More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2093 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2093  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 289 aa  588  1e-167  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0227881  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  71.8 
 
 		 260 aa  379  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0995  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.03 
 
 		 267 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1924  enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.03 
 
 		 272 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.36 
 
 		 275 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0804836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1514  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.06 
 
 		 264 aa  286  4e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.47137  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0647  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.44 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1292  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.92 
 
 		 263 aa  218  8.999999999999998e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000700088 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2795  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.48 
 
 		 260 aa  198  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.425448  normal  0.531036 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3491  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.61 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1100  hypothetical protein  47.08 
 
 		 262 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4012  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.74 
 
 		 258 aa  168  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5626  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.7 
 
 		 265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0759622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6255  short chain enoyl-CoA hydratase  35.53 
 
 		 259 aa  142  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.46 
 
 		 268 aa  136  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  34.83 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.12 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1048  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.59 
 
 		 265 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.56 
 
 		 258 aa  125  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1318  enoyl-CoA hydratase  31.3 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2157  enoyl-CoA hydratase  30.19 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.82 
 
 		 259 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2485  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.380203 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 		 257 aa  117  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0628  enoyl-CoA hydratase  32.06 
 
 		 259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.566194  normal  0.670194 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.42 
 
 		 256 aa  116  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  32.34 
 
 		 269 aa  115  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.55 
 
 		 267 aa  115  7.999999999999999e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  35.93 
 
 		 259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.56 
 
 		 259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2907  enoyl-CoA hydratase  33.71 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4733  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.68 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3481  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.27 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  31.46 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.7 
 
 		 259 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.45 
 
 		 273 aa  113  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  28.84 
 
 		 260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  32.33 
 
 		 262 aa  112  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  30.62 
 
 		 659 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  30.94 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  30.94 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.06 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  30.94 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  34.2 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  30.08 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3420  enoyl-CoA hydratase  31.82 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  28.09 
 
 		 260 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  31.06 
 
 		 259 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.68 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 249 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.14 
 
 		 266 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6476  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.08 
 
 		 463 aa  109  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.09 
 
 		 257 aa  109  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.181739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  30.6 
 
 		 263 aa  109  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4448  enoyl-CoA hydratase  29.3 
 
 		 274 aa  109  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.519653  normal  0.153189 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  29.66 
 
 		 258 aa  108  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0918  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  30.35 
 
 		 657 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.98 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  31.09 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.84 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  31.18 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.22 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.99 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.84 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0879  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.97 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.3 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  31.32 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3172  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.45 
 
 		 259 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  33.09 
 
 		 266 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.32 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4299  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  31.92 
 
 		 265 aa  106  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  31.58 
 
 		 259 aa  106  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  32.95 
 
 		 264 aa  106  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3977  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.34 
 
 		 236 aa  106  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  31.97 
 
 		 268 aa  106  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  30.19 
 
 		 258 aa  105  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2506  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  31.94 
 
 		 260 aa  105  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0949  enoyl-CoA hydratase  33.83 
 
 		 261 aa  106  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362092  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 259 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1014  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.34 
 
 		 269 aa  105  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.108431 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1430  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  30.94 
 
 		 255 aa  105  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  31.88 
 
 		 266 aa  105  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  30.53 
 
 		 259 aa  105  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.58 
 
 		 257 aa  105  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  30.74 
 
 		 267 aa  105  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  28.9 
 
 		 257 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.45 
 
 		 261 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.63 
 
 		 259 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.44 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1063  enoyl-CoA hydratase  28.83 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  29.84 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  29.32 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.16 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2628  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.44 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1376  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.6 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.821912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0110  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.59 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.549312  normal  0.683018 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  31.18 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  31.75 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  29.7 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  31.37 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>