More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4093 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4093  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
261 aa  514  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1813  short chain enoyl-CoA hydratase  64.59 
 
 
288 aa  315  4e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0590  short chain enoyl-CoA hydratase  65 
 
 
262 aa  311  1e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09590  short chain enoyl-CoA hydratase  63.04 
 
 
268 aa  310  1e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0374629  normal  0.0718522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  61.87 
 
 
257 aa  301  8.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28460  short chain enoyl-CoA hydratase  63.04 
 
 
259 aa  296  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.528871  normal  0.841191 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3662  short chain enoyl-CoA hydratase  62.35 
 
 
258 aa  294  1e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.745999  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6065  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.2 
 
 
259 aa  290  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.638371  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.77 
 
 
262 aa  288  5.0000000000000004e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168242  normal  0.0914474 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.7 
 
 
257 aa  288  8e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2936  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  60 
 
 
262 aa  287  1e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.31 
 
 
257 aa  286  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.53 
 
 
257 aa  286  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.85 
 
 
262 aa  286  2.9999999999999996e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1071  enoyl-CoA hydratase/isomerase  67.84 
 
 
258 aa  277  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.540007 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.11 
 
 
257 aa  274  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1281  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.14 
 
 
257 aa  266  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0682  short chain enoyl-CoA hydratase  62.5 
 
 
285 aa  261  6.999999999999999e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2046  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.81 
 
 
259 aa  258  6e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366637  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.46 
 
 
257 aa  218  7e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  43.03 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  42.37 
 
 
258 aa  194  2e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.02 
 
 
264 aa  193  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  42.52 
 
 
262 aa  193  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  44.94 
 
 
258 aa  192  4e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.58 
 
 
259 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  46.25 
 
 
258 aa  190  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.38 
 
 
258 aa  189  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  43.55 
 
 
257 aa  189  5e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.18 
 
 
258 aa  189  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  43.55 
 
 
257 aa  188  5.999999999999999e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  45.08 
 
 
257 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  45.08 
 
 
257 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  45.08 
 
 
257 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.87 
 
 
258 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13055  enoyl-CoA hydratase  45.38 
 
 
254 aa  186  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.12281 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  43.87 
 
 
258 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  39.84 
 
 
260 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  41.54 
 
 
662 aa  186  3e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  44.88 
 
 
257 aa  186  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.9 
 
 
259 aa  186  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  43.08 
 
 
662 aa  186  5e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  44.09 
 
 
260 aa  185  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  39.38 
 
 
258 aa  185  8e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.15 
 
 
260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  39.02 
 
 
260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.6 
 
 
258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  45.24 
 
 
259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  42.45 
 
 
663 aa  183  3e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.77 
 
 
259 aa  182  3e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.77 
 
 
260 aa  183  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  45.8 
 
 
260 aa  182  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.15 
 
 
260 aa  183  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.17 
 
 
260 aa  183  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  43.51 
 
 
263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.31 
 
 
259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.09 
 
 
258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.97 
 
 
258 aa  182  6e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0224  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.13 
 
 
258 aa  182  7e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00100177  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.77 
 
 
260 aa  182  7e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  42.69 
 
 
662 aa  182  7e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.42 
 
 
260 aa  181  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.88 
 
 
255 aa  181  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 
253 aa  181  1e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.45 
 
 
263 aa  180  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.75 
 
 
259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  41.53 
 
 
257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  40.7 
 
 
260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.92 
 
 
268 aa  179  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  45.2 
 
 
258 aa  179  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  43.02 
 
 
257 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.02 
 
 
259 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  44.84 
 
 
258 aa  179  4.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.23 
 
 
260 aa  178  7e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17850  enoyl-CoA hydratase  44.09 
 
 
265 aa  178  7e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3114  enoyl-CoA hydratase  43.15 
 
 
258 aa  178  8e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000516225  normal  0.042562 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  41.83 
 
 
257 aa  178  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  41.09 
 
 
257 aa  178  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.04 
 
 
260 aa  178  9e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  43.33 
 
 
283 aa  177  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.26 
 
 
267 aa  177  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.21 
 
 
259 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  44.21 
 
 
277 aa  177  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.54 
 
 
267 aa  176  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.69 
 
 
261 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  42.74 
 
 
262 aa  176  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.98 
 
 
265 aa  176  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.52 
 
 
265 aa  176  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2749  enoyl-CoA hydratase  43.15 
 
 
258 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000689883  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  41.46 
 
 
260 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  42.08 
 
 
261 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  41.41 
 
 
257 aa  176  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.86 
 
 
259 aa  175  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  42 
 
 
661 aa  175  8e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.4 
 
 
256 aa  175  8e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02840  short chain enoyl-CoA hydratase  43.5 
 
 
265 aa  174  9e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.480651  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.9 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.56 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.17 
 
 
257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.97 
 
 
261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>