More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0240 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0240  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 265 aa  509  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.480745 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0281  enoyl-CoA hydratase/isomerase  89.23 
 
 		 265 aa  417  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11671  normal  0.186449 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4733  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.86 
 
 		 259 aa  258  9e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52 
 
 		 254 aa  256  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.44 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  40 
 
 		 257 aa  178  9e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2620  enoyl-CoA hydratase  37.11 
 
 		 266 aa  151  8e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124427  normal  0.0671536 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0268  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.59 
 
 		 261 aa  152  8e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.21713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.67 
 
 		 258 aa  149  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.11 
 
 		 258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2805  enoyl-CoA hydratase  39.82 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.54 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  38.91 
 
 		 260 aa  142  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.98 
 
 		 259 aa  139  6e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  32.02 
 
 		 663 aa  138  7.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  38.49 
 
 		 278 aa  137  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3023  enoyl-CoA hydratase  38.12 
 
 		 269 aa  137  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 		 267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 		 260 aa  135  8e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3457  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.96 
 
 		 249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.735617  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  36.62 
 
 		 258 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  35.37 
 
 		 259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  31.45 
 
 		 259 aa  132  5e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.28 
 
 		 259 aa  132  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.07 
 
 		 260 aa  132  6e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0829  enoyl-CoA hydratase  35.66 
 
 		 257 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.92 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.12 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.81 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.26 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  32.81 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.24 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.92 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  32.27 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.23 
 
 		 259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 		 258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.03 
 
 		 266 aa  129  6e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.93 
 
 		 259 aa  129  6e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.25 
 
 		 260 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.46 
 
 		 256 aa  128  9.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.43 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.33 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.14 
 
 		 260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.43 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0597  short chain enoyl-CoA hydratase  35.43 
 
 		 262 aa  127  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00392493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.47 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.15 
 
 		 259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.43 
 
 		 257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.35 
 
 		 260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  38.93 
 
 		 267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.68 
 
 		 260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  34.13 
 
 		 257 aa  126  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.04 
 
 		 260 aa  125  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3320  enoyl-CoA hydratase  31.44 
 
 		 273 aa  125  9e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.178125  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.41 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5249  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.13 
 
 		 273 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.43 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  32.3 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2090  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.44 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0323462  normal  0.4563 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0153  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 		 257 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651497  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.06 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0998  crotonobetainyl-CoA hydratase  37.6 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  36.33 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.236024  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_55192  hydratase enyol-coa hydratase  31.58 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  31.97 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  31.97 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.88 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3485  enoyl-CoA hydratase  34.63 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000302611  hitchhiker  0.000530427 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  34.26 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2485  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.26 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.380203 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  34.26 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.85 
 
 		 265 aa  123  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  34.26 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.81 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.8 
 
 		 264 aa  123  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.19 
 
 		 263 aa  123  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  34.45 
 
 		 259 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.41 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3077  enoyl-CoA hydratase-isomerase  35.51 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 		 257 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4606  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.41 
 
 		 257 aa  123  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  31.9 
 
 		 257 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.27 
 
 		 260 aa  123  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.83 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0471  enoyl-CoA hydratase  34.63 
 
 		 258 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000928124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  32.54 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  34.65 
 
 		 258 aa  122  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3420  enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 		 261 aa  122  5e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0716  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.29 
 
 		 254 aa  122  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.439165  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6834  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.92 
 
 		 245 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5613  enoyl-CoA hydratase  32.84 
 
 		 274 aa  122  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.333814  normal  0.841372 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.92 
 
 		 260 aa  122  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1281  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.68 
 
 		 257 aa  122  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.43 
 
 		 264 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.85 
 
 		 265 aa  122  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.75 
 
 		 258 aa  122  8e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  30.62 
 
 		 260 aa  122  8e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>