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.04 
 
 
259 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.97 
 
 
268 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  30.92 
 
 
265 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0102  enoyl-CoA hydratase  31.3 
 
 
259 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3560  enoyl-CoA hydratase  31.47 
 
 
261 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal  0.681353 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3481  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.58 
 
 
266 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1736  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.68 
 
 
271 aa  106  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.841182 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.64 
 
 
265 aa  106  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2907  enoyl-CoA hydratase  30.53 
 
 
271 aa  106  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  30.28 
 
 
260 aa  106  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6416  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.6 
 
 
254 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0109  enoyl-CoA hydratase  31.3 
 
 
259 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  26.56 
 
 
262 aa  106  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  33.08 
 
 
278 aa  106  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0684  methylmalonyl-CoA decarboxylase  27.56 
 
 
259 aa  105  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0753206  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5498  enoyl-CoA hydratase  32.94 
 
 
253 aa  106  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.94 
 
 
261 aa  106  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3320  enoyl-CoA hydratase  30.47 
 
 
273 aa  105  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.178125  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0696  methylmalonyl-CoA decarboxylase  27.17 
 
 
259 aa  105  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000012263 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2195  short chain enoyl-CoA hydratase  29.69 
 
 
257 aa  105  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000647858  hitchhiker  0.00875803 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0628  enoyl-CoA hydratase  29.88 
 
 
259 aa  105  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.566194  normal  0.670194 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.28 
 
 
267 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.2 
 
 
259 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1795  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.4 
 
 
256 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2996  methylmalonyl-CoA decarboxylase  32.8 
 
 
266 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  30.16 
 
 
257 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  29.88 
 
 
263 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5746  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 
256 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.426367  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.41 
 
 
273 aa  103  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3341  methylmalonyl-CoA decarboxylase  28.36 
 
 
261 aa  103  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>