More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0647 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0647  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
260 aa  518  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2795  enoyl-CoA hydratase/isomerase  76.15 
 
 
260 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.425448  normal  0.531036 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4012  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.57 
 
 
258 aa  242  3.9999999999999997e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3491  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.96 
 
 
260 aa  237  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1292  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.8 
 
 
263 aa  223  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000700088 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2093  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.44 
 
 
289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0227881  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.79 
 
 
260 aa  217  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5626  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.4 
 
 
265 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0759622  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6255  short chain enoyl-CoA hydratase  44.53 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0995  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.91 
 
 
267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.91 
 
 
275 aa  189  5e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0804836  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2506  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  44.06 
 
 
260 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1514  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.56 
 
 
264 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.47137  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1100  hypothetical protein  49.62 
 
 
262 aa  177  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1924  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.37 
 
 
272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  34.5 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1048  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.7 
 
 
265 aa  139  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36 
 
 
251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  35.89 
 
 
259 aa  136  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.11 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 
256 aa  132  5e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2620  enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 
266 aa  132  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124427  normal  0.0671536 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.55 
 
 
258 aa  132  6.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4733  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.84 
 
 
259 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4448  enoyl-CoA hydratase  34.57 
 
 
274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.519653  normal  0.153189 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.01 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.91 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0268  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.22 
 
 
261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.21713  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  35.25 
 
 
262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3023  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
269 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346174  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  38.02 
 
 
278 aa  128  9.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  32.41 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.25 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
258 aa  126  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.95 
 
 
258 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  32.95 
 
 
258 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  34.84 
 
 
257 aa  125  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 
258 aa  125  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1738  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.41 
 
 
259 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.31 
 
 
258 aa  125  9e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.28 
 
 
259 aa  125  9e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2485  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.8 
 
 
260 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.380203 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6084  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.43 
 
 
258 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2907  enoyl-CoA hydratase  36.88 
 
 
271 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.74 
 
 
260 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.95 
 
 
258 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.02 
 
 
265 aa  123  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2718  enoyl-CoA hydratase  34.15 
 
 
255 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.189949  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2745  enoyl-CoA hydratase  34.15 
 
 
255 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0301258  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
259 aa  122  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 
260 aa  123  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3343  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.94 
 
 
263 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.876474 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  31.4 
 
 
257 aa  122  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.99 
 
 
262 aa  122  6e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 
259 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.08 
 
 
259 aa  121  9e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
262 aa  121  9e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0149  short chain enoyl-CoA hydratase  37.94 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.227059  normal  0.14158 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0597  short chain enoyl-CoA hydratase  34.82 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00392493  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  31.54 
 
 
659 aa  121  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.82 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.76 
 
 
258 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1795  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.18 
 
 
256 aa  120  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.25 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2805  enoyl-CoA hydratase  35.46 
 
 
273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.11 
 
 
258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0245  enoyl-CoA hydratase  33.98 
 
 
260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30 
 
 
259 aa  119  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
257 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
257 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2106  enoyl-CoA hydratase  33.74 
 
 
255 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.433754  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
257 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0429  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.02 
 
 
262 aa  118  7.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.297367 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.85 
 
 
259 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  31.37 
 
 
258 aa  118  9e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4763  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 
265 aa  118  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254643  normal  0.582812 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0476  enoyl-CoA hydratase  35.22 
 
 
254 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.56 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.415627  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0388  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
254 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.42322 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  33.74 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2206  enoyl-CoA hydratase  31.94 
 
 
259 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0233003  normal  0.604488 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.4 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  33.88 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5509  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.15 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.4 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6045  enoyl-CoA hydratase  33.74 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.02 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3420  enoyl-CoA hydratase  34.62 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.4 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0281  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.88 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11671  normal  0.186449 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5352  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.15 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.98 
 
 
256 aa  116  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.03 
 
 
257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.08 
 
 
266 aa  116  5e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  33.2 
 
 
257 aa  116  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.236024  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0716  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.01 
 
 
254 aa  115  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.439165  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.35 
 
 
268 aa  115  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  30.62 
 
 
258 aa  115  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>