More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4012 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_4012  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
258 aa  527  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3491  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  67.44 
 
 
260 aa  349  3e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5626  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.76 
 
 
265 aa  265  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0759622  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2795  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.12 
 
 
260 aa  250  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.425448  normal  0.531036 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0647  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.57 
 
 
260 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6255  short chain enoyl-CoA hydratase  45.93 
 
 
259 aa  227  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2506  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  47.66 
 
 
260 aa  205  5e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1292  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.18 
 
 
263 aa  202  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000700088 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2620  enoyl-CoA hydratase  42.52 
 
 
266 aa  190  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124427  normal  0.0671536 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0995  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.76 
 
 
267 aa  170  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.22 
 
 
275 aa  169  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0804836  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2093  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.74 
 
 
289 aa  168  9e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0227881  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1514  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.59 
 
 
264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.47137  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2805  enoyl-CoA hydratase  37.9 
 
 
273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1048  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.06 
 
 
265 aa  159  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
260 aa  158  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1100  hypothetical protein  43.32 
 
 
262 aa  157  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1924  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.58 
 
 
272 aa  156  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.97 
 
 
260 aa  155  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  35.04 
 
 
257 aa  155  8e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3420  enoyl-CoA hydratase  39.13 
 
 
261 aa  151  8.999999999999999e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.83 
 
 
251 aa  151  8.999999999999999e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  35.57 
 
 
259 aa  149  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3329  enoyl-CoA hydratase  38.17 
 
 
257 aa  149  6e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  35.88 
 
 
257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3023  enoyl-CoA hydratase  32.93 
 
 
269 aa  145  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346174  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
273 aa  143  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  36.08 
 
 
267 aa  143  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.4 
 
 
659 aa  142  4e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
258 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 
268 aa  142  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1318  enoyl-CoA hydratase  32.42 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2136  enoyl-CoA hydratase  36.14 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.259318  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  35.86 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  33.72 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  36.43 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  32.58 
 
 
262 aa  140  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 
259 aa  139  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.82 
 
 
258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  34.92 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2485  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.9 
 
 
260 aa  139  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.380203 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.15 
 
 
262 aa  139  7e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.29 
 
 
266 aa  137  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
258 aa  137  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.11 
 
 
262 aa  138  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.7 
 
 
258 aa  138  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.2 
 
 
259 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  34.35 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.11 
 
 
257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  35.5 
 
 
257 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 
258 aa  135  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.36 
 
 
257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  36.36 
 
 
278 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 
258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.36 
 
 
257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  34.75 
 
 
260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2750  enoyl-CoA hydratase  35.43 
 
 
259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3188  enoyl-CoA hydratase  34 
 
 
262 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485173  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0222  enoyl-CoA hydratase  36 
 
 
253 aa  135  7.000000000000001e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
262 aa  135  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.36 
 
 
257 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.16 
 
 
260 aa  135  9e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.03 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.9 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  34.36 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.64 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.415627  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
265 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.77 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.36 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.77 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.35 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.09 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.77 
 
 
257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.7 
 
 
270 aa  133  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.7 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.97 
 
 
260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4448  enoyl-CoA hydratase  35.55 
 
 
274 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.519653  normal  0.153189 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.88 
 
 
259 aa  133  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 
257 aa  133  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  34.36 
 
 
257 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  31.89 
 
 
258 aa  132  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.71 
 
 
259 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2195  short chain enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 
257 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000647858  hitchhiker  0.00875803 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.09 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.83 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  34.26 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 
258 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 
254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.46 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168242  normal  0.0914474 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0628  enoyl-CoA hydratase  32.27 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.566194  normal  0.670194 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13409  enoyl-CoA hydratase echA18  38.65 
 
 
213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.52 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.25 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1741  enoyl-CoA hydratase  35.22 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0980296  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  32.81 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.88 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.85 
 
 
257 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.33 
 
 
260 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.02 
 
 
267 aa  130  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>