More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2737 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2737  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 275 aa  547  1e-155  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396573  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1193  enoyl-CoA hydratase  74.17 
 
 		 273 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.473701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5613  enoyl-CoA hydratase  72.79 
 
 		 274 aa  381  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.333814  normal  0.841372 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13808  enoyl-CoA hydratase  71.32 
 
 		 274 aa  376  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0373672  normal  0.457515 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5367  enoyl-CoA hydratase  71.22 
 
 		 271 aa  371  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4986  enoyl-CoA hydratase  71.22 
 
 		 271 aa  371  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.906298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5074  enoyl-CoA hydratase  71.22 
 
 		 271 aa  371  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22630  enoyl-CoA hydratase  68.28 
 
 		 287 aa  339  2.9999999999999998e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1507  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.49 
 
 		 281 aa  256  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.415213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2069  enoyl-CoA hydratase  48.9 
 
 		 270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0197302  normal  0.0807955 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  48.13 
 
 		 270 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  48.51 
 
 		 280 aa  245  6e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  48.13 
 
 		 280 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2452  enoyl-CoA hydratase  45.52 
 
 		 270 aa  241  9e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00421789  hitchhiker  0.00869543 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3475  enoyl-CoA hydratase  47.43 
 
 		 270 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40980  enoyl-CoA hydratase  46.32 
 
 		 270 aa  238  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2719  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  44.78 
 
 		 270 aa  235  7e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345596  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2882  enoyl-CoA hydratase  44.4 
 
 		 270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785241  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1841  enoyl-CoA hydratase  47.01 
 
 		 270 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3320  enoyl-CoA hydratase  42.96 
 
 		 273 aa  232  5e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.178125  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3232  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.51 
 
 		 274 aa  227  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0265787  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2008  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.15 
 
 		 276 aa  221  8e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1890  enoyl-CoA hydratase  41.91 
 
 		 270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96141  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.15 
 
 		 284 aa  216  5e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2497  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.19 
 
 		 967 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126013  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2168  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.63 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.35 
 
 		 291 aa  204  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.360826  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1699  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.75 
 
 		 280 aa  203  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  37.83 
 
 		 279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0249  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.81 
 
 		 286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.282458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3216  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.89 
 
 		 283 aa  198  7e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.987087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5512  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.78 
 
 		 286 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2691  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.6 
 
 		 277 aa  193  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02529  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G14520)  38.1 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.221324  normal  0.697318 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28497  delta-3,5-delta-2,4-dienoyl-CoA isomerase  40.46 
 
 		 291 aa  170  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16135  predicted protein  41.54 
 
 		 278 aa  166  4e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0145  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.78 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02600  conserved hypothetical protein  39.01 
 
 		 253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.563575  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  31.37 
 
 		 659 aa  128  8.000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.21 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4733  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.09 
 
 		 258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.23 
 
 		 262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.7 
 
 		 255 aa  125  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.63 
 
 		 251 aa  125  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1968  short chain enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.25 
 
 		 264 aa  123  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  35.09 
 
 		 257 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  33.45 
 
 		 261 aa  122  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.29 
 
 		 267 aa  123  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.08 
 
 		 271 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 		 263 aa  122  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  32.47 
 
 		 267 aa  122  7e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4829  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.82 
 
 		 270 aa  122  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  38.17 
 
 		 263 aa  122  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1966  enoyl-CoA hydratase  36.67 
 
 		 270 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.231207  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0918  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  31.03 
 
 		 657 aa  121  9e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2277  enoyl-CoA hydratase  31.05 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.62 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  30 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1904  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.95 
 
 		 264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.302321  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.83 
 
 		 254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.11 
 
 		 260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4537  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.73 
 
 		 261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.049531  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.8 
 
 		 797 aa  119  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0858  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.43 
 
 		 264 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.229661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  33.7 
 
 		 261 aa  119  7e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0328  hypothetical protein  28.99 
 
 		 261 aa  119  7e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2136  enoyl-CoA hydratase  34.5 
 
 		 260 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.259318  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3284  enoyl-CoA hydratase  33.1 
 
 		 277 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.09 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  30.12 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.68 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  29.74 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4064  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0816295  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5431  enoyl-CoA hydratase  34.29 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  32.8 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.74 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2693  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.53 
 
 		 313 aa  116  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5229  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.96 
 
 		 277 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 		 261 aa  116  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.44 
 
 		 271 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0502  enoyl-CoA hydratase  35.88 
 
 		 268 aa  116  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  36.86 
 
 		 264 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.06 
 
 		 271 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  31.78 
 
 		 258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  28.36 
 
 		 663 aa  116  5e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2539  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.91 
 
 		 266 aa  116  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  33.83 
 
 		 260 aa  116  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.96 
 
 		 269 aa  116  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0895373 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  32 
 
 		 260 aa  115  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  33.33 
 
 		 261 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3023  enoyl-CoA hydratase  30.74 
 
 		 269 aa  115  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  31.75 
 
 		 260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2864  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.03 
 
 		 257 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.28043  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  31.4 
 
 		 258 aa  115  8.999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 		 265 aa  115  8.999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  32.22 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.68 
 
 		 259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>