More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1100 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1100  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  511  1e-144  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1292  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.32 
 
 
263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000700088 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2795  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.91 
 
 
260 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.425448  normal  0.531036 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0647  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.19 
 
 
260 aa  209  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0995  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.67 
 
 
267 aa  203  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.18 
 
 
260 aa  203  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.67 
 
 
275 aa  203  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0804836  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2093  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.08 
 
 
289 aa  201  8e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0227881  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3491  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49 
 
 
260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1514  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.54 
 
 
264 aa  192  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.47137  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4012  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.75 
 
 
258 aa  191  8e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1924  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.58 
 
 
272 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5626  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.77 
 
 
265 aa  148  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0759622  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6255  short chain enoyl-CoA hydratase  39.63 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2506  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  39.2 
 
 
260 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.46 
 
 
251 aa  128  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2620  enoyl-CoA hydratase  35.18 
 
 
266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124427  normal  0.0671536 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1048  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.86 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  36 
 
 
257 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  36.25 
 
 
257 aa  122  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  35.86 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0268  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.07 
 
 
261 aa  115  6.9999999999999995e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.21713  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.69 
 
 
268 aa  115  8.999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2805  enoyl-CoA hydratase  36 
 
 
273 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
266 aa  111  9e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  31.23 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.27 
 
 
258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 
259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2750  enoyl-CoA hydratase  35.59 
 
 
259 aa  109  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  32.54 
 
 
262 aa  108  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.54 
 
 
258 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  33.86 
 
 
260 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3329  enoyl-CoA hydratase  34.89 
 
 
257 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.34 
 
 
254 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.06 
 
 
259 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4448  enoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 
274 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.519653  normal  0.153189 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4733  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.95 
 
 
259 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 
262 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  34.14 
 
 
258 aa  106  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
259 aa  105  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  33.87 
 
 
251 aa  105  8e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.08 
 
 
258 aa  105  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1318  enoyl-CoA hydratase  31.98 
 
 
259 aa  105  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3420  enoyl-CoA hydratase  34.55 
 
 
261 aa  103  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2872  enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 
258 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000338858  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.93 
 
 
258 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.5 
 
 
259 aa  102  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3023  enoyl-CoA hydratase  31.02 
 
 
269 aa  102  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346174  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0597  short chain enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 
262 aa  102  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00392493  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.4 
 
 
255 aa  103  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  32.67 
 
 
258 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  31.5 
 
 
277 aa  102  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.66 
 
 
258 aa  102  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
258 aa  102  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 
258 aa  102  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.05 
 
 
258 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2907  enoyl-CoA hydratase  34.94 
 
 
271 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  30.95 
 
 
659 aa  100  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.93 
 
 
258 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 
263 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
257 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.92 
 
 
259 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  34.65 
 
 
257 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13409  enoyl-CoA hydratase echA18  40.36 
 
 
213 aa  100  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.33 
 
 
259 aa  99.8  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 
260 aa  99.8  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.43 
 
 
258 aa  99.4  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0774  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.04 
 
 
254 aa  99.4  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.730514  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.63 
 
 
257 aa  99  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 
263 aa  99  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  32.66 
 
 
257 aa  99  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.93 
 
 
259 aa  98.6  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.78 
 
 
258 aa  97.8  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.48 
 
 
256 aa  97.8  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  32.27 
 
 
257 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  32.27 
 
 
257 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 
259 aa  97.8  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  31.47 
 
 
258 aa  98.2  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  32.27 
 
 
257 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.4 
 
 
262 aa  97.8  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5245  enoyl-CoA hydratase  34.4 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2688  enoyl-CoA hydratase  32.93 
 
 
258 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000000387614  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 
259 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
259 aa  97.1  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2787  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.31 
 
 
258 aa  97.1  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3188  enoyl-CoA hydratase  33.81 
 
 
262 aa  96.7  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485173  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34 
 
 
257 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 
256 aa  96.3  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  33.64 
 
 
262 aa  95.9  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.76 
 
 
259 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0628  enoyl-CoA hydratase  31.17 
 
 
259 aa  95.9  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.566194  normal  0.670194 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.13 
 
 
259 aa  95.5  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0716  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.44 
 
 
254 aa  95.1  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.439165  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3485  enoyl-CoA hydratase  32.93 
 
 
258 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000302611  hitchhiker  0.000530427 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4537  enoyl-CoA hydratase  36.11 
 
 
261 aa  94.7  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2749  enoyl-CoA hydratase  30.92 
 
 
258 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000689883  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0632  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
258 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040968  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  32.93 
 
 
257 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0930  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
258 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286464  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.41 
 
 
257 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>