More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1071 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1071  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
258 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.540007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3662  short chain enoyl-CoA hydratase  75.19 
 
 
258 aa  369  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.745999  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09590  short chain enoyl-CoA hydratase  62.35 
 
 
268 aa  303  2.0000000000000002e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0374629  normal  0.0718522 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4093  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  67.84 
 
 
261 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1813  short chain enoyl-CoA hydratase  63.53 
 
 
288 aa  300  1e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.75 
 
 
257 aa  298  7e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28460  short chain enoyl-CoA hydratase  63.92 
 
 
259 aa  294  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.528871  normal  0.841191 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0590  short chain enoyl-CoA hydratase  63.97 
 
 
262 aa  293  3e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.65 
 
 
257 aa  293  3e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.39 
 
 
257 aa  287  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6065  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  66.54 
 
 
259 aa  287  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.638371  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  63.97 
 
 
262 aa  284  8e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168242  normal  0.0914474 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.14 
 
 
262 aa  276  2e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2936  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.53 
 
 
262 aa  275  6e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  58.43 
 
 
257 aa  271  6e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.04 
 
 
257 aa  266  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1281  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  60 
 
 
257 aa  263  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2046  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.22 
 
 
259 aa  262  4e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366637  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0682  short chain enoyl-CoA hydratase  62.26 
 
 
285 aa  260  2e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  47.13 
 
 
257 aa  208  6e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  47.13 
 
 
257 aa  208  7e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.12 
 
 
259 aa  205  6e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.1 
 
 
257 aa  204  1e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  45.56 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  45.49 
 
 
257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  46.31 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.58 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.58 
 
 
260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.09 
 
 
259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.88 
 
 
259 aa  196  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.63 
 
 
260 aa  194  9e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  42.13 
 
 
260 aa  194  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  46.94 
 
 
258 aa  194  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  45.34 
 
 
258 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  42.8 
 
 
260 aa  193  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.34 
 
 
258 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.76 
 
 
258 aa  192  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  46.06 
 
 
257 aa  192  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  45.9 
 
 
257 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  46.37 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  46.37 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  46.37 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  42.86 
 
 
662 aa  189  5e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  45.56 
 
 
260 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.53 
 
 
258 aa  188  8e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.43 
 
 
256 aa  188  9e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  43.32 
 
 
257 aa  188  9e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.85 
 
 
258 aa  187  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.72 
 
 
255 aa  187  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.35 
 
 
257 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  41.85 
 
 
262 aa  186  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.4 
 
 
259 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.4 
 
 
259 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.08 
 
 
265 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  46.06 
 
 
257 aa  186  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  44.94 
 
 
257 aa  186  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  39.69 
 
 
258 aa  186  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.09 
 
 
258 aa  186  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  42.64 
 
 
257 aa  185  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.75 
 
 
258 aa  185  7e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.58 
 
 
258 aa  185  7e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.05 
 
 
262 aa  184  9e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.78 
 
 
259 aa  184  9e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.32 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.32 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3114  enoyl-CoA hydratase  45.34 
 
 
258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000516225  normal  0.042562 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.75 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.32 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  43.78 
 
 
283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1738  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.06 
 
 
259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  45.19 
 
 
262 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  39.04 
 
 
257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  45.75 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.72 
 
 
257 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.8 
 
 
259 aa  183  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  44.44 
 
 
258 aa  182  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.45 
 
 
258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.25 
 
 
264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.8 
 
 
253 aa  182  6e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  40.94 
 
 
263 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  40.94 
 
 
263 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  38.96 
 
 
262 aa  181  9.000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.38 
 
 
257 aa  181  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.91 
 
 
259 aa  181  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.71 
 
 
259 aa  181  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  40.16 
 
 
258 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.05 
 
 
259 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2552  enoyl-CoA hydratase  43.69 
 
 
262 aa  180  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2515  enoyl-CoA hydratase  42.18 
 
 
262 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2331  enoyl-CoA hydratase  43.69 
 
 
262 aa  180  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2290  enoyl-CoA hydratase  44.17 
 
 
262 aa  180  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.29 
 
 
258 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2607  enoyl-CoA hydratase  41.56 
 
 
262 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.43779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2564  enoyl-CoA hydratase  43.69 
 
 
262 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45986e-17 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.79 
 
 
260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2749  enoyl-CoA hydratase  45.75 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000689883  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  43.2 
 
 
257 aa  179  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  46.86 
 
 
259 aa  179  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.58 
 
 
257 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2551  enoyl-CoA hydratase  43.2 
 
 
262 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>