More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3232 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_3232  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
274 aa  564  1e-160  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0265787  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  46.89 
 
 
280 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  46.72 
 
 
280 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  46.52 
 
 
270 aa  248  5e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2882  enoyl-CoA hydratase  44.61 
 
 
270 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785241  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1890  enoyl-CoA hydratase  45.7 
 
 
270 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96141  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1841  enoyl-CoA hydratase  46.15 
 
 
270 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2069  enoyl-CoA hydratase  43.33 
 
 
270 aa  236  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0197302  normal  0.0807955 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40980  enoyl-CoA hydratase  42.59 
 
 
270 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3475  enoyl-CoA hydratase  42.22 
 
 
270 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2719  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  43.12 
 
 
270 aa  229  5e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345596  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3320  enoyl-CoA hydratase  43.75 
 
 
273 aa  227  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.178125  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2452  enoyl-CoA hydratase  42.75 
 
 
270 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00421789  hitchhiker  0.00869543 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2497  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.7 
 
 
967 aa  223  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126013  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2737  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.51 
 
 
275 aa  216  2.9999999999999998e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396573  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22630  enoyl-CoA hydratase  44.16 
 
 
287 aa  211  7.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5367  enoyl-CoA hydratase  43.43 
 
 
271 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5074  enoyl-CoA hydratase  43.43 
 
 
271 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1507  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.28 
 
 
281 aa  211  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.415213  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4986  enoyl-CoA hydratase  43.43 
 
 
271 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.906298  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0249  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.78 
 
 
286 aa  201  8e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.282458  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13808  enoyl-CoA hydratase  43.17 
 
 
274 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0373672  normal  0.457515 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1193  enoyl-CoA hydratase  41.7 
 
 
273 aa  196  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.473701  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.28 
 
 
291 aa  196  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.360826  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  35.82 
 
 
279 aa  196  4.0000000000000005e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2168  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.43 
 
 
284 aa  195  9e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2008  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 
276 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5613  enoyl-CoA hydratase  40.51 
 
 
274 aa  192  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.333814  normal  0.841372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2691  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.07 
 
 
277 aa  190  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.19 
 
 
284 aa  187  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28497  delta-3,5-delta-2,4-dienoyl-CoA isomerase  40.15 
 
 
291 aa  182  6e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5512  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.77 
 
 
286 aa  181  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02529  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G14520)  35.02 
 
 
280 aa  171  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.221324  normal  0.697318 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1699  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.97 
 
 
280 aa  171  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  38.93 
 
 
258 aa  169  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3216  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.93 
 
 
283 aa  168  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.987087  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16135  predicted protein  39.47 
 
 
278 aa  167  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.85 
 
 
659 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  36.94 
 
 
263 aa  159  3e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  35.64 
 
 
260 aa  158  8e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.06 
 
 
260 aa  158  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.03 
 
 
259 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  32.09 
 
 
662 aa  156  3e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4537  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.9 
 
 
261 aa  156  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.049531  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.33 
 
 
662 aa  155  6e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.53 
 
 
263 aa  155  9e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  35.5 
 
 
260 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 
263 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.79 
 
 
260 aa  152  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.93 
 
 
260 aa  152  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  31.58 
 
 
663 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3042  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.93 
 
 
259 aa  152  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  32.09 
 
 
662 aa  151  1e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.69 
 
 
661 aa  150  3e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1904  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.19 
 
 
264 aa  149  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.302321  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0328  hypothetical protein  33.08 
 
 
261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.74 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.58 
 
 
260 aa  145  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 
259 aa  145  8.000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.31 
 
 
268 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.19 
 
 
259 aa  144  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.19 
 
 
264 aa  145  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0643  short chain enoyl-CoA hydratase  32.48 
 
 
265 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0226779  normal  0.0998873 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
262 aa  143  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.48 
 
 
258 aa  143  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  34.87 
 
 
258 aa  143  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  34.2 
 
 
257 aa  142  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  34.56 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.21 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.58 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.84 
 
 
260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.44 
 
 
259 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
261 aa  139  6e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.47 
 
 
260 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0388  enoyl-CoA hydratase  34.18 
 
 
275 aa  137  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165934  unclonable  0.000000000539782 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.47 
 
 
259 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0918  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  32.32 
 
 
657 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  32.44 
 
 
262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.35 
 
 
260 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3537  enoyl-CoA hydratase  33.71 
 
 
263 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50917e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3322  enoyl-CoA hydratase  33.71 
 
 
263 aa  136  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3285  enoyl-CoA hydratase  33.71 
 
 
263 aa  136  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000573094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3583  enoyl-CoA hydratase  33.71 
 
 
263 aa  136  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3237  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
263 aa  135  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  30.48 
 
 
259 aa  135  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2051  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 
260 aa  136  5e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0043215  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  31.85 
 
 
257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.31 
 
 
269 aa  135  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0895373 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.58 
 
 
258 aa  135  9e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.37 
 
 
265 aa  135  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  30.63 
 
 
651 aa  134  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  33.83 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  31.16 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4271  enoyl-CoA hydratase  32.22 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  31.27 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.6 
 
 
271 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.6 
 
 
260 aa  133  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4651  enoyl-CoA hydratase  32.22 
 
 
258 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0603  enoyl-CoA hydratase  31.85 
 
 
258 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>