More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2485 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2485  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 260 aa  508  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.380203 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2620  enoyl-CoA hydratase  39.85 
 
 		 266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124427  normal  0.0671536 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4448  enoyl-CoA hydratase  38.87 
 
 		 274 aa  169  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.519653  normal  0.153189 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2544  enoyl-CoA hydratase  40.78 
 
 		 267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.715875  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3023  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 		 269 aa  161  9e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2805  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 		 273 aa  152  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1048  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.38 
 
 		 265 aa  151  8.999999999999999e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3491  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.54 
 
 		 260 aa  145  8.000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6255  short chain enoyl-CoA hydratase  35.25 
 
 		 259 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4012  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.9 
 
 		 258 aa  139  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  36.15 
 
 		 257 aa  138  8.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  33.08 
 
 		 659 aa  137  1e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0268  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.63 
 
 		 261 aa  135  8e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.21713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6323  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.41 
 
 		 261 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0881362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1611  methylmalonyl-CoA decarboxylase  36.02 
 
 		 271 aa  131  9e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1318  enoyl-CoA hydratase  31.64 
 
 		 259 aa  128  7.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0628  enoyl-CoA hydratase  31.5 
 
 		 259 aa  129  7.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.566194  normal  0.670194 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  32.69 
 
 		 663 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1378  methylmalonyl-CoA decarboxylase  30.65 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.83 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.82 
 
 		 260 aa  127  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  32.28 
 
 		 260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  33.98 
 
 		 260 aa  125  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5626  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.91 
 
 		 265 aa  125  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0759622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.04 
 
 		 251 aa  125  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0647  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.8 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3534  methylmalonyl-CoA decarboxylase  31.27 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4733  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.98 
 
 		 259 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.63 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3329  enoyl-CoA hydratase  34.66 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.25 
 
 		 258 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1292  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.25 
 
 		 263 aa  122  8e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000700088 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.57 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3188  enoyl-CoA hydratase  32.54 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485173  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2795  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.95 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.425448  normal  0.531036 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0350  naphthoate synthase  33.06 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3420  enoyl-CoA hydratase  34.24 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3742  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.94 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.262023  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  29.84 
 
 		 259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0149  short chain enoyl-CoA hydratase  35.85 
 
 		 266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.227059  normal  0.14158 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0587  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.65 
 
 		 265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.499109  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1591  naphthoate synthase  32 
 
 		 285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2091  naphthoate synthase  33.33 
 
 		 273 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1783  naphthoate synthase  32 
 
 		 285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.485587 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1484  naphthoate synthase  32 
 
 		 285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 		 259 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40076  predicted protein  35.43 
 
 		 337 aa  118  9e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2093  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 		 289 aa  118  9e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0227881  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0281  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.48 
 
 		 265 aa  118  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11671  normal  0.186449 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1047  naphthoate synthase  31.6 
 
 		 285 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0636454  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2750  enoyl-CoA hydratase  31.18 
 
 		 259 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2812  naphthoate synthase  32 
 
 		 285 aa  118  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.921733 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0245  enoyl-CoA hydratase  32 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.01 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02189  naphthoate synthase  31.2 
 
 		 285 aa  116  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1395  naphthoate synthase  31.2 
 
 		 285 aa  116  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2408  naphthoate synthase  31.2 
 
 		 285 aa  116  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.146223  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02148  hypothetical protein  31.2 
 
 		 285 aa  116  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2558  naphthoate synthase  31.2 
 
 		 285 aa  116  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.20576  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2417  naphthoate synthase  31.2 
 
 		 285 aa  116  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.085961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1386  naphthoate synthase  31.2 
 
 		 285 aa  116  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3201  naphthoate synthase  31.6 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.354537  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.6 
 
 		 253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0328  naphthoate synthase  32.66 
 
 		 273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0113118 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1719  naphthoate synthase  32.13 
 
 		 273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3012  naphthoate synthase  31.6 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.34 
 
 		 662 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4763  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.19 
 
 		 265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254643  normal  0.582812 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.17 
 
 		 262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2433  naphthoate synthase  33.06 
 
 		 273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2547  naphthoate synthase  30.8 
 
 		 285 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0659643  normal  0.90285 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2651  naphthoate synthase  30.8 
 
 		 285 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0194594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2443  naphthoate synthase  30.8 
 
 		 285 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00319008  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2492  naphthoate synthase  30.8 
 
 		 285 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0682871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2535  naphthoate synthase  30.8 
 
 		 285 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3860  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.23 
 
 		 261 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.897739 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0696  methylmalonyl-CoA decarboxylase  28.57 
 
 		 259 aa  115  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000012263 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3404  naphthoate synthase  30.8 
 
 		 285 aa  115  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.298382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2641  naphthoate synthase  30.8 
 
 		 285 aa  115  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0549991  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3799  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.94 
 
 		 262 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0645207  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0684  methylmalonyl-CoA decarboxylase  28.19 
 
 		 259 aa  115  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0753206  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1113  naphthoate synthase  31.6 
 
 		 285 aa  115  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.04669  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1514  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.46 
 
 		 264 aa  115  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.47137  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  34.38 
 
 		 263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  33.72 
 
 		 267 aa  115  7.999999999999999e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.73 
 
 		 267 aa  115  8.999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.76 
 
 		 264 aa  115  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2050  naphthoate synthase  32.13 
 
 		 273 aa  115  8.999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  32.69 
 
 		 278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0562  naphthoate synthase  31.6 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.348185  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  31.54 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  32.17 
 
 		 651 aa  114  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5352  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.41 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5509  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.41 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  32.69 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0240  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.88 
 
 		 265 aa  113  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.480745 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.15 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3883  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.19 
 
 		 262 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0303551  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3481  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.32 
 
 		 266 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>