More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1395 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02189  naphthoate synthase  100 
 
 
285 aa  597  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1395  naphthoate synthase  100 
 
 
285 aa  597  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2558  naphthoate synthase  100 
 
 
285 aa  597  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.20576  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02148  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  597  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3404  naphthoate synthase  99.65 
 
 
285 aa  597  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.298382  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2408  naphthoate synthase  100 
 
 
285 aa  597  1e-170  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.146223  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2641  naphthoate synthase  99.65 
 
 
285 aa  597  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0549991  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1386  naphthoate synthase  100 
 
 
285 aa  597  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2417  naphthoate synthase  99.65 
 
 
285 aa  596  1e-169  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.085961  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2651  naphthoate synthase  96.84 
 
 
285 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0194594  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2547  naphthoate synthase  96.84 
 
 
285 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0659643  normal  0.90285 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2492  naphthoate synthase  96.84 
 
 
285 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0682871  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2535  naphthoate synthase  96.84 
 
 
285 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2443  naphthoate synthase  96.84 
 
 
285 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00319008  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2812  naphthoate synthase  92.63 
 
 
285 aa  567  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.921733 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1783  naphthoate synthase  93.33 
 
 
285 aa  564  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.485587 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1591  naphthoate synthase  93.33 
 
 
285 aa  564  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1484  naphthoate synthase  93.33 
 
 
285 aa  564  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3201  naphthoate synthase  91.93 
 
 
285 aa  554  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.354537  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1113  naphthoate synthase  91.93 
 
 
285 aa  555  1e-157  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.04669  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1047  naphthoate synthase  91.23 
 
 
285 aa  553  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0636454  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3012  naphthoate synthase  91.23 
 
 
285 aa  551  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3281  naphthoate synthase  91.58 
 
 
285 aa  553  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0562  naphthoate synthase  88.49 
 
 
278 aa  526  1e-148  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.348185  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004030  naphthoate synthase  85 
 
 
288 aa  508  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1559  naphthoate synthase  84.29 
 
 
296 aa  508  1e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1101  naphthoate synthase  84.64 
 
 
288 aa  510  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.648754  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01431  naphthoate synthase  84.29 
 
 
292 aa  503  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0350  naphthoate synthase  82.97 
 
 
280 aa  480  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2091  naphthoate synthase  78.39 
 
 
273 aa  451  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2050  naphthoate synthase  76 
 
 
273 aa  444  1.0000000000000001e-124  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2433  naphthoate synthase  79.92 
 
 
273 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0328  naphthoate synthase  75.27 
 
 
273 aa  442  1e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0113118 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1719  naphthoate synthase  76.73 
 
 
273 aa  443  1e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1880  naphthoate synthase  76 
 
 
273 aa  440  9.999999999999999e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2077  naphthoate synthase  76.36 
 
 
273 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.310676 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1129  naphthoate synthase  74.54 
 
 
283 aa  434  1e-121  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0351  naphthoate synthase  72.89 
 
 
274 aa  412  1e-114  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.621273  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1231  naphthoate synthase  70.7 
 
 
271 aa  404  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4748  naphthoate synthase  69.34 
 
 
272 aa  390  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4586  naphthoate synthase  69.34 
 
 
272 aa  390  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5109  naphthoate synthase  69.34 
 
 
272 aa  390  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0570  naphthoate synthase  70.07 
 
 
272 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4088  naphthoate synthase  70.5 
 
 
287 aa  392  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00831941 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4984  naphthoate synthase  69.34 
 
 
272 aa  391  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.269846  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0254  naphthoate synthase  69.34 
 
 
272 aa  391  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000397858  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4966  naphthoate synthase  69.34 
 
 
272 aa  390  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5013  naphthoate synthase  69.34 
 
 
272 aa  389  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4695  naphthoate synthase  69.34 
 
 
272 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4608  naphthoate synthase  69.34 
 
 
272 aa  390  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2797  naphthoate synthase  69.23 
 
 
272 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4995  naphthoate synthase  69.34 
 
 
272 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1611  naphthoate synthase  70.04 
 
 
277 aa  388  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00424236 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0166  naphthoate synthase  68.35 
 
 
277 aa  386  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0597  naphthoate synthase  67.5 
 
 
279 aa  385  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000704347  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0919  naphthoate synthase  69.52 
 
 
277 aa  386  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3491  naphthoate synthase  68.61 
 
 
272 aa  387  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1616  naphthoate synthase  67.77 
 
 
274 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.796217  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1707  naphthoate synthase  67.74 
 
 
276 aa  379  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4674  naphthoate synthase  66.91 
 
 
282 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0632  naphthoate synthase  65.44 
 
 
272 aa  375  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.556463  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0255  naphthoate synthase  68.35 
 
 
277 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.838473  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0024  naphthoate synthase  65.02 
 
 
287 aa  374  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.756719 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2893  naphthoate synthase  65.14 
 
 
283 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0874226  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0257  naphthoate synthase  67.99 
 
 
277 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1162  naphthoate synthase  65.58 
 
 
275 aa  377  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000676396 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1104  naphthoate synthase  64.71 
 
 
273 aa  371  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1127  naphthoate synthase  64.71 
 
 
273 aa  371  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0434523  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1753  naphthoate synthase  65.68 
 
 
274 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4218  naphthoate synthase  64.31 
 
 
287 aa  373  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.495316  normal  0.246617 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40076  predicted protein  62.41 
 
 
337 aa  368  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10421  naphthoate synthase  62.5 
 
 
287 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.590444  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2567  naphthoate synthase  64.62 
 
 
279 aa  365  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.522143  normal  0.0403307 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3116  naphthoate synthase  64.84 
 
 
277 aa  363  2e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0805389 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0472  naphthoate synthase  63.18 
 
 
279 aa  363  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1409  naphthoate synthase  65.34 
 
 
279 aa  362  3e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3569  naphthoate synthase  67.29 
 
 
273 aa  362  3e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1921  naphthoate synthase  64.47 
 
 
272 aa  361  8e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0771  naphthoate synthase  63.54 
 
 
280 aa  360  2e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1216  naphthoate synthase  62.45 
 
 
274 aa  358  7e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0182076  hitchhiker  0.000174974 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0044  naphthoate synthase  61.15 
 
 
299 aa  356  2.9999999999999997e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18811  naphthoate synthase  62.87 
 
 
297 aa  355  5.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.491135 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04140  1,4-Dihydroxy-2-naphthoate synthase  61.82 
 
 
279 aa  353  2e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  normal  0.842204 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06641  naphthoate synthase  60.43 
 
 
297 aa  352  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1123  naphthoate synthase  64.39 
 
 
289 aa  352  5e-96  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.962751 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06341  naphthoate synthase  60.52 
 
 
285 aa  350  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2972  naphthoate synthase  60.57 
 
 
279 aa  349  3e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0608  naphthoate synthase  59.78 
 
 
285 aa  348  8e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06641  naphthoate synthase  58.63 
 
 
285 aa  346  2e-94  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.318164  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14020  1,4-Dihydroxy-2-naphthoate synthase  62.22 
 
 
279 aa  342  4e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06731  naphthoate synthase  60.52 
 
 
285 aa  341  8e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.231229  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0279  naphthoate synthase  60.61 
 
 
273 aa  339  4e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1523  naphthoate synthase  62.13 
 
 
272 aa  338  7e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128514 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1333  naphthoate synthase  61.9 
 
 
289 aa  333  2e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0778506  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0887  naphthoate synthase  58.24 
 
 
273 aa  331  1e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0016  naphthoate synthase  55.76 
 
 
277 aa  314  9.999999999999999e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1210  naphthoate synthase  55.26 
 
 
271 aa  295  7e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2784  naphthoate synthase  51.07 
 
 
277 aa  284  1.0000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0377235  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10533  naphthoate synthase  51.28 
 
 
278 aa  282  4.0000000000000003e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227321  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1897  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  50.71 
 
 
280 aa  280  2e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.101425  normal  0.0197051 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>