More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0024 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0024  naphthoate synthase  100 
 
 
287 aa  594  1e-169  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.756719 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4218  naphthoate synthase  97.21 
 
 
287 aa  584  1e-166  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.495316  normal  0.246617 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4088  naphthoate synthase  71.93 
 
 
287 aa  420  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00831941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1611  naphthoate synthase  72 
 
 
277 aa  414  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00424236 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0166  naphthoate synthase  71.38 
 
 
277 aa  412  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0919  naphthoate synthase  71.9 
 
 
277 aa  409  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4674  naphthoate synthase  69.57 
 
 
282 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0257  naphthoate synthase  70.65 
 
 
277 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0255  naphthoate synthase  71.01 
 
 
277 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.838473  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0597  naphthoate synthase  68.59 
 
 
279 aa  397  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000704347  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2433  naphthoate synthase  67.27 
 
 
273 aa  398  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1719  naphthoate synthase  66.91 
 
 
273 aa  396  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3116  naphthoate synthase  69.09 
 
 
277 aa  397  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0805389 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1231  naphthoate synthase  67.15 
 
 
271 aa  396  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2077  naphthoate synthase  65.83 
 
 
273 aa  395  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.310676 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2050  naphthoate synthase  66.55 
 
 
273 aa  395  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0570  naphthoate synthase  70.18 
 
 
272 aa  395  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1880  naphthoate synthase  64.75 
 
 
273 aa  391  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0328  naphthoate synthase  66.19 
 
 
273 aa  392  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0113118 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2797  naphthoate synthase  69.2 
 
 
272 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2091  naphthoate synthase  66.67 
 
 
273 aa  392  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3491  naphthoate synthase  65.94 
 
 
272 aa  388  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5013  naphthoate synthase  66.3 
 
 
272 aa  384  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4748  naphthoate synthase  67.03 
 
 
272 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4586  naphthoate synthase  67.03 
 
 
272 aa  387  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4608  naphthoate synthase  66.67 
 
 
272 aa  385  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4966  naphthoate synthase  67.03 
 
 
272 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5109  naphthoate synthase  67.03 
 
 
272 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4995  naphthoate synthase  66.3 
 
 
272 aa  384  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4984  naphthoate synthase  67.03 
 
 
272 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.269846  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0254  naphthoate synthase  66.67 
 
 
272 aa  384  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000397858  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1129  naphthoate synthase  67.27 
 
 
283 aa  383  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0351  naphthoate synthase  64.98 
 
 
274 aa  381  1e-105  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.621273  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4695  naphthoate synthase  66.3 
 
 
272 aa  383  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0562  naphthoate synthase  67.38 
 
 
278 aa  379  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.348185  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02189  naphthoate synthase  65.02 
 
 
285 aa  374  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1395  naphthoate synthase  65.02 
 
 
285 aa  374  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1921  naphthoate synthase  67.03 
 
 
272 aa  376  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2641  naphthoate synthase  65.37 
 
 
285 aa  375  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0549991  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004030  naphthoate synthase  64.44 
 
 
288 aa  375  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2558  naphthoate synthase  65.02 
 
 
285 aa  374  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.20576  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1386  naphthoate synthase  65.02 
 
 
285 aa  374  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2417  naphthoate synthase  65.02 
 
 
285 aa  375  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.085961  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02148  hypothetical protein  65.02 
 
 
285 aa  374  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2408  naphthoate synthase  65.02 
 
 
285 aa  374  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.146223  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1047  naphthoate synthase  65.02 
 
 
285 aa  376  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0636454  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3404  naphthoate synthase  65.37 
 
 
285 aa  375  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.298382  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3012  naphthoate synthase  65.37 
 
 
285 aa  376  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0350  naphthoate synthase  66.17 
 
 
280 aa  377  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2492  naphthoate synthase  65.02 
 
 
285 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0682871  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2443  naphthoate synthase  65.02 
 
 
285 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00319008  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2651  naphthoate synthase  65.02 
 
 
285 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0194594  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3281  naphthoate synthase  63.73 
 
 
285 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2547  naphthoate synthase  65.02 
 
 
285 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0659643  normal  0.90285 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2535  naphthoate synthase  65.02 
 
 
285 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1113  naphthoate synthase  63.96 
 
 
285 aa  372  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.04669  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1783  naphthoate synthase  63.03 
 
 
285 aa  372  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.485587 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3201  naphthoate synthase  63.96 
 
 
285 aa  371  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.354537  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2812  naphthoate synthase  63.6 
 
 
285 aa  373  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.921733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1591  naphthoate synthase  63.03 
 
 
285 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1753  naphthoate synthase  63.93 
 
 
274 aa  373  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1484  naphthoate synthase  63.03 
 
 
285 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1162  naphthoate synthase  64.52 
 
 
275 aa  374  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000676396 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0632  naphthoate synthase  62.18 
 
 
272 aa  367  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.556463  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0044  naphthoate synthase  63.74 
 
 
299 aa  368  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1127  naphthoate synthase  62.55 
 
 
273 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0434523  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1559  naphthoate synthase  64.79 
 
 
296 aa  371  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1104  naphthoate synthase  62.55 
 
 
273 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1101  naphthoate synthase  64.08 
 
 
288 aa  370  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.648754  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06641  naphthoate synthase  63.37 
 
 
297 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0472  naphthoate synthase  63.74 
 
 
279 aa  367  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01431  naphthoate synthase  63.03 
 
 
292 aa  365  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06341  naphthoate synthase  62.59 
 
 
285 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1216  naphthoate synthase  62.5 
 
 
274 aa  365  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0182076  hitchhiker  0.000174974 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06731  naphthoate synthase  65.19 
 
 
285 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.231229  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0608  naphthoate synthase  61.65 
 
 
285 aa  363  1e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1707  naphthoate synthase  63.12 
 
 
276 aa  362  3e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06641  naphthoate synthase  62.82 
 
 
285 aa  362  4e-99  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.318164  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2972  naphthoate synthase  62.68 
 
 
279 aa  360  1e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10421  naphthoate synthase  61.84 
 
 
287 aa  358  8e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.590444  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0771  naphthoate synthase  60.93 
 
 
280 aa  358  8e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04140  1,4-Dihydroxy-2-naphthoate synthase  62.41 
 
 
279 aa  357  9e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  normal  0.842204 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1123  naphthoate synthase  63.1 
 
 
289 aa  357  9.999999999999999e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.962751 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14020  1,4-Dihydroxy-2-naphthoate synthase  61.15 
 
 
279 aa  356  1.9999999999999998e-97  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18811  naphthoate synthase  61.99 
 
 
297 aa  354  1e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.491135 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1409  naphthoate synthase  60.35 
 
 
279 aa  352  4e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2567  naphthoate synthase  60 
 
 
279 aa  351  5.9999999999999994e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.522143  normal  0.0403307 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2893  naphthoate synthase  59.09 
 
 
283 aa  350  2e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0874226  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1616  naphthoate synthase  58.57 
 
 
274 aa  348  4e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.796217  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0505  naphthoate synthase  61.03 
 
 
276 aa  345  4e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0636715  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1333  naphthoate synthase  62.91 
 
 
289 aa  342  2.9999999999999997e-93  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0778506  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2784  naphthoate synthase  59.26 
 
 
277 aa  337  9.999999999999999e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0377235  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3569  naphthoate synthase  60.22 
 
 
273 aa  337  1.9999999999999998e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1897  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  58.52 
 
 
280 aa  335  5.999999999999999e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.101425  normal  0.0197051 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40076  predicted protein  61.22 
 
 
337 aa  330  1e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10533  naphthoate synthase  58.15 
 
 
278 aa  330  1e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227321  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1523  naphthoate synthase  59.64 
 
 
272 aa  330  2e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128514 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0922  naphthoate synthase  57.54 
 
 
298 aa  323  2e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0887  naphthoate synthase  55.4 
 
 
273 aa  323  2e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0279  naphthoate synthase  54.74 
 
 
273 aa  315  4e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>