More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3172 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3172  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 259 aa  513  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0873  enoyl-CoA hydratase/isomerase  74.61 
 
 		 258 aa  394  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1376  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  74.9 
 
 		 259 aa  391  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.821912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1480  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  74.13 
 
 		 259 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.857901  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  73.75 
 
 		 258 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.577666  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1968  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  73.36 
 
 		 258 aa  365  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.503691  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2377  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  61 
 
 		 260 aa  316  2e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3571  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.44 
 
 		 262 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.751263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3938  short chain enoyl-CoA hydratase  42.29 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.525947 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 		 259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.76 
 
 		 269 aa  169  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  37.45 
 
 		 663 aa  166  5e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.74 
 
 		 260 aa  165  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.74 
 
 		 260 aa  164  9e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.23 
 
 		 260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.93 
 
 		 267 aa  161  8.000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  42.75 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4679  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  34.36 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  38.13 
 
 		 651 aa  159  3e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04074  conserved hypothetical protein  34.36 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.124061  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3804  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.36 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.482495 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4769  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  34.36 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00226871  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04036  hypothetical protein  34.36 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.13651  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 		 260 aa  158  7e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.98 
 
 		 260 aa  158  8e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4452  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  33.98 
 
 		 258 aa  158  8e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.69 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.98 
 
 		 260 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.93 
 
 		 260 aa  158  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.68 
 
 		 659 aa  157  1e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  43.37 
 
 		 278 aa  157  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  39.52 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4743  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  33.59 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0219065  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0918  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  37.07 
 
 		 657 aa  155  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  38.02 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.64 
 
 		 260 aa  155  7e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  36.68 
 
 		 662 aa  155  8e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.14 
 
 		 258 aa  154  9e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.3 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.64 
 
 		 260 aa  153  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  37.7 
 
 		 260 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.74 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.64 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.17 
 
 		 264 aa  152  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  36.99 
 
 		 275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.88 
 
 		 261 aa  152  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35 
 
 		 259 aa  151  8e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 		 267 aa  151  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.41 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.5 
 
 		 261 aa  149  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2951  short chain enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 		 257 aa  149  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  35.48 
 
 		 257 aa  149  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  39.29 
 
 		 263 aa  148  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  36.47 
 
 		 257 aa  148  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3107  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  35.94 
 
 		 657 aa  148  9e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  36.29 
 
 		 259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5256  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1034  short chain enoyl-CoA hydratase  38.58 
 
 		 256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0524652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  36.43 
 
 		 258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  35.27 
 
 		 662 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.88 
 
 		 662 aa  146  3e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.47 
 
 		 265 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.05 
 
 		 661 aa  145  6e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3803  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.06 
 
 		 270 aa  145  7.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.16 
 
 		 266 aa  145  8.000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000372  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.05 
 
 		 258 aa  145  9e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.616977  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.67 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.3 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.25 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0017  enoyl-CoA hydratase  37.05 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  38.52 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  38.52 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.35 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.23 
 
 		 260 aa  143  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.48 
 
 		 260 aa  143  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.02 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4352  enoyl-CoA hydratase  35.17 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5201  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.91 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492182  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  39.2 
 
 		 263 aa  142  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  39.2 
 
 		 263 aa  142  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 		 258 aa  142  4e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2475  enoyl-CoA hydratase-isomerase  37.25 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.932872 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4651  enoyl-CoA hydratase  35.59 
 
 		 258 aa  142  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4259  enoyl-CoA hydratase  35.59 
 
 		 258 aa  142  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4652  enoyl-CoA hydratase  35.59 
 
 		 258 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4420  enoyl-CoA hydratase  35.59 
 
 		 258 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1316  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.92 
 
 		 260 aa  142  6e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.200035  normal  0.304816 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  34.73 
 
 		 260 aa  142  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4761  enoyl-CoA hydratase  35.59 
 
 		 258 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.642301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4636  enoyl-CoA hydratase  35.59 
 
 		 258 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5646  enoyl-CoA hydratase  41.73 
 
 		 272 aa  142  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.906008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3284  enoyl-CoA hydratase-isomerase  36.86 
 
 		 257 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3199  enoyl-CoA hydratase  37.35 
 
 		 257 aa  141  8e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.638475  hitchhiker  0.00556832 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3660  enoyl-CoA hydratase  40.54 
 
 		 263 aa  141  9e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1857  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.78 
 
 		 270 aa  141  9e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.172746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4271  enoyl-CoA hydratase  35.17 
 
 		 258 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1799  enoyl-CoA hydratase  39.77 
 
 		 264 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>