More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0995 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0995  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
267 aa  531  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase  99.63 
 
 
275 aa  529  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0804836  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1514  enoyl-CoA hydratase/isomerase  69.7 
 
 
264 aa  351  8e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.47137  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1924  enoyl-CoA hydratase/isomerase  68.09 
 
 
272 aa  321  7e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.17 
 
 
260 aa  310  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2093  enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.03 
 
 
289 aa  306  3e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0227881  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1292  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.71 
 
 
263 aa  227  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000700088 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3491  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.85 
 
 
260 aa  191  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0647  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.91 
 
 
260 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2795  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.94 
 
 
260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.425448  normal  0.531036 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1100  hypothetical protein  46.67 
 
 
262 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4012  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.76 
 
 
258 aa  170  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5626  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.98 
 
 
265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0759622  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6255  short chain enoyl-CoA hydratase  36.12 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
266 aa  119  6e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0918  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  30.08 
 
 
657 aa  119  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1318  enoyl-CoA hydratase  28.74 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.61 
 
 
251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4448  enoyl-CoA hydratase  33.85 
 
 
274 aa  115  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.519653  normal  0.153189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2750  enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.62 
 
 
268 aa  113  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5245  enoyl-CoA hydratase  32.42 
 
 
258 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.77 
 
 
263 aa  112  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
267 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0628  enoyl-CoA hydratase  29.73 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.566194  normal  0.670194 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
264 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.27 
 
 
260 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1048  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.31 
 
 
265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2805  enoyl-CoA hydratase  32.96 
 
 
273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  32.31 
 
 
268 aa  108  7.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2544  enoyl-CoA hydratase  31.56 
 
 
267 aa  108  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.715875  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  32.56 
 
 
269 aa  108  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.72 
 
 
263 aa  108  9.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4110  short chain enoyl-CoA hydratase  33.08 
 
 
265 aa  107  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.741375  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  32.42 
 
 
264 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.3 
 
 
267 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5107  enoyl-CoA hydratase  30.97 
 
 
258 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014973  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3107  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  28.41 
 
 
657 aa  105  6e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  31.97 
 
 
265 aa  105  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0806  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.02 
 
 
273 aa  105  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0669988  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  32.06 
 
 
266 aa  104  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0429  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.63 
 
 
262 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.297367 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3420  enoyl-CoA hydratase  32.55 
 
 
261 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  30.98 
 
 
257 aa  104  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.57 
 
 
266 aa  104  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.868532  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1173  enoyl-CoA hydratase  32.81 
 
 
262 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3329  enoyl-CoA hydratase  31.42 
 
 
257 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  31.32 
 
 
263 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1462  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.68 
 
 
253 aa  103  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2620  enoyl-CoA hydratase  31.45 
 
 
266 aa  102  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124427  normal  0.0671536 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2506  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  32.44 
 
 
260 aa  102  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  31.68 
 
 
259 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2485  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.66 
 
 
260 aa  102  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.380203 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3797  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  28.85 
 
 
649 aa  102  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0016  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
264 aa  102  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0013  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
264 aa  102  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.76945  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.96 
 
 
267 aa  102  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.02 
 
 
259 aa  102  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5267  enoyl-CoA hydratase  31.06 
 
 
265 aa  102  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.03 
 
 
254 aa  102  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.01 
 
 
262 aa  101  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6476  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
463 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  30.3 
 
 
265 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2511  enoyl-CoA hydratase  32.42 
 
 
262 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0268  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.59 
 
 
261 aa  101  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.21713  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.17 
 
 
263 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2907  enoyl-CoA hydratase  33.7 
 
 
271 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  30.38 
 
 
262 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.84 
 
 
273 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.45 
 
 
258 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  28.4 
 
 
257 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  30.8 
 
 
257 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  30.23 
 
 
257 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4537  enoyl-CoA hydratase  32.83 
 
 
261 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  31.82 
 
 
262 aa  99.8  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.1 
 
 
259 aa  99.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13409  enoyl-CoA hydratase echA18  35.33 
 
 
213 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2157  enoyl-CoA hydratase  29.69 
 
 
257 aa  99.8  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1430  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  29.53 
 
 
255 aa  99.4  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8352  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  37.12 
 
 
261 aa  99  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.948817 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.55 
 
 
258 aa  98.6  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.12 
 
 
258 aa  98.6  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  27.27 
 
 
262 aa  97.8  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.86 
 
 
259 aa  98.2  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.36 
 
 
258 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  30.23 
 
 
260 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3470  enoyl-CoA hydratase  31.91 
 
 
266 aa  97.8  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.31 
 
 
287 aa  97.8  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3974  enoyl-CoA hydratase  31.23 
 
 
264 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  0.377725 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  30.6 
 
 
269 aa  97.4  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  29.34 
 
 
262 aa  96.7  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  31.25 
 
 
264 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.31 
 
 
260 aa  97.1  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3360  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.84 
 
 
269 aa  96.7  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439812  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  29.96 
 
 
257 aa  97.1  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.05 
 
 
266 aa  97.1  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.45 
 
 
252 aa  96.3  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2067  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  29.23 
 
 
654 aa  96.3  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.93 
 
 
265 aa  96.7  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3489  enoyl-CoA hydratase  31.25 
 
 
264 aa  96.3  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168411  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>