More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3602 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_3602  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
260 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0475224  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1912  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  82.69 
 
 
260 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1691  enoyl-CoA hydratase/isomerase  87.31 
 
 
260 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  76.45 
 
 
271 aa  384  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52559  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7111  putative enoyl-CoA hydratase  68.77 
 
 
265 aa  346  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.131077  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3275  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.81 
 
 
269 aa  246  3e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4100  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.58 
 
 
252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050755  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5948  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.62 
 
 
253 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.495615  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5249  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.85 
 
 
273 aa  223  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1256  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.62 
 
 
253 aa  215  5.9999999999999996e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291293  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4083  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.22 
 
 
251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2768  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.48 
 
 
249 aa  206  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.995557  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17620  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  46.48 
 
 
252 aa  205  7e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4780  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.68 
 
 
256 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0368  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.18 
 
 
253 aa  175  8e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  38.02 
 
 
661 aa  145  9e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.46 
 
 
263 aa  145  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  35.98 
 
 
662 aa  142  6e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  34.13 
 
 
259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  35.71 
 
 
662 aa  135  9e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.96 
 
 
662 aa  134  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3831  enoyl-CoA hydratase  36.08 
 
 
258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.36 
 
 
659 aa  132  3.9999999999999996e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0962  enoyl-CoA hydratase  34.48 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.663833 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  37.7 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4688  enoyl-CoA hydratase  34.47 
 
 
261 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.484689  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
260 aa  126  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0310  enoyl-CoA hydratase  34.21 
 
 
268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
262 aa  125  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.346332 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3560  enoyl-CoA hydratase  35.6 
 
 
261 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal  0.681353 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.05 
 
 
251 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2066  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.32 
 
 
273 aa  124  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2927  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.47 
 
 
273 aa  122  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5085  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.03 
 
 
249 aa  122  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  31.09 
 
 
663 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2620  enoyl-CoA hydratase  32.32 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124427  normal  0.0671536 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  34.1 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.96 
 
 
253 aa  120  3e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1464  enoyl-CoA hydratase  36.29 
 
 
262 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.18 
 
 
256 aa  120  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0473  enoyl-CoA hydratase  33.85 
 
 
260 aa  119  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5972  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.1 
 
 
261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3571  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.05 
 
 
262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.751263  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.27 
 
 
261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0804  enoyl-CoA hydratase  34.63 
 
 
261 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0469  enoyl-CoA hydratase  34.63 
 
 
261 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2054  enoyl-CoA hydratase  34.63 
 
 
261 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0652  enoyl-CoA hydratase  34.63 
 
 
261 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.572722  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0540  enoyl-CoA hydratase  34.63 
 
 
261 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1957  enoyl-CoA hydratase  34.63 
 
 
261 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1606  enoyl-CoA hydratase  34.63 
 
 
261 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0113  enoyl-CoA hydratase  36.12 
 
 
262 aa  118  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.831408  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1346  enoyl-CoA hydratase  35.91 
 
 
288 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577541  normal  0.0344191 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.34 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3042  enoyl-CoA hydratase  34.75 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.421055  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.5 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.27 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  31.75 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.41 
 
 
260 aa  116  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.85 
 
 
274 aa  117  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.41 
 
 
265 aa  116  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.28 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  32.28 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.58 
 
 
271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.72 
 
 
258 aa  116  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490651  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3761  enoyl-CoA hydratase  34.36 
 
 
260 aa  115  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  0.940889 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 
257 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 
257 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 
257 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.72 
 
 
651 aa  115  6e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0341  enoyl-CoA hydratase  32.33 
 
 
268 aa  115  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  32.95 
 
 
264 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  32.02 
 
 
265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.68 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2905  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.06 
 
 
256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.433912  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.55 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  34.52 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.56 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0684  methylmalonyl-CoA decarboxylase  31.17 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0753206  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4260  enoyl-CoA hydratase  34.38 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0949  enoyl-CoA hydratase  34.24 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362092  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.31 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4159  enoyl-CoA hydratase  32.43 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.965459  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  35 
 
 
260 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  32.18 
 
 
264 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.19 
 
 
263 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5267  enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 
265 aa  113  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0740  enoyl-CoA hydratase  36.55 
 
 
261 aa  113  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.58 
 
 
271 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0696  methylmalonyl-CoA decarboxylase  30.36 
 
 
259 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000012263 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.68 
 
 
261 aa  112  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5229  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.73 
 
 
277 aa  112  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164951  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.02 
 
 
260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.19 
 
 
263 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
263 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.39 
 
 
268 aa  112  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  34.91 
 
 
275 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>