More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5229 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5229  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
277 aa  546  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164951  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  39.62 
 
 
258 aa  159  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  38.91 
 
 
258 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  38.91 
 
 
258 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.21 
 
 
261 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2207  enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 
265 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130556  hitchhiker  0.0060069 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.72 
 
 
260 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.02 
 
 
263 aa  149  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.94 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 
263 aa  145  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.16 
 
 
659 aa  145  7.0000000000000006e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2719  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  34.11 
 
 
270 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345596  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2452  enoyl-CoA hydratase  34.11 
 
 
270 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00421789  hitchhiker  0.00869543 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.88 
 
 
260 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  35.23 
 
 
260 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.08 
 
 
260 aa  142  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  37.93 
 
 
260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4537  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 
261 aa  139  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.049531  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2787  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.82 
 
 
258 aa  139  7e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.71 
 
 
260 aa  139  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  40.38 
 
 
267 aa  138  8.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4351  enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 
282 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.27 
 
 
269 aa  138  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0149  short chain enoyl-CoA hydratase  41.22 
 
 
266 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.227059  normal  0.14158 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  34.73 
 
 
259 aa  137  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33170  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  36.72 
 
 
251 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.119109  normal  0.701419 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  34.88 
 
 
260 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.43 
 
 
268 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36 
 
 
267 aa  136  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.93 
 
 
264 aa  136  4e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  37.6 
 
 
263 aa  136  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.46 
 
 
260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  33.85 
 
 
257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  31.39 
 
 
280 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.39 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  31.62 
 
 
280 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3232  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
274 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0265787  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  37.26 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2882  enoyl-CoA hydratase  31.78 
 
 
270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785241  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.68 
 
 
259 aa  133  3e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.5 
 
 
257 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1993  enoyl-CoA hydratase  35.36 
 
 
294 aa  132  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2069  enoyl-CoA hydratase  32.69 
 
 
270 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0197302  normal  0.0807955 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.07 
 
 
258 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  38.02 
 
 
256 aa  132  7.999999999999999e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  33.08 
 
 
263 aa  132  7.999999999999999e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.13 
 
 
260 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40980  enoyl-CoA hydratase  32.17 
 
 
270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.77 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2936  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.71 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2344  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.88 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2805  enoyl-CoA hydratase  34.32 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.46 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  31.25 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3481  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.78 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4763  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.47 
 
 
265 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254643  normal  0.582812 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.74 
 
 
260 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.85 
 
 
253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2051  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 
260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0043215  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.74 
 
 
257 aa  129  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1841  enoyl-CoA hydratase  31.13 
 
 
270 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.33 
 
 
265 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3475  enoyl-CoA hydratase  32.17 
 
 
270 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.02 
 
 
259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0222  enoyl-CoA hydratase  36.06 
 
 
253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.85 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  32.57 
 
 
262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1754  enoyl-CoA hydratase  35.91 
 
 
276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4064  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.32 
 
 
259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0816295  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.4 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  35.41 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  35.88 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1524  short chain enoyl-CoA hydratase  33.72 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  31.7 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1820  enoyl-CoA hydratase  35.52 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  37.26 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0858  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.83 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.229661  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3803  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.6 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5352  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.69 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1773  enoyl-CoA hydratase  35.52 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.95 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5509  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.69 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2455  enoyl-CoA hydratase  37.12 
 
 
265 aa  126  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00942261  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  37.89 
 
 
261 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.64 
 
 
260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  37.11 
 
 
261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.83 
 
 
257 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.181739  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17850  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 
265 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4306  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 
258 aa  125  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1538  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.23 
 
 
255 aa  125  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.2 
 
 
269 aa  125  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  34.63 
 
 
260 aa  125  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5520  enoyl-CoA hydratase  35.41 
 
 
275 aa  125  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.181326 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0590  short chain enoyl-CoA hydratase  36 
 
 
262 aa  125  7e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13550  enoyl-CoA hydratase  34.38 
 
 
303 aa  125  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  32.96 
 
 
258 aa  125  8.000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>