More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4083 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4083  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 251 aa  510  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1256  enoyl-CoA hydratase/isomerase  66.4 
 
 		 253 aa  345  5e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2768  enoyl-CoA hydratase/isomerase  68.92 
 
 		 249 aa  343  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.995557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4100  enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.04 
 
 		 252 aa  296  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5948  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.83 
 
 		 253 aa  285  5e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.495615  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4780  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.41 
 
 		 256 aa  241  9e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7111  putative enoyl-CoA hydratase  50.2 
 
 		 265 aa  241  9e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.131077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17620  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  51.6 
 
 		 252 aa  240  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1912  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.03 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.83 
 
 		 271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3602  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.22 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0475224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1691  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.84 
 
 		 260 aa  205  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5249  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.09 
 
 		 273 aa  189  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3275  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.45 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0368  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.19 
 
 		 253 aa  139  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  33.86 
 
 		 257 aa  119  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5646  enoyl-CoA hydratase  34 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.906008 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.85 
 
 		 263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0149  short chain enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 		 266 aa  115  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.227059  normal  0.14158 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0299  enoyl-CoA hydratase  32.55 
 
 		 260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05574  enoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.116145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1088  enoyl-CoA hydratase  32.8 
 
 		 268 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.571609  normal  0.014432 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5130  enoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 		 268 aa  111  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.757985  normal  0.786684 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4763  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.52 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254643  normal  0.582812 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4064  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.32 
 
 		 259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0816295  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5509  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.11 
 
 		 265 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1670  enoyl-CoA hydratase  31.5 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141752 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5352  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.11 
 
 		 265 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0902  enoyl-CoA hydratase  31.76 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  29.02 
 
 		 659 aa  107  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001548  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  31.62 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1400  enoyl-CoA hydratase  31.89 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0459  methylmalonyl-CoA decarboxylase  33.6 
 
 		 269 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0938  methylmalonyl-CoA decarboxylase  33.6 
 
 		 269 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  27.56 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35 
 
 		 254 aa  105  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  31.6 
 
 		 259 aa  105  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  30.61 
 
 		 261 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4260  enoyl-CoA hydratase  30.43 
 
 		 256 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0900  methylmalonyl-CoA decarboxylase  34.63 
 
 		 269 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.95 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  30.8 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1374  enoyl-CoA hydratase  31.64 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0833135  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4775  enoyl-CoA hydratase  32.55 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3571  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.89 
 
 		 262 aa  102  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.751263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1515  enoyl-CoA hydratase  30.98 
 
 		 260 aa  102  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0829  enoyl-CoA hydratase  30.98 
 
 		 257 aa  102  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2787  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.68 
 
 		 258 aa  102  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1498  enoyl-CoA hydratase  29.92 
 
 		 257 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1492  enoyl-CoA hydratase  29.92 
 
 		 257 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3560  enoyl-CoA hydratase  31.01 
 
 		 261 aa  102  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal  0.681353 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54640  enoyl-CoA hydratase  32.16 
 
 		 272 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194737  hitchhiker  0.0000224926 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1528  enoyl-CoA hydratase  29.92 
 
 		 257 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.27 
 
 		 260 aa  101  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2853  enoyl-CoA hydratase  29.92 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000407618 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  33.07 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0248  enoyl-CoA hydratase  32.8 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.68 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1378  methylmalonyl-CoA decarboxylase  31.56 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1940  enoyl-CoA hydratase  29.53 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2131  enoyl-CoA hydratase  29.46 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.540792  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  30.8 
 
 		 264 aa  99.8  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.34 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0652  enoyl-CoA hydratase  30.31 
 
 		 261 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.572722  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0804  enoyl-CoA hydratase  30.31 
 
 		 261 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0540  enoyl-CoA hydratase  30.31 
 
 		 261 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05485  enoyl-CoA hydratase  29.76 
 
 		 262 aa  99.4  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0469  enoyl-CoA hydratase  30.31 
 
 		 261 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2054  enoyl-CoA hydratase  30.31 
 
 		 261 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577425  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1606  enoyl-CoA hydratase  30.31 
 
 		 261 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1957  enoyl-CoA hydratase  30.31 
 
 		 261 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4090  enoyl-CoA hydratase  32.66 
 
 		 265 aa  99.4  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.157339  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3977  enoyl-CoA hydratase  32.66 
 
 		 265 aa  99.4  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1611  methylmalonyl-CoA decarboxylase  30.83 
 
 		 271 aa  99.4  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4040  methylmalonyl-CoA decarboxylase  32.4 
 
 		 269 aa  99.4  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.642217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0718  enoyl-CoA hydratase  30.8 
 
 		 263 aa  99  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471174  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3660  enoyl-CoA hydratase  30.8 
 
 		 263 aa  99.4  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.97 
 
 		 259 aa  99.4  6e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3199  enoyl-CoA hydratase  29.76 
 
 		 257 aa  99  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.638475  hitchhiker  0.00556832 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13550  enoyl-CoA hydratase  30.86 
 
 		 303 aa  99  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  33.87 
 
 		 260 aa  98.6  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0341  enoyl-CoA hydratase  29.25 
 
 		 268 aa  98.6  8e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.87 
 
 		 260 aa  98.6  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1663  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.89 
 
 		 367 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.283423 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  30.74 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2907  enoyl-CoA hydratase  32.17 
 
 		 271 aa  98.2  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4632  enoyl-CoA hydratase  26.95 
 
 		 258 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0403181  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2620  enoyl-CoA hydratase  30.74 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124427  normal  0.0671536 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01705  enoyl-CoA hydratase  31.6 
 
 		 265 aa  98.2  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.834387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0603  enoyl-CoA hydratase  26.95 
 
 		 258 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  26.17 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2780  enoyl-CoA hydratase  29.37 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1476  enoyl-CoA hydratase  30.95 
 
 		 257 aa  97.1  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0195033 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  29.96 
 
 		 263 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.49 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0310  enoyl-CoA hydratase  28.35 
 
 		 268 aa  96.7  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  25.98 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1857  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.96 
 
 		 270 aa  96.7  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.172746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>