More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0254 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
262 aa  508  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168242  normal  0.0914474 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0590  short chain enoyl-CoA hydratase  72.52 
 
 
262 aa  371  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  64.89 
 
 
257 aa  324  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09590  short chain enoyl-CoA hydratase  63.85 
 
 
268 aa  321  6e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0374629  normal  0.0718522 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1813  short chain enoyl-CoA hydratase  63.36 
 
 
288 aa  314  9e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  63.36 
 
 
257 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1281  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.89 
 
 
257 aa  306  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.4 
 
 
262 aa  294  1e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2936  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.87 
 
 
262 aa  292  4e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28460  short chain enoyl-CoA hydratase  60.31 
 
 
259 aa  289  3e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.528871  normal  0.841191 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4093  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.77 
 
 
261 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.92 
 
 
257 aa  285  5e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.16 
 
 
257 aa  279  3e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3662  short chain enoyl-CoA hydratase  61.24 
 
 
258 aa  274  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.745999  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6065  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.16 
 
 
259 aa  268  7e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.638371  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1071  enoyl-CoA hydratase/isomerase  63.97 
 
 
258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.540007 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.56 
 
 
257 aa  263  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2046  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.83 
 
 
259 aa  256  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366637  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0682  short chain enoyl-CoA hydratase  59 
 
 
285 aa  251  1e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.14 
 
 
257 aa  219  3e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.12 
 
 
259 aa  217  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.28 
 
 
259 aa  217  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.58 
 
 
259 aa  214  9e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  47.28 
 
 
260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 
262 aa  209  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  46.74 
 
 
257 aa  209  4e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  41.83 
 
 
262 aa  209  5e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.6 
 
 
255 aa  209  5e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.03 
 
 
260 aa  208  6e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  46.36 
 
 
257 aa  207  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.18 
 
 
260 aa  207  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  46.56 
 
 
258 aa  207  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  43.92 
 
 
258 aa  207  2e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.4 
 
 
259 aa  204  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.62 
 
 
268 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.8 
 
 
264 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  44.76 
 
 
258 aa  203  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  48.54 
 
 
259 aa  203  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  41.42 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.01 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  40.61 
 
 
259 aa  200  3e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  46.77 
 
 
257 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  43.55 
 
 
260 aa  198  6e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  43.43 
 
 
258 aa  198  6e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  42.06 
 
 
263 aa  198  7e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  42.06 
 
 
263 aa  198  7e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.68 
 
 
258 aa  198  7.999999999999999e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  40.59 
 
 
260 aa  198  9e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  47.33 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.77 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.82 
 
 
257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.82 
 
 
257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2607  enoyl-CoA hydratase  41.73 
 
 
262 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.43779  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  41.06 
 
 
262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.82 
 
 
257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.78 
 
 
260 aa  196  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  44.98 
 
 
257 aa  196  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  46.64 
 
 
257 aa  196  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  42.17 
 
 
258 aa  196  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  43.1 
 
 
260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.03 
 
 
258 aa  195  5.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  44.22 
 
 
257 aa  195  5.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  42.21 
 
 
663 aa  195  7e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  44.4 
 
 
258 aa  195  7e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  46.37 
 
 
257 aa  195  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.96 
 
 
260 aa  195  7e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.27 
 
 
258 aa  195  7e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.4 
 
 
258 aa  195  7e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  47.3 
 
 
260 aa  194  9e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.27 
 
 
264 aa  194  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.22 
 
 
267 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.15 
 
 
259 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2359  enoyl-CoA hydratase  41.06 
 
 
262 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2564  enoyl-CoA hydratase  40.94 
 
 
262 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45986e-17 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  44.35 
 
 
257 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.26 
 
 
260 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.43 
 
 
259 aa  193  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  46.25 
 
 
257 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  46.25 
 
 
257 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  46.25 
 
 
257 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2374  enoyl-CoA hydratase  40.94 
 
 
262 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  42.69 
 
 
662 aa  193  3e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2290  enoyl-CoA hydratase  41.34 
 
 
262 aa  193  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2551  enoyl-CoA hydratase  40.94 
 
 
262 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  45.87 
 
 
263 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.25 
 
 
257 aa  193  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2515  enoyl-CoA hydratase  40.68 
 
 
262 aa  192  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2552  enoyl-CoA hydratase  40.94 
 
 
262 aa  192  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2331  enoyl-CoA hydratase  40.94 
 
 
262 aa  192  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.53 
 
 
259 aa  192  4e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02840  short chain enoyl-CoA hydratase  47.23 
 
 
265 aa  192  4e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.480651  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.77 
 
 
262 aa  192  6e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.05 
 
 
259 aa  192  6e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  44.05 
 
 
277 aa  192  6e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.09 
 
 
263 aa  192  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5078  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.3 
 
 
262 aa  191  7e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.03 
 
 
258 aa  191  8e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.8 
 
 
260 aa  191  9e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.46 
 
 
259 aa  191  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.77 
 
 
260 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>