More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4271 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 252 aa  504  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6416  enoyl-CoA hydratase/isomerase  73.66 
 
 		 254 aa  362  4e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  72.8 
 
 		 254 aa  345  5e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.351238 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2750  enoyl-CoA hydratase  52.44 
 
 		 259 aa  251  7e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2907  enoyl-CoA hydratase  53.56 
 
 		 271 aa  242  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1330  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.43 
 
 		 275 aa  222  4e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.71221 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.97 
 
 		 262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0245  enoyl-CoA hydratase  49.15 
 
 		 260 aa  208  6e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1318  enoyl-CoA hydratase  41.22 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0628  enoyl-CoA hydratase  40.56 
 
 		 259 aa  198  9e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.566194  normal  0.670194 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3188  enoyl-CoA hydratase  42.08 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485173  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3329  enoyl-CoA hydratase  41.98 
 
 		 257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2157  enoyl-CoA hydratase  40.74 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2913  enoyl-CoA hydratase  42.17 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.944224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4649  enoyl-CoA hydratase  41.6 
 
 		 274 aa  161  9e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.586545  normal  0.29144 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5112  enoyl-CoA hydratase  41.6 
 
 		 274 aa  161  9e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.102718  normal  0.649242 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3420  enoyl-CoA hydratase  39.08 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1160  enoyl-CoA hydratase  42.28 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293072  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2770  enoyl-CoA hydratase  42.21 
 
 		 263 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5190  enoyl-CoA hydratase  42.4 
 
 		 274 aa  149  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00117238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1475  enoyl-CoA hydratase  39.18 
 
 		 265 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5727  enoyl-CoA hydratase  35.83 
 
 		 265 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0364977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2620  enoyl-CoA hydratase  32.5 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124427  normal  0.0671536 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1773  enoyl-CoA hydratase  41.84 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6255  short chain enoyl-CoA hydratase  34.02 
 
 		 259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3491  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.17 
 
 		 260 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.93 
 
 		 267 aa  112  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.29 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4012  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.09 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  32.67 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.53 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3023  enoyl-CoA hydratase  31.01 
 
 		 269 aa  109  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4448  enoyl-CoA hydratase  31.69 
 
 		 274 aa  108  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.519653  normal  0.153189 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.02 
 
 		 261 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.38 
 
 		 260 aa  107  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5626  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.08 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0759622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.05 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0017  enoyl-CoA hydratase  29.2 
 
 		 261 aa  106  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.07 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.49 
 
 		 254 aa  105  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.48 
 
 		 265 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  31.05 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  30.04 
 
 		 659 aa  103  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2485  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.04 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.380203 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0587  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.66 
 
 		 265 aa  103  4e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.499109  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1924  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.92 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.54 
 
 		 251 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0268  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.12 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.21713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.46 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.21 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  27.8 
 
 		 259 aa  102  7e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  25.49 
 
 		 262 aa  102  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.77 
 
 		 263 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.51 
 
 		 265 aa  101  9e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3576  enoyl-CoA hydratase  33.81 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397005  normal  0.706787 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  30.58 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.43 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1292  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.46 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000700088 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.74 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  29.67 
 
 		 263 aa  99.4  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  29.67 
 
 		 263 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.46 
 
 		 260 aa  99.4  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4479  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.09 
 
 		 259 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  27.6 
 
 		 260 aa  99  6e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.54 
 
 		 260 aa  98.6  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2805  enoyl-CoA hydratase  29.01 
 
 		 273 aa  98.6  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  27.62 
 
 		 260 aa  98.6  8e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5746  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.4 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.426367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.02 
 
 		 263 aa  97.8  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  27.62 
 
 		 260 aa  97.1  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1007  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.2 
 
 		 254 aa  97.1  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.6 
 
 		 259 aa  97.1  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2067  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  29.53 
 
 		 654 aa  97.1  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1743  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  32.04 
 
 		 663 aa  96.7  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.987316  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0995  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.45 
 
 		 267 aa  96.3  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0918  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  30.84 
 
 		 657 aa  96.7  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  27.98 
 
 		 260 aa  96.3  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3107  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  32.55 
 
 		 657 aa  95.9  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0149  short chain enoyl-CoA hydratase  28.8 
 
 		 266 aa  95.1  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.227059  normal  0.14158 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.22 
 
 		 260 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.64 
 
 		 260 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.22 
 
 		 260 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2207  enoyl-CoA hydratase  27.71 
 
 		 265 aa  95.1  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130556  hitchhiker  0.0060069 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.65 
 
 		 252 aa  94  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.24 
 
 		 269 aa  94  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  29.96 
 
 		 278 aa  94.4  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0281  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.4 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11671  normal  0.186449 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2093  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.75 
 
 		 289 aa  94.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0227881  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5201  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.28 
 
 		 257 aa  94.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492182  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.26 
 
 		 260 aa  93.6  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.52 
 
 		 255 aa  93.6  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1879  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.91 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.37 
 
 		 267 aa  93.6  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.29 
 
 		 271 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.98 
 
 		 260 aa  93.2  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.38 
 
 		 258 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.41 
 
 		 260 aa  93.6  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4763  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.8 
 
 		 265 aa  92.8  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254643  normal  0.582812 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>