More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0587 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0587  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
265 aa  511  1e-144  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.499109  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.53 
 
 
254 aa  161  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.56 
 
 
251 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2620  enoyl-CoA hydratase  36.5 
 
 
266 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124427  normal  0.0671536 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4733  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.53 
 
 
259 aa  156  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  38.93 
 
 
257 aa  148  7e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2485  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.65 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.380203 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2750  enoyl-CoA hydratase  36.11 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0268  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.73 
 
 
261 aa  139  7e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.21713  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3329  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 
257 aa  135  7.000000000000001e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  35.12 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3023  enoyl-CoA hydratase  33.97 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346174  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5626  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.25 
 
 
265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0759622  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6323  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.66 
 
 
261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0881362  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2805  enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 
273 aa  128  9.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0222  enoyl-CoA hydratase  36.73 
 
 
253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4448  enoyl-CoA hydratase  34.55 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.519653  normal  0.153189 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0240  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.22 
 
 
265 aa  125  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.480745 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  33.59 
 
 
659 aa  125  8.000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4012  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 
258 aa  125  9e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
258 aa  124  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3491  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
260 aa  123  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3457  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.04 
 
 
249 aa  123  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.735617  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0811  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.05 
 
 
266 aa  122  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  34.84 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.66 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  35.1 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  36 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2913  enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 
270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.944224  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0281  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.69 
 
 
265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11671  normal  0.186449 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.05 
 
 
260 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.66 
 
 
260 aa  118  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6476  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.69 
 
 
463 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2195  short chain enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000647858  hitchhiker  0.00875803 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.35 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.47 
 
 
254 aa  116  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.351238 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.15 
 
 
263 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  34.02 
 
 
261 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0245  enoyl-CoA hydratase  36.21 
 
 
260 aa  115  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1318  enoyl-CoA hydratase  29.34 
 
 
259 aa  115  6e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2907  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
271 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 
264 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  37.7 
 
 
263 aa  115  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  34.02 
 
 
261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  33.08 
 
 
263 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6416  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.05 
 
 
254 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
257 aa  113  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.61 
 
 
259 aa  113  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.87 
 
 
260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3420  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 
264 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.55 
 
 
264 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  31.71 
 
 
262 aa  112  7.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0644  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.58 
 
 
260 aa  112  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0067  enoyl-CoA hydratase  41.94 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2693  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.8 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.086276  normal  0.305741 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1924  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.21 
 
 
272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1034  short chain enoyl-CoA hydratase  34.96 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0524652  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16135  predicted protein  35.69 
 
 
278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0628  enoyl-CoA hydratase  29.51 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.566194  normal  0.670194 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.45 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6299  short chain enoyl-CoA hydratase  35.06 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.74 
 
 
661 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  32.38 
 
 
260 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17850  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 
265 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.29 
 
 
258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.82 
 
 
269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.1 
 
 
254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.56 
 
 
264 aa  109  5e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.51 
 
 
269 aa  109  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1514  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.85 
 
 
264 aa  108  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.47137  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2377  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.96 
 
 
260 aa  108  6e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10923  enoyl-CoA hydratase  34.31 
 
 
243 aa  109  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.269045  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  32.81 
 
 
263 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0665  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.57 
 
 
250 aa  108  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.103858  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.07 
 
 
260 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2093  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.97 
 
 
289 aa  108  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0227881  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.9 
 
 
270 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2497  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.4 
 
 
967 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126013  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.14 
 
 
264 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.56 
 
 
265 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.42 
 
 
260 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  27.8 
 
 
260 aa  107  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.54 
 
 
268 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.33 
 
 
662 aa  107  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.25 
 
 
260 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.31 
 
 
262 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168242  normal  0.0914474 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.42 
 
 
260 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.72 
 
 
261 aa  107  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6848  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.41 
 
 
271 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.02 
 
 
255 aa  107  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  31.64 
 
 
259 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.11 
 
 
259 aa  106  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.229478  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  31.71 
 
 
263 aa  106  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.65 
 
 
273 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  34.02 
 
 
255 aa  107  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1048  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
265 aa  106  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.13 
 
 
262 aa  106  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
257 aa  106  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>